Protein–RNA interactions for Protein: P00533

EGFR, Epidermal growth factor receptor, humanhuman

Predictions only

Length 1,210 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EGFRP00533 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
EGFRP00533 THNSL2-202ENST00000343544 2052 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
EGFRP00533 ARF1-214ENST00000541182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
EGFRP00533 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
EGFRP00533 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
EGFRP00533 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
EGFRP00533 ACP2-206ENST00000529444 1719 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
EGFRP00533 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
EGFRP00533 TMEM270-201ENST00000320531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
EGFRP00533 NDUFB8-202ENST00000370320 684 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
EGFRP00533 TNNC2-201ENST00000372555 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
EGFRP00533 HLA-DMA-201ENST00000374843 1123 ntAPPRIS P1 BASIC20.37■□□□□ 0.85
EGFRP00533 TNNT3-204ENST00000381558 1258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
EGFRP00533 SPDYE7P-202ENST00000420373 878 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
EGFRP00533 AL645941.2-201ENST00000429234 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
EGFRP00533 SPDYE2-202ENST00000432940 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
EGFRP00533 SPDYE2B-201ENST00000436228 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
EGFRP00533 RPSAP31-202ENST00000445165 716 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
EGFRP00533 SPDYE5-201ENST00000455862 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
EGFRP00533 AL512638.1-201ENST00000457493 794 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
EGFRP00533 AL391335.1-201ENST00000504583 535 ntTSL 4 BASIC20.37■□□□□ 0.85
EGFRP00533 INS-205ENST00000512523 297 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
EGFRP00533 LACTB2-203ENST00000522447 1034 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
EGFRP00533 ALG1L8P-201ENST00000533887 760 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
EGFRP00533 AC005544.2-201ENST00000579138 229 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
EGFRP00533 AC010619.1-201ENST00000599536 675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
EGFRP00533 PDLIM3-213ENST00000629667 1016 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
EGFRP00533 AC025048.6-201ENST00000634326 1161 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
EGFRP00533 CYP4F2-201ENST00000011989 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
EGFRP00533 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
EGFRP00533 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
EGFRP00533 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
EGFRP00533 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
EGFRP00533 HYOU1-212ENST00000532519 2162 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
EGFRP00533 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
EGFRP00533 SVOPL-204ENST00000436657 1420 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
EGFRP00533 PGRMC1-202ENST00000535419 1762 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
EGFRP00533 NR1H3-202ENST00000405576 1352 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
EGFRP00533 WDR74-206ENST00000529106 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
EGFRP00533 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
EGFRP00533 HEY1-208ENST00000523976 1325 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
EGFRP00533 MYO19-225ENST00000621344 1640 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
EGFRP00533 SYCE1-202ENST00000343131 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
EGFRP00533 LCE3E-201ENST00000368789 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
EGFRP00533 C6orf52-202ENST00000379586 430 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
EGFRP00533 ITGB2-204ENST00000397846 422 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
EGFRP00533 CPLX2-206ENST00000512824 518 ntTSL 4 BASIC20.36■□□□□ 0.85
EGFRP00533 CHMP4A-204ENST00000530996 967 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
EGFRP00533 SPDYE22P-201ENST00000582158 798 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
EGFRP00533 SRP9-204ENST00000619790 377 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
EGFRP00533 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
EGFRP00533 LINC01657-201ENST00000457217 1809 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
EGFRP00533 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
EGFRP00533 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
EGFRP00533 AZI2-205ENST00000420543 1366 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
EGFRP00533 CPSF6-203ENST00000456847 1915 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
EGFRP00533 LHFPL6-201ENST00000379589 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
EGFRP00533 LMX1B-204ENST00000561065 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
EGFRP00533 AC005865.2-201ENST00000505276 2303 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
EGFRP00533 PRKAR1B-204ENST00000406797 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
EGFRP00533 ERCC1-201ENST00000013807 1278 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
EGFRP00533 GMNN-201ENST00000230056 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
EGFRP00533 VCX-202ENST00000381059 967 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
EGFRP00533 PIGZ-204ENST00000443835 675 ntTSL 4 BASIC20.35■□□□□ 0.85
EGFRP00533 SNX21-206ENST00000462307 1043 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
EGFRP00533 PTHLH-206ENST00000538310 854 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
EGFRP00533 AL596325.1-201ENST00000563991 1082 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
EGFRP00533 SNHG15-207ENST00000582727 1039 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
EGFRP00533 MIR4453-201ENST00000584019 89 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
EGFRP00533 AL662799.1-202ENST00000614205 422 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
EGFRP00533 NAPA-AS1-201ENST00000593284 1753 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
EGFRP00533 SMOC1-201ENST00000361956 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
EGFRP00533 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
EGFRP00533 REEP1-208ENST00000538924 1702 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
EGFRP00533 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
EGFRP00533 KRT28-201ENST00000306658 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
EGFRP00533 RAB5C-201ENST00000346213 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
EGFRP00533 CD14-201ENST00000302014 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
EGFRP00533 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
EGFRP00533 JMJD6-205ENST00000585429 1330 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
EGFRP00533 SCAI-202ENST00000373549 1968 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
EGFRP00533 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
EGFRP00533 AC012569.1-201ENST00000591191 1524 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
EGFRP00533 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
EGFRP00533 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
EGFRP00533 OR8S1-201ENST00000310194 1080 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
EGFRP00533 TMEM44-201ENST00000330115 1278 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
EGFRP00533 MB-201ENST00000359787 1170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
EGFRP00533 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
EGFRP00533 MB-202ENST00000397326 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
EGFRP00533 MB-203ENST00000397328 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
EGFRP00533 AC124057.1-201ENST00000433035 404 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
EGFRP00533 AGGF1-204ENST00000506806 1142 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
EGFRP00533 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
EGFRP00533 AP000842.3-202ENST00000569238 1080 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
EGFRP00533 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
EGFRP00533 LINC02167-203ENST00000566900 1489 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
EGFRP00533 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
EGFRP00533 TEAD4-202ENST00000359864 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
EGFRP00533 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.2 ms