Protein–RNA interactions for Protein: O95487

SEC24B, Protein transport protein Sec24B, humanhuman

Predictions only

Length 1,268 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEC24BO95487 YTHDF1-202ENST00000370339 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SEC24BO95487 P2RX5-209ENST00000552276 1642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
SEC24BO95487 ZNF296-202ENST00000622376 1631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SEC24BO95487 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SEC24BO95487 PLPPR2-201ENST00000251473 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SEC24BO95487 CDC42EP4-201ENST00000335793 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SEC24BO95487 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SEC24BO95487 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
SEC24BO95487 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC21.05■□□□□ 0.96
SEC24BO95487 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SEC24BO95487 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
SEC24BO95487 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
SEC24BO95487 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SEC24BO95487 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
SEC24BO95487 FGFR1OP2-206ENST00000546072 956 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SEC24BO95487 AC005336.2-201ENST00000593183 939 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
SEC24BO95487 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SEC24BO95487 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
SEC24BO95487 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
SEC24BO95487 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SEC24BO95487 HSPA1A-202ENST00000608703 1909 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
SEC24BO95487 PLAGL1-211ENST00000625622 3216 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
SEC24BO95487 POLD4-205ENST00000529704 1486 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
SEC24BO95487 DZIP1L-204ENST00000469243 2107 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
SEC24BO95487 ADD1-205ENST00000398125 4079 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
SEC24BO95487 TMEM198B-203ENST00000482378 2230 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SEC24BO95487 FAM104A-202ENST00000405159 2865 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SEC24BO95487 TMC4-209ENST00000617472 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SEC24BO95487 RANBP3-220ENST00000591092 1783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SEC24BO95487 GPR176-205ENST00000561100 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SEC24BO95487 PSME3-202ENST00000441946 2944 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
SEC24BO95487 ROBO3-221ENST00000543966 1520 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SEC24BO95487 GATA3-201ENST00000346208 2654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SEC24BO95487 CACFD1-202ENST00000316948 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SEC24BO95487 TMEM138-201ENST00000278826 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SEC24BO95487 ALOX12P2-203ENST00000570921 1945 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
SEC24BO95487 ELMO1-209ENST00000448602 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SEC24BO95487 RFWD2-204ENST00000367669 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SEC24BO95487 SULT2B1-201ENST00000201586 1295 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SEC24BO95487 ZNF414-201ENST00000255616 1178 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SEC24BO95487 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SEC24BO95487 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
SEC24BO95487 AP001625.2-201ENST00000442605 575 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
SEC24BO95487 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SEC24BO95487 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
SEC24BO95487 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
SEC24BO95487 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
SEC24BO95487 AC244517.3-201ENST00000616254 1235 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
SEC24BO95487 LRRC23-215ENST00000622489 1061 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
SEC24BO95487 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SEC24BO95487 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
SEC24BO95487 SDCBP2-204ENST00000381812 1550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
SEC24BO95487 AL135999.2-201ENST00000622438 1686 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
SEC24BO95487 KLHDC8B-201ENST00000332780 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SEC24BO95487 ONECUT1-201ENST00000305901 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SEC24BO95487 VCAN-204ENST00000502527 2087 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SEC24BO95487 WDR45B-201ENST00000392325 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SEC24BO95487 SURF4-207ENST00000545297 2863 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
SEC24BO95487 MIOS-202ENST00000405785 3095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
SEC24BO95487 EIF4ENIF1-206ENST00000397525 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SEC24BO95487 SEPT9-202ENST00000423034 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SEC24BO95487 RALGDS-205ENST00000393160 3801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SEC24BO95487 WDR81-204ENST00000419248 3315 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
SEC24BO95487 SLC37A4-217ENST00000545985 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
SEC24BO95487 ZFP90-203ENST00000563169 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SEC24BO95487 AC092143.3-201ENST00000565150 1900 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
SEC24BO95487 HOXC5-201ENST00000312492 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SEC24BO95487 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
SEC24BO95487 CRY1-201ENST00000008527 3267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
SEC24BO95487 ZNF672-201ENST00000306562 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
SEC24BO95487 PLBD2-201ENST00000280800 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
SEC24BO95487 VOPP1-207ENST00000428648 2866 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
SEC24BO95487 TPD52L2-201ENST00000217121 2362 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
SEC24BO95487 RUSC1-201ENST00000292254 2163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
SEC24BO95487 ELFN2-208ENST00000430883 1970 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
SEC24BO95487 ARL6IP1-201ENST00000304414 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
SEC24BO95487 NR2C2-201ENST00000323373 2406 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
SEC24BO95487 COQ8B-202ENST00000324464 2443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
SEC24BO95487 F7-201ENST00000346342 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
SEC24BO95487 UAP1L1-202ENST00000409858 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
SEC24BO95487 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
SEC24BO95487 RPA2-202ENST00000373909 1162 ntTSL 3 BASIC21.03■□□□□ 0.96
SEC24BO95487 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
SEC24BO95487 MPP1-202ENST00000369534 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
SEC24BO95487 LSP1-202ENST00000381775 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
SEC24BO95487 SPRED2-206ENST00000443619 1800 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
SEC24BO95487 REEP1-208ENST00000538924 1702 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
SEC24BO95487 FOXRED2-203ENST00000397223 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
SEC24BO95487 GPRC5B-201ENST00000300571 5213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
SEC24BO95487 EDC3-202ENST00000426797 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
SEC24BO95487 SMC4-201ENST00000344722 5356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
SEC24BO95487 KEAP1-201ENST00000171111 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
SEC24BO95487 ACSS1-201ENST00000323482 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
SEC24BO95487 ZFAND5-204ENST00000376960 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
SEC24BO95487 TRIM60-203ENST00000508504 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
SEC24BO95487 PTPN20-203ENST00000374342 1929 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
SEC24BO95487 FIGNL2-201ENST00000564840 4693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
SEC24BO95487 PRMT6-201ENST00000370078 2616 ntAPPRIS P1 BASIC21.02■□□□□ 0.96
SEC24BO95487 ZNF764-202ENST00000395091 2970 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
SEC24BO95487 PI16-201ENST00000373674 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.3 ms