Protein–RNA interactions for Protein: O95428

PAPLN, Papilin, humanhuman

Predictions only

Length 1,278 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PAPLNO95428 ZNF133-210ENST00000535822 2341 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
PAPLNO95428 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PAPLNO95428 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
PAPLNO95428 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PAPLNO95428 LRRC42-201ENST00000319223 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PAPLNO95428 ATP6V1E1-201ENST00000253413 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PAPLNO95428 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PAPLNO95428 AC090206.1-201ENST00000615734 1678 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PAPLNO95428 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PAPLNO95428 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PAPLNO95428 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PAPLNO95428 FAM86DP-207ENST00000497543 2152 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PAPLNO95428 SAMD11-214ENST00000618323 2159 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PAPLNO95428 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PAPLNO95428 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PAPLNO95428 GTDC1-219ENST00000542155 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PAPLNO95428 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PAPLNO95428 LINC01657-201ENST00000457217 1809 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PAPLNO95428 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PAPLNO95428 NUDT4P1-201ENST00000322209 1206 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PAPLNO95428 HNRNPFP1-201ENST00000391730 1133 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
PAPLNO95428 PMS2P4-201ENST00000412466 1052 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
PAPLNO95428 AC104135.1-201ENST00000418001 763 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PAPLNO95428 TAF8-206ENST00000472818 719 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PAPLNO95428 VASH2-211ENST00000517399 1068 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PAPLNO95428 DUX4L17-201ENST00000557360 1267 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
PAPLNO95428 CD7-202ENST00000578509 925 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PAPLNO95428 GMFG-207ENST00000598034 1028 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PAPLNO95428 AC239800.4-201ENST00000603712 296 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
PAPLNO95428 AC108010.1-201ENST00000605862 1107 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PAPLNO95428 CLN3-246ENST00000636228 1224 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PAPLNO95428 RAB34-224ENST00000636513 888 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PAPLNO95428 MTERF2-201ENST00000240050 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PAPLNO95428 SMOC1-201ENST00000361956 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PAPLNO95428 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PAPLNO95428 MTMR12-201ENST00000264934 2215 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PAPLNO95428 REEP1-208ENST00000538924 1702 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PAPLNO95428 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PAPLNO95428 MAP3K13-212ENST00000448876 1681 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PAPLNO95428 GABRB1-201ENST00000295454 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PAPLNO95428 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PAPLNO95428 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PAPLNO95428 GPANK1-202ENST00000375895 1800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PAPLNO95428 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PAPLNO95428 SFN-201ENST00000339276 1320 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PAPLNO95428 TUBB3P1-201ENST00000405796 1332 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
PAPLNO95428 TRIP6-209ENST00000619988 1303 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PAPLNO95428 RAB17-201ENST00000264601 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PAPLNO95428 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PAPLNO95428 PNMA6E-201ENST00000445091 2192 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PAPLNO95428 PPT2-246ENST00000375137 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PAPLNO95428 COPE-202ENST00000349893 948 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PAPLNO95428 OSTC-201ENST00000361564 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PAPLNO95428 TCEAL3-203ENST00000372628 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PAPLNO95428 LRRC37A5P-201ENST00000374304 1103 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PAPLNO95428 GUK1-210ENST00000391865 990 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PAPLNO95428 NDUFAF3-203ENST00000395458 808 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PAPLNO95428 WRB-204ENST00000398753 699 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PAPLNO95428 KRT18P32-201ENST00000424695 1287 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
PAPLNO95428 AL732437.1-201ENST00000442008 595 ntTSL 4 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PAPLNO95428 CCDC159-201ENST00000458408 1062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PAPLNO95428 LINC02242-201ENST00000507298 641 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PAPLNO95428 GLI4-207ENST00000521682 1082 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PAPLNO95428 SMCO4-204ENST00000527149 472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PAPLNO95428 AC091053.1-201ENST00000529883 744 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PAPLNO95428 COX5A-203ENST00000564811 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PAPLNO95428 TMEM88-202ENST00000574668 510 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PAPLNO95428 AC067852.1-201ENST00000585572 594 ntTSL 4 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PAPLNO95428 LINC00466-208ENST00000635218 1217 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PAPLNO95428 BORCS8-203ENST00000477565 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PAPLNO95428 LSP1-201ENST00000311604 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PAPLNO95428 HYAL3-207ENST00000621157 1696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PAPLNO95428 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PAPLNO95428 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PAPLNO95428 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PAPLNO95428 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PAPLNO95428 TMEM143-202ENST00000377431 1960 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PAPLNO95428 USP3-AS1-201ENST00000558831 1784 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PAPLNO95428 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PAPLNO95428 PSRC1-204ENST00000369909 1742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PAPLNO95428 BPGM-203ENST00000418040 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PAPLNO95428 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PAPLNO95428 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PAPLNO95428 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PAPLNO95428 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PAPLNO95428 TMEM41A-201ENST00000296254 1060 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PAPLNO95428 RESP18-201ENST00000333527 795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PAPLNO95428 XAGE1A-203ENST00000375602 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PAPLNO95428 XAGE1B-203ENST00000375616 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PAPLNO95428 AC016735.2-201ENST00000438736 569 ntTSL 4 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PAPLNO95428 SPDYE14P-201ENST00000442619 822 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
PAPLNO95428 KLF2P3-201ENST00000451977 1087 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
PAPLNO95428 AC190387.1-201ENST00000551683 408 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
PAPLNO95428 AC104985.1-201ENST00000587528 507 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PAPLNO95428 FOSB-211ENST00000592436 1057 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PAPLNO95428 AC011491.2-201ENST00000599584 447 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PAPLNO95428 FAM153A-203ENST00000440605 1966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PAPLNO95428 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PAPLNO95428 MYBPH-202ENST00000621380 1772 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PAPLNO95428 LHFPL6-201ENST00000379589 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.7 ms