Protein–RNA interactions for Protein: O60613

SELENOF, Selenoprotein F, humanhuman

Predictions only

Length 162 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SELENOFO60613 GIMAP1-201ENST00000307194 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SELENOFO60613 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SELENOFO60613 SSSCA1-201ENST00000309328 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SELENOFO60613 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SELENOFO60613 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SELENOFO60613 PON3-205ENST00000451904 1053 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SELENOFO60613 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SELENOFO60613 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SELENOFO60613 AC109462.3-201ENST00000573934 613 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
SELENOFO60613 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SELENOFO60613 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SELENOFO60613 AC019129.2-201ENST00000609837 1235 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
SELENOFO60613 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SELENOFO60613 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
SELENOFO60613 ZMYM3-203ENST00000373981 1841 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SELENOFO60613 EWSR1-203ENST00000332050 2552 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SELENOFO60613 C16orf71-204ENST00000590191 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SELENOFO60613 YIF1B-204ENST00000392124 1404 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SELENOFO60613 TOM1-210ENST00000449058 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SELENOFO60613 LZTS3-202ENST00000337576 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SELENOFO60613 BRD2-201ENST00000374825 4894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SELENOFO60613 SHOX-204ENST00000554971 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SELENOFO60613 SLC5A2-201ENST00000330498 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SELENOFO60613 CES3-203ENST00000543856 3178 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SELENOFO60613 TNK2-AS1-201ENST00000458180 2096 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SELENOFO60613 RECQL4-210ENST00000621189 3896 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SELENOFO60613 SLC52A1-202ENST00000424747 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SELENOFO60613 SLC8A3-202ENST00000356921 5250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SELENOFO60613 SLC10A3-203ENST00000393586 1893 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SELENOFO60613 AP1S2-201ENST00000329235 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SELENOFO60613 ARHGEF16-202ENST00000378373 2211 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SELENOFO60613 TAPBP-238ENST00000475304 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SELENOFO60613 DPEP3-201ENST00000268793 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SELENOFO60613 KCNJ8-201ENST00000240662 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SELENOFO60613 DIXDC1-208ENST00000615255 4825 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SELENOFO60613 INPP5B-201ENST00000373021 3934 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SELENOFO60613 PAK4-203ENST00000360442 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SELENOFO60613 ZMYND11-208ENST00000397962 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SELENOFO60613 WRAP53-203ENST00000431639 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SELENOFO60613 WRAP53-204ENST00000457584 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SELENOFO60613 HMOX2-217ENST00000619528 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SELENOFO60613 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SELENOFO60613 TSKU-205ENST00000612930 2666 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SELENOFO60613 ZNF414-202ENST00000393927 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SELENOFO60613 PRRT4-205ENST00000489835 2313 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SELENOFO60613 GABRB2-202ENST00000353437 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SELENOFO60613 ADGRB2-206ENST00000398556 4879 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SELENOFO60613 TCEAL3-201ENST00000243286 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SELENOFO60613 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SELENOFO60613 NUDT6-201ENST00000304430 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SELENOFO60613 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SELENOFO60613 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SELENOFO60613 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
SELENOFO60613 AC007967.3-201ENST00000434308 558 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
SELENOFO60613 AC012645.3-201ENST00000568506 470 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SELENOFO60613 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SELENOFO60613 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
SELENOFO60613 IL2RG-202ENST00000374188 1432 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SELENOFO60613 WBP2-201ENST00000254806 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SELENOFO60613 MOCS1-206ENST00000425303 1920 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SELENOFO60613 MAP4K3-201ENST00000263881 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SELENOFO60613 PDE1C-201ENST00000321453 2898 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SELENOFO60613 PDPK2P-201ENST00000382326 2387 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SELENOFO60613 WDR6-202ENST00000415265 1883 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SELENOFO60613 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SELENOFO60613 PTK7-202ENST00000230419 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SELENOFO60613 CHRNE-201ENST00000293780 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SELENOFO60613 LSM12-204ENST00000591247 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SELENOFO60613 OS9-205ENST00000413095 1660 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SELENOFO60613 CLDN4-201ENST00000340958 1831 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SELENOFO60613 COL8A2-202ENST00000397799 4670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SELENOFO60613 MTCL1-205ENST00000517570 6009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SELENOFO60613 EPB41-205ENST00000373797 2402 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SELENOFO60613 CSNK1A1L-201ENST00000379800 2406 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SELENOFO60613 ZNF423-206ENST00000563137 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SELENOFO60613 PHGDH-223ENST00000641597 2585 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SELENOFO60613 MAP4K3-202ENST00000341681 4271 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SELENOFO60613 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SELENOFO60613 AC105411.1-202ENST00000565050 1476 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SELENOFO60613 IL34-202ENST00000429149 1779 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SELENOFO60613 ST8SIA4-202ENST00000451528 1794 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SELENOFO60613 KIFC2-201ENST00000301332 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SELENOFO60613 GLDC-201ENST00000321612 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SELENOFO60613 KCNQ2-236ENST00000637193 2983 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SELENOFO60613 FCHO1-201ENST00000252771 3118 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SELENOFO60613 DUSP8-202ENST00000397374 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SELENOFO60613 LRRC58-201ENST00000295628 7903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SELENOFO60613 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SELENOFO60613 NOTCH2NL-201ENST00000362074 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SELENOFO60613 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SELENOFO60613 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SELENOFO60613 MGAT1-203ENST00000393340 3077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SELENOFO60613 DNMT3A-205ENST00000402667 2300 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SELENOFO60613 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
SELENOFO60613 SEPT9-202ENST00000423034 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SELENOFO60613 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
SELENOFO60613 AC092647.4-201ENST00000457211 535 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
SELENOFO60613 IGHV3-52-201ENST00000519770 353 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
SELENOFO60613 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SELENOFO60613 TRPV4-207ENST00000541794 2475 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.9 ms