Protein–RNA interactions for Protein: O43497

CACNA1G, Voltage-dependent T-type calcium channel subunit alpha-1G, humanhuman

Predictions only

Length 2,377 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA1GO43497 AC083949.1-201ENST00000422013 657 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CACNA1GO43497 AC127070.2-201ENST00000424075 555 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CACNA1GO43497 AL355140.1-201ENST00000457328 398 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CACNA1GO43497 AC083949.1-202ENST00000458490 552 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CACNA1GO43497 IQSEC2-204ENST00000485377 835 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CACNA1GO43497 ZNF789-211ENST00000493485 556 ntTSL 4 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CACNA1GO43497 IGHV3-42-201ENST00000520410 361 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
CACNA1GO43497 AC016727.1-203ENST00000603199 540 ntTSL 4 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CACNA1GO43497 AC019129.2-201ENST00000609837 1235 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
CACNA1GO43497 CDH23-212ENST00000616684 4814 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CACNA1GO43497 LMX1B-204ENST00000561065 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CACNA1GO43497 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CACNA1GO43497 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CACNA1GO43497 INTS10-201ENST00000397977 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CACNA1GO43497 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CACNA1GO43497 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CACNA1GO43497 SGF29-201ENST00000317058 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CACNA1GO43497 AL450998.2-201ENST00000418525 639 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CACNA1GO43497 TREML5P-201ENST00000421694 576 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
CACNA1GO43497 ARL6IP4-207ENST00000426960 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CACNA1GO43497 AC018730.1-201ENST00000454183 327 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CACNA1GO43497 S100A2-206ENST00000497140 697 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CACNA1GO43497 COX11-210ENST00000639671 696 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
CACNA1GO43497 SIGIRR-203ENST00000431843 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CACNA1GO43497 ADARB1-204ENST00000389863 3563 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CACNA1GO43497 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CACNA1GO43497 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CACNA1GO43497 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CACNA1GO43497 RASSF6-202ENST00000335049 1360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CACNA1GO43497 FDXR-205ENST00000544854 1827 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CACNA1GO43497 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CACNA1GO43497 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CACNA1GO43497 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CACNA1GO43497 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CACNA1GO43497 TBC1D10C-209ENST00000542590 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CACNA1GO43497 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CACNA1GO43497 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CACNA1GO43497 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CACNA1GO43497 MORN4-202ENST00000370635 419 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CACNA1GO43497 MXI1-205ENST00000393134 889 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CACNA1GO43497 FAM221A-203ENST00000409653 761 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CACNA1GO43497 FAM221A-204ENST00000409994 1136 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CACNA1GO43497 AL157871.1-202ENST00000556458 478 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CACNA1GO43497 AC243571.2-201ENST00000615265 628 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CACNA1GO43497 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CACNA1GO43497 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CACNA1GO43497 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CACNA1GO43497 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CACNA1GO43497 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CACNA1GO43497 MFSD2A-203ENST00000420632 1914 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CACNA1GO43497 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CACNA1GO43497 PRSS23-209ENST00000533902 2043 ntTSL 4 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CACNA1GO43497 GPRC5B-201ENST00000300571 5213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CACNA1GO43497 NDUFA3-201ENST00000303553 379 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CACNA1GO43497 ASB12-201ENST00000362002 1289 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CACNA1GO43497 AF274855.1-203ENST00000424126 800 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CACNA1GO43497 SGK2-207ENST00000426287 1182 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CACNA1GO43497 AC099548.2-209ENST00000480264 625 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
CACNA1GO43497 TPD52L1-214ENST00000534199 811 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CACNA1GO43497 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CACNA1GO43497 CGREF1-206ENST00000405600 1346 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CACNA1GO43497 MED25-202ENST00000538643 1623 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CACNA1GO43497 FAM234A-202ENST00000301679 1936 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CACNA1GO43497 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CACNA1GO43497 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CACNA1GO43497 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CACNA1GO43497 NOMO2-211ENST00000621364 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CACNA1GO43497 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CACNA1GO43497 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
CACNA1GO43497 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CACNA1GO43497 ABHD14B-203ENST00000395008 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CACNA1GO43497 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CACNA1GO43497 OCIAD1-204ENST00000425583 1915 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CACNA1GO43497 GMCL1P1-201ENST00000463439 1581 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
CACNA1GO43497 AC006538.1-201ENST00000567905 1585 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
CACNA1GO43497 MAP3K9-206ENST00000555993 4449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CACNA1GO43497 CGB3-201ENST00000357383 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CACNA1GO43497 CGB2-201ENST00000359342 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CACNA1GO43497 DBNDD2-205ENST00000372717 1207 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CACNA1GO43497 C6orf52-202ENST00000379586 430 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CACNA1GO43497 MRPL28-202ENST00000389675 865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CACNA1GO43497 TMEM191A-202ENST00000419950 663 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CACNA1GO43497 HHEX-203ENST00000492654 808 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CACNA1GO43497 RNF216P1-213ENST00000494947 946 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CACNA1GO43497 AC012645.3-201ENST00000568506 470 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CACNA1GO43497 AC004233.3-201ENST00000607794 1269 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
CACNA1GO43497 LINC01278-203ENST00000608788 820 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CACNA1GO43497 LINC01278-207ENST00000610234 555 ntTSL 4 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CACNA1GO43497 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CACNA1GO43497 IMP4-201ENST00000259239 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CACNA1GO43497 FGFR1-203ENST00000341462 6054 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CACNA1GO43497 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CACNA1GO43497 AC073592.3-201ENST00000625118 1834 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
CACNA1GO43497 CRB3-203ENST00000598494 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CACNA1GO43497 ZDHHC20-209ENST00000542645 5315 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CACNA1GO43497 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CACNA1GO43497 RNF157-201ENST00000269391 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CACNA1GO43497 SFT2D3-201ENST00000310981 3735 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CACNA1GO43497 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CACNA1GO43497 CLIC6-201ENST00000349499 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
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