Protein–RNA interactions for Protein: O15084

ANKRD28, Serine/threonine-protein phosphatase 6 regulatory ankyrin repeat subunit A, humanhuman

Predictions only

Length 1,053 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD28O15084 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
ANKRD28O15084 AL135999.2-201ENST00000622438 1686 ntBASIC16.52■□□□□ 0.23
ANKRD28O15084 ZNF18-204ENST00000580306 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
ANKRD28O15084 PTDSS1-202ENST00000517309 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
ANKRD28O15084 GALNT18-201ENST00000227756 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
ANKRD28O15084 LTBP4-203ENST00000308370 4948 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
ANKRD28O15084 ZBP1-202ENST00000395822 2073 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
ANKRD28O15084 LINC00323-202ENST00000441268 2095 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
ANKRD28O15084 ZNF133-204ENST00000396026 2717 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.23
ANKRD28O15084 SLC35F3-202ENST00000366618 2891 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
ANKRD28O15084 LRRC14-205ENST00000529022 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ANKRD28O15084 COLEC11-206ENST00000403096 1557 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ANKRD28O15084 FAM222B-211ENST00000582266 2613 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ANKRD28O15084 SPTBN4-212ENST00000598249 8070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ANKRD28O15084 HTR1A-201ENST00000323865 1778 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ANKRD28O15084 AP000347.2-202ENST00000421064 3041 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ANKRD28O15084 LRP4-201ENST00000378623 8076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ANKRD28O15084 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ANKRD28O15084 CPEB3-203ENST00000614585 5789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ANKRD28O15084 CRY2-211ENST00000616080 1936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ANKRD28O15084 DPP6-202ENST00000377770 3710 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ANKRD28O15084 ZNF512B-201ENST00000369888 5919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ANKRD28O15084 HHIPL1-201ENST00000330710 7390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ANKRD28O15084 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ANKRD28O15084 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ANKRD28O15084 AC005091.1-201ENST00000441955 1190 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ANKRD28O15084 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ANKRD28O15084 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
ANKRD28O15084 SLC52A2-205ENST00000526752 710 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ANKRD28O15084 CD320-202ENST00000537716 1119 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ANKRD28O15084 LINC01582-202ENST00000561215 452 ntTSL 4 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ANKRD28O15084 AC111152.3-201ENST00000569699 673 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
ANKRD28O15084 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ANKRD28O15084 AL139384.1-201ENST00000612143 3047 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
ANKRD28O15084 RBM47-212ENST00000514014 2419 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ANKRD28O15084 AC007381.1-201ENST00000457668 2005 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ANKRD28O15084 CTSL-203ENST00000343150 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ANKRD28O15084 PLCB2-202ENST00000456256 4242 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ANKRD28O15084 ALDH3A1-205ENST00000444455 1771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ANKRD28O15084 OVOL1-203ENST00000532448 1774 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ANKRD28O15084 RANBP3-220ENST00000591092 1783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ANKRD28O15084 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ANKRD28O15084 ITPK1-210ENST00000556603 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ANKRD28O15084 FUT8-AS1-201ENST00000621019 1521 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
ANKRD28O15084 PCDHA5-202ENST00000529859 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ANKRD28O15084 WHAMMP3-203ENST00000621139 4494 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ANKRD28O15084 LFNG-207ENST00000614382 1969 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ANKRD28O15084 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ANKRD28O15084 LCE3D-201ENST00000368787 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ANKRD28O15084 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ANKRD28O15084 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ANKRD28O15084 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ANKRD28O15084 GLI4-207ENST00000521682 1082 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ANKRD28O15084 AC090616.6-201ENST00000582640 721 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
ANKRD28O15084 NUP153-202ENST00000537253 6030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ANKRD28O15084 KMT5A-202ENST00000402868 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ANKRD28O15084 CEBPG-201ENST00000284000 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ANKRD28O15084 DNAJA3-201ENST00000262375 2763 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ANKRD28O15084 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ANKRD28O15084 APBB1-224ENST00000621678 1907 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ANKRD28O15084 SSH1-201ENST00000326470 2432 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ANKRD28O15084 FAM181B-201ENST00000329203 3924 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ANKRD28O15084 ZNF281-203ENST00000367353 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ANKRD28O15084 SARS2-201ENST00000221431 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ANKRD28O15084 C17orf62-201ENST00000306645 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ANKRD28O15084 AC009336.1-201ENST00000608941 1553 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
ANKRD28O15084 PDE9A-203ENST00000335440 1728 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ANKRD28O15084 LAT2-201ENST00000275635 1869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ANKRD28O15084 NUP50-202ENST00000396096 1895 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ANKRD28O15084 CHKA-201ENST00000265689 2530 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ANKRD28O15084 ZNF503-201ENST00000372524 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ANKRD28O15084 RNF165-204ENST00000587853 2011 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ANKRD28O15084 AC011840.1-202ENST00000436477 1351 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ANKRD28O15084 FRMD8P1-201ENST00000440433 1524 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
ANKRD28O15084 CFAP77-201ENST00000343036 1818 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ANKRD28O15084 NINL-201ENST00000278886 4969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ANKRD28O15084 TRABD-202ENST00000380909 2272 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ANKRD28O15084 ZSWIM8-223ENST00000605216 6004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ANKRD28O15084 PTPRC-206ENST00000413409 1338 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ANKRD28O15084 ADRB1-201ENST00000369295 2853 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ANKRD28O15084 CHGA-202ENST00000334654 1474 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ANKRD28O15084 AC068831.1-204ENST00000501381 1621 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ANKRD28O15084 KRT84-201ENST00000257951 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ANKRD28O15084 TRPC4AP-202ENST00000451813 3138 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ANKRD28O15084 PDE4C-201ENST00000262805 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ANKRD28O15084 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ANKRD28O15084 TRIM7-204ENST00000393319 2320 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ANKRD28O15084 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ANKRD28O15084 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ANKRD28O15084 C2orf82-202ENST00000409230 663 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ANKRD28O15084 EVA1A-205ENST00000410113 1747 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ANKRD28O15084 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ANKRD28O15084 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ANKRD28O15084 AC068134.1-202ENST00000439072 356 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ANKRD28O15084 HYAL3-205ENST00000450982 1402 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ANKRD28O15084 KPNA2-202ENST00000537025 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ANKRD28O15084 REEP1-208ENST00000538924 1702 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ANKRD28O15084 AC009061.1-201ENST00000567261 475 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ANKRD28O15084 MSL1-206ENST00000579565 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ANKRD28O15084 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.2 ms