Protein–RNA interactions for Protein: O14813

PHOX2A, Paired mesoderm homeobox protein 2A, humanhuman

Predictions only

Length 284 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHOX2AO14813 AC239800.3-201ENST00000424684 5243 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
PHOX2AO14813 ORAOV1-201ENST00000279147 2478 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
PHOX2AO14813 ABLIM2-202ENST00000361581 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
PHOX2AO14813 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
PHOX2AO14813 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
PHOX2AO14813 SURF4-202ENST00000371989 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
PHOX2AO14813 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
PHOX2AO14813 PAX4-202ENST00000341640 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
PHOX2AO14813 ZNF165-201ENST00000377325 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
PHOX2AO14813 AIFM3-201ENST00000399163 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
PHOX2AO14813 KRT85-201ENST00000257901 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
PHOX2AO14813 SLC39A7-202ENST00000374677 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
PHOX2AO14813 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
PHOX2AO14813 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
PHOX2AO14813 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
PHOX2AO14813 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
PHOX2AO14813 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
PHOX2AO14813 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
PHOX2AO14813 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
PHOX2AO14813 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
PHOX2AO14813 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
PHOX2AO14813 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
PHOX2AO14813 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
PHOX2AO14813 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
PHOX2AO14813 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
PHOX2AO14813 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
PHOX2AO14813 CASP2-201ENST00000310447 4225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
PHOX2AO14813 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
PHOX2AO14813 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
PHOX2AO14813 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
PHOX2AO14813 SLC39A6-202ENST00000440549 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
PHOX2AO14813 CLMAT3-201ENST00000510576 1973 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
PHOX2AO14813 CHAT-203ENST00000351556 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
PHOX2AO14813 AP001372.2-201ENST00000526036 2493 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
PHOX2AO14813 SFRP4-201ENST00000436072 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
PHOX2AO14813 SHROOM1-201ENST00000319854 3190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
PHOX2AO14813 MYH11-201ENST00000300036 6029 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
PHOX2AO14813 ZBED1-201ENST00000381218 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
PHOX2AO14813 FAM222B-202ENST00000452648 2836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
PHOX2AO14813 LUC7L2-202ENST00000354926 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
PHOX2AO14813 LRRC14-205ENST00000529022 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
PHOX2AO14813 HNRNPA1-202ENST00000340913 1842 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
PHOX2AO14813 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
PHOX2AO14813 PEPD-203ENST00000436370 1638 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
PHOX2AO14813 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
PHOX2AO14813 FGD5-AS1-202ENST00000424349 3792 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
PHOX2AO14813 SLC35E2B-203ENST00000611123 5948 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
PHOX2AO14813 AC138035.3-201ENST00000622706 2791 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
PHOX2AO14813 AC091100.1-201ENST00000558424 2354 ntTSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
PHOX2AO14813 NPHP4-201ENST00000378156 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
PHOX2AO14813 ACBD5-202ENST00000375897 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
PHOX2AO14813 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
PHOX2AO14813 AC006058.4-201ENST00000624016 1670 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
PHOX2AO14813 ELN-206ENST00000380553 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
PHOX2AO14813 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
PHOX2AO14813 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
PHOX2AO14813 SSTR2-201ENST00000357585 7683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
PHOX2AO14813 NFATC1-218ENST00000592223 2531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
PHOX2AO14813 LYPLA1-214ENST00000618741 2526 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
PHOX2AO14813 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
PHOX2AO14813 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
PHOX2AO14813 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
PHOX2AO14813 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
PHOX2AO14813 PACSIN2-204ENST00000403744 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
PHOX2AO14813 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
PHOX2AO14813 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
PHOX2AO14813 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
PHOX2AO14813 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC13.38□□□□□ -0.27
PHOX2AO14813 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
PHOX2AO14813 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
PHOX2AO14813 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC13.38□□□□□ -0.27
PHOX2AO14813 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
PHOX2AO14813 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
PHOX2AO14813 SACM1L-201ENST00000389061 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
PHOX2AO14813 PDE8B-204ENST00000342343 2677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
PHOX2AO14813 GFRA2-208ENST00000524240 4921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
PHOX2AO14813 C16orf54-201ENST00000329410 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
PHOX2AO14813 TRAF6-201ENST00000348124 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
PHOX2AO14813 ECE2-201ENST00000324557 1823 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
PHOX2AO14813 CFAP77-201ENST00000343036 1818 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
PHOX2AO14813 SPIDR-201ENST00000297423 3988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
PHOX2AO14813 MAPK7-202ENST00000308406 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
PHOX2AO14813 EYA2-208ENST00000497062 2384 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
PHOX2AO14813 TMEM50B-210ENST00000542230 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
PHOX2AO14813 SIMC1-205ENST00000443967 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
PHOX2AO14813 MARK4-202ENST00000300843 5209 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
PHOX2AO14813 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
PHOX2AO14813 TMPRSS4-201ENST00000437212 2074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
PHOX2AO14813 CDIP1-209ENST00000567695 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
PHOX2AO14813 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
PHOX2AO14813 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC13.38□□□□□ -0.27
PHOX2AO14813 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
PHOX2AO14813 SHC1-204ENST00000368450 3059 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
PHOX2AO14813 SHC1-205ENST00000368453 3062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
PHOX2AO14813 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
PHOX2AO14813 RPP14-202ENST00000445193 7985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
PHOX2AO14813 RUVBL1-201ENST00000322623 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
PHOX2AO14813 PRPF31-202ENST00000391755 1767 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
PHOX2AO14813 ADAMTS2-201ENST00000251582 6754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
PHOX2AO14813 CYP2D6-203ENST00000360608 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.4 ms