Protein–RNA interactions for Protein: K7ER74

APOC4-APOC2, APOC4-APOC2 readthrough (NMD candidate), humanhuman

Predictions only

Length 178 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOC4-APOC2K7ER74 HPCAL1-206ENST00000613496 1547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
APOC4-APOC2K7ER74 AC243773.1-201ENST00000614759 544 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
APOC4-APOC2K7ER74 ALDH3B1-208ENST00000617288 2078 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
APOC4-APOC2K7ER74 CHAC1-204ENST00000617768 1560 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
APOC4-APOC2K7ER74 AC114341.1-201ENST00000618070 349 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
APOC4-APOC2K7ER74 PPRC1-201ENST00000278070 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
APOC4-APOC2K7ER74 CDK8-201ENST00000381527 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
APOC4-APOC2K7ER74 SLC29A1-208ENST00000393844 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
APOC4-APOC2K7ER74 MAEA-202ENST00000303400 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
APOC4-APOC2K7ER74 NECAB2-203ENST00000565691 2064 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
APOC4-APOC2K7ER74 C9orf62-201ENST00000623103 1924 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
APOC4-APOC2K7ER74 C11orf80-203ENST00000525449 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
APOC4-APOC2K7ER74 RHBG-204ENST00000537040 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
APOC4-APOC2K7ER74 ADM5-201ENST00000420022 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
APOC4-APOC2K7ER74 SGCE-206ENST00000445866 1666 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
APOC4-APOC2K7ER74 PAPD5-203ENST00000561678 2916 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
APOC4-APOC2K7ER74 C8orf46-215ENST00000522977 1347 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
APOC4-APOC2K7ER74 PCDHA2-201ENST00000378132 2626 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
APOC4-APOC2K7ER74 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
APOC4-APOC2K7ER74 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
APOC4-APOC2K7ER74 COPS8-203ENST00000409334 794 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
APOC4-APOC2K7ER74 TP53TG1-202ENST00000416560 710 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
APOC4-APOC2K7ER74 MAGI2-AS3-203ENST00000424477 520 ntTSL 4 BASIC17.84■□□□□ 0.45
APOC4-APOC2K7ER74 AL391650.1-205ENST00000433939 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
APOC4-APOC2K7ER74 RBPMS-AS1-202ENST00000519753 1031 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
APOC4-APOC2K7ER74 AP002807.1-202ENST00000526897 791 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
APOC4-APOC2K7ER74 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
APOC4-APOC2K7ER74 AC106782.2-201ENST00000563252 992 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
APOC4-APOC2K7ER74 AC074051.2-201ENST00000565115 352 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
APOC4-APOC2K7ER74 AC092338.2-202ENST00000567158 611 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
APOC4-APOC2K7ER74 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
APOC4-APOC2K7ER74 ZNF549-203ENST00000594943 556 ntTSL 4 BASIC17.84■□□□□ 0.45
APOC4-APOC2K7ER74 HEBP2-204ENST00000607197 10014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
APOC4-APOC2K7ER74 LGMN-202ENST00000393218 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
APOC4-APOC2K7ER74 SYVN1-203ENST00000377190 3052 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
APOC4-APOC2K7ER74 MAT2A-202ENST00000409017 1927 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
APOC4-APOC2K7ER74 DOK4-201ENST00000340099 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
APOC4-APOC2K7ER74 YAP1-209ENST00000537274 5350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
APOC4-APOC2K7ER74 BLOC1S5-202ENST00000397457 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
APOC4-APOC2K7ER74 TMEM145-201ENST00000301204 1768 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
APOC4-APOC2K7ER74 IL34-202ENST00000429149 1779 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
APOC4-APOC2K7ER74 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
APOC4-APOC2K7ER74 REEP1-208ENST00000538924 1702 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
APOC4-APOC2K7ER74 SLC22A3-201ENST00000275300 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
APOC4-APOC2K7ER74 MIB2-232ENST00000520777 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
APOC4-APOC2K7ER74 RBPJL-201ENST00000343694 2489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
APOC4-APOC2K7ER74 HES1-201ENST00000232424 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
APOC4-APOC2K7ER74 AL731569.1-201ENST00000428940 3058 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
APOC4-APOC2K7ER74 HAPLN3-204ENST00000562889 1547 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
APOC4-APOC2K7ER74 LINC01168-201ENST00000461291 5254 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
APOC4-APOC2K7ER74 HGS-201ENST00000329138 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
APOC4-APOC2K7ER74 ARHGAP8-201ENST00000336963 1487 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
APOC4-APOC2K7ER74 FAM53B-AS1-202ENST00000448422 1491 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
APOC4-APOC2K7ER74 TNFSF14-202ENST00000599359 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
APOC4-APOC2K7ER74 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
APOC4-APOC2K7ER74 BAIAP2-205ENST00000435091 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
APOC4-APOC2K7ER74 FAM111A-204ENST00000528737 6189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
APOC4-APOC2K7ER74 AC092068.3-201ENST00000587894 2016 ntBASIC17.83■□□□□ 0.45
APOC4-APOC2K7ER74 SRSF1-208ENST00000584773 1317 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
APOC4-APOC2K7ER74 ZNF79-204ENST00000617266 1969 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
APOC4-APOC2K7ER74 C12orf56-207ENST00000543942 3242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
APOC4-APOC2K7ER74 AL590627.1-201ENST00000626603 1910 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
APOC4-APOC2K7ER74 NPFFR2-202ENST00000344413 1234 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
APOC4-APOC2K7ER74 BOLA1-201ENST00000369150 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
APOC4-APOC2K7ER74 CORT-201ENST00000377049 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
APOC4-APOC2K7ER74 HCCS-202ENST00000380762 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
APOC4-APOC2K7ER74 POM121L3P-201ENST00000419331 1163 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
APOC4-APOC2K7ER74 COX18-204ENST00000507544 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
APOC4-APOC2K7ER74 RMI2-205ENST00000576027 818 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
APOC4-APOC2K7ER74 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
APOC4-APOC2K7ER74 AC092329.2-201ENST00000598402 547 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
APOC4-APOC2K7ER74 AC069148.1-201ENST00000608741 768 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
APOC4-APOC2K7ER74 BCL10-202ENST00000620248 774 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
APOC4-APOC2K7ER74 BEAN1-211ENST00000622872 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
APOC4-APOC2K7ER74 AL358472.4-201ENST00000633140 710 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
APOC4-APOC2K7ER74 USP3-AS1-201ENST00000558831 1784 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
APOC4-APOC2K7ER74 PRPF31-203ENST00000419967 2269 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
APOC4-APOC2K7ER74 RUNX1-203ENST00000358356 2720 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
APOC4-APOC2K7ER74 TBPL1-208ENST00000613034 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
APOC4-APOC2K7ER74 POM121C-208ENST00000615331 5835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
APOC4-APOC2K7ER74 BRPF1-201ENST00000383829 4736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
APOC4-APOC2K7ER74 TFAP2A-AS1-201ENST00000420777 1575 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
APOC4-APOC2K7ER74 STX3-203ENST00000529177 1571 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
APOC4-APOC2K7ER74 DIAPH2-205ENST00000373061 4983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
APOC4-APOC2K7ER74 EWSR1-222ENST00000629659 2446 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
APOC4-APOC2K7ER74 ADAM10-205ENST00000461408 1932 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
APOC4-APOC2K7ER74 AES-201ENST00000221561 1884 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
APOC4-APOC2K7ER74 GPBAR1-201ENST00000479077 1869 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
APOC4-APOC2K7ER74 DAG1-201ENST00000308775 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
APOC4-APOC2K7ER74 CYP2U1-202ENST00000508453 3125 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
APOC4-APOC2K7ER74 GRB7-201ENST00000309156 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
APOC4-APOC2K7ER74 PCDHA8-202ENST00000531613 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
APOC4-APOC2K7ER74 MREG-205ENST00000620139 2618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
APOC4-APOC2K7ER74 FAM86DP-207ENST00000497543 2152 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
APOC4-APOC2K7ER74 RNF217-211ENST00000560949 5145 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
APOC4-APOC2K7ER74 PXMP4-201ENST00000217398 979 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
APOC4-APOC2K7ER74 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
APOC4-APOC2K7ER74 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
APOC4-APOC2K7ER74 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
APOC4-APOC2K7ER74 TRAPPC3-202ENST00000373162 1056 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.1 ms