Protein–RNA interactions for Protein: I3L3R5

CCER2, Coiled-coil domain-containing glutamate-rich protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 266 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCER2I3L3R5 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CCER2I3L3R5 EDN3-205ENST00000395654 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CCER2I3L3R5 PTGDR2-201ENST00000332539 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CCER2I3L3R5 FBXL7-202ENST00000504595 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CCER2I3L3R5 CEACAM21-203ENST00000407170 1691 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CCER2I3L3R5 AL353608.3-201ENST00000603200 2211 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CCER2I3L3R5 SLFNL1-205ENST00000439569 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CCER2I3L3R5 ARHGEF18-201ENST00000319670 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CCER2I3L3R5 GLDN-201ENST00000335449 4971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CCER2I3L3R5 STKLD1-201ENST00000371957 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CCER2I3L3R5 ADAMTSL1-202ENST00000327883 1864 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CCER2I3L3R5 ASH1L-207ENST00000548830 1862 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CCER2I3L3R5 BNIP2-212ENST00000607373 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CCER2I3L3R5 AL355315.1-201ENST00000370649 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CCER2I3L3R5 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CCER2I3L3R5 ULBP2-201ENST00000367351 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CCER2I3L3R5 EDN3-202ENST00000337938 2636 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CCER2I3L3R5 CDKN1A-201ENST00000244741 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CCER2I3L3R5 SAMM50-201ENST00000350028 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CCER2I3L3R5 PDE1C-206ENST00000396193 5109 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CCER2I3L3R5 CD9-202ENST00000382515 1229 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CCER2I3L3R5 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CCER2I3L3R5 DANCR-204ENST00000444958 709 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CCER2I3L3R5 LINC00882-201ENST00000473636 710 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CCER2I3L3R5 ENDOV-205ENST00000518644 625 ntTSL 4 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CCER2I3L3R5 JPH4-203ENST00000544177 1124 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CCER2I3L3R5 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CCER2I3L3R5 DUX4L17-201ENST00000557360 1267 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
CCER2I3L3R5 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CCER2I3L3R5 AC011840.4-201ENST00000578471 627 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
CCER2I3L3R5 GXYLT1-202ENST00000398675 7497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CCER2I3L3R5 FOXP1-218ENST00000498215 2400 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CCER2I3L3R5 SYNDIG1L-202ENST00000554823 2420 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CCER2I3L3R5 PIAS3-201ENST00000369298 2761 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CCER2I3L3R5 ZNF514-202ENST00000411425 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CCER2I3L3R5 LINC00271-201ENST00000421378 1580 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CCER2I3L3R5 AL355987.4-201ENST00000415992 4244 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CCER2I3L3R5 C7orf31-201ENST00000283905 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CCER2I3L3R5 NFATC4-223ENST00000555802 1476 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CCER2I3L3R5 PCCB-209ENST00000469217 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CCER2I3L3R5 NPY4R-202ENST00000612632 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CCER2I3L3R5 NPY4R2-202ENST00000613306 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CCER2I3L3R5 SPINT1-202ENST00000562057 2456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CCER2I3L3R5 TRIM45-203ENST00000369464 3495 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CCER2I3L3R5 NKIRAS1-206ENST00000425478 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CCER2I3L3R5 GCAT-202ENST00000323205 1656 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CCER2I3L3R5 TAB1-202ENST00000331454 1660 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CCER2I3L3R5 GCK-209ENST00000616242 2260 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CCER2I3L3R5 AC092143.3-201ENST00000565150 1900 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CCER2I3L3R5 PCDH7-206ENST00000543491 4457 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CCER2I3L3R5 CCS-201ENST00000310190 942 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CCER2I3L3R5 AC092647.4-201ENST00000457211 535 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
CCER2I3L3R5 BVES-AS1-203ENST00000580511 853 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CCER2I3L3R5 AC011467.2-201ENST00000598425 242 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
CCER2I3L3R5 NFIB-212ENST00000622520 1274 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CCER2I3L3R5 MFSD11-202ENST00000355954 2832 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CCER2I3L3R5 PCDHGC5-202ENST00000610789 2763 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CCER2I3L3R5 E2F2-201ENST00000361729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CCER2I3L3R5 LYPD5-202ENST00000414615 2137 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CCER2I3L3R5 TSKU-205ENST00000612930 2666 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CCER2I3L3R5 CXorf38-202ENST00000378421 2380 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CCER2I3L3R5 AC046158.3-201ENST00000624947 2558 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
CCER2I3L3R5 SPATA18-202ENST00000419395 2816 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CCER2I3L3R5 ANXA8-202ENST00000583448 1971 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CCER2I3L3R5 RGS3-210ENST00000462143 2759 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CCER2I3L3R5 SLC22A1-202ENST00000366963 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CCER2I3L3R5 ZNFX1-203ENST00000371754 5235 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CCER2I3L3R5 ADAD1-203ENST00000388725 1918 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CCER2I3L3R5 GLOD4-203ENST00000536578 2497 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CCER2I3L3R5 DPY19L3-206ENST00000587077 2456 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CCER2I3L3R5 STOX1-204ENST00000399169 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CCER2I3L3R5 IRS2-201ENST00000375856 8138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CCER2I3L3R5 DARS-201ENST00000264161 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CCER2I3L3R5 TMEM39B-201ENST00000336294 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CCER2I3L3R5 CTNS-203ENST00000399306 803 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CCER2I3L3R5 AC104076.2-201ENST00000448912 469 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
CCER2I3L3R5 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CCER2I3L3R5 SMIM4-202ENST00000476842 522 ntTSL 4 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CCER2I3L3R5 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CCER2I3L3R5 AP002490.2-201ENST00000524791 560 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
CCER2I3L3R5 AC009533.2-201ENST00000543664 586 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
CCER2I3L3R5 ATP6V0C-202ENST00000564973 1081 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CCER2I3L3R5 NFE2-202ENST00000435572 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CCER2I3L3R5 TTC29-205ENST00000504425 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CCER2I3L3R5 PLCB3-204ENST00000540288 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CCER2I3L3R5 KLHDC8B-201ENST00000332780 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CCER2I3L3R5 TLE4-206ENST00000376552 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CCER2I3L3R5 ZNF805-201ENST00000354309 2396 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CCER2I3L3R5 TLK2-201ENST00000326270 3512 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CCER2I3L3R5 AC068944.1-201ENST00000514855 1604 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CCER2I3L3R5 PABPC4-203ENST00000372858 2753 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CCER2I3L3R5 COPS7B-206ENST00000410017 2051 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CCER2I3L3R5 AQP10-203ENST00000484864 2262 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CCER2I3L3R5 CHAC1-204ENST00000617768 1560 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CCER2I3L3R5 ALDH3A2-225ENST00000630662 1558 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CCER2I3L3R5 BTBD11-201ENST00000280758 5767 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CCER2I3L3R5 PDE12-202ENST00000487257 3040 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CCER2I3L3R5 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CCER2I3L3R5 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CCER2I3L3R5 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.5 ms