Protein–RNA interactions for Protein: H7C1C5

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 153 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H7C1C5 TAX1BP3-202ENST00000611779 1302 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
H7C1C5 ABHD11-205ENST00000437775 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
H7C1C5 AL049757.1-201ENST00000616842 1596 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
H7C1C5 AC125494.1-203ENST00000396799 1622 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
H7C1C5 P2RX5-209ENST00000552276 1642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
H7C1C5 AC093525.9-201ENST00000624961 1746 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
H7C1C5 MBOAT1-201ENST00000324607 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
H7C1C5 SATB2-202ENST00000417098 5730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
H7C1C5 HIBCH-201ENST00000359678 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
H7C1C5 F12-201ENST00000253496 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
H7C1C5 EPN2-203ENST00000395618 2216 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
H7C1C5 SLC52A1-201ENST00000254853 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
H7C1C5 AC079328.2-201ENST00000561241 3354 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
H7C1C5 FBXO18-203ENST00000397269 3640 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
H7C1C5 DHX30-205ENST00000445061 4065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
H7C1C5 VARS-215ENST00000375663 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
H7C1C5 MALT1-202ENST00000348428 9368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
H7C1C5 SIPA1-201ENST00000394224 3628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
H7C1C5 SLC25A23-202ENST00000301454 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
H7C1C5 DOK4-201ENST00000340099 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
H7C1C5 FAM178B-204ENST00000490605 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
H7C1C5 CA12-203ENST00000422263 2556 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
H7C1C5 ST6GALNAC6-202ENST00000373141 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
H7C1C5 MYC-202ENST00000377970 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
H7C1C5 BICD2-201ENST00000356884 6427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
H7C1C5 HCRTR1-203ENST00000403528 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
H7C1C5 CLDN7-203ENST00000538261 1923 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
H7C1C5 CLDN4-201ENST00000340958 1831 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
H7C1C5 CAMK1D-201ENST00000378845 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
H7C1C5 RPAIN-203ENST00000381209 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
H7C1C5 ROBO3-221ENST00000543966 1520 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
H7C1C5 PDLIM2-206ENST00000409141 1463 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
H7C1C5 NKIRAS2-207ENST00000449471 1461 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
H7C1C5 HBZ-201ENST00000252951 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
H7C1C5 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
H7C1C5 PTGDS-202ENST00000371625 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
H7C1C5 MYCLP1-201ENST00000372451 1075 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
H7C1C5 RPA2-202ENST00000373909 1162 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
H7C1C5 RPS9-203ENST00000391752 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
H7C1C5 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
H7C1C5 CLDN7-202ENST00000397317 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
H7C1C5 CAMTA1-IT1-201ENST00000427317 365 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
H7C1C5 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
H7C1C5 VENTXP7-201ENST00000475503 772 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
H7C1C5 AF186192.2-201ENST00000524514 423 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
H7C1C5 ABR-204ENST00000543210 1049 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
H7C1C5 ATP6V0C-203ENST00000565223 668 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
H7C1C5 ATP6V0C-204ENST00000568562 477 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
H7C1C5 ABR-217ENST00000572441 563 ntTSL 4 BASIC15.55■□□□□ 0.08
H7C1C5 RAB34-226ENST00000636772 1180 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
H7C1C5 SMCHD1-201ENST00000320876 8821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
H7C1C5 MON2-203ENST00000546600 6130 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
H7C1C5 USP2-202ENST00000455332 2903 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
H7C1C5 C2CD3-213ENST00000539061 2722 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
H7C1C5 GIMAP1-201ENST00000307194 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
H7C1C5 CASK-203ENST00000378163 4411 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
H7C1C5 NSFL1C-202ENST00000353088 2611 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
H7C1C5 INPP5J-207ENST00000405300 2515 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
H7C1C5 SLC8A3-203ENST00000357887 5259 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
H7C1C5 SLC8A3-204ENST00000381269 5268 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
H7C1C5 NCAPH2-203ENST00000395701 2077 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
H7C1C5 AC005915.1-201ENST00000624912 2018 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
H7C1C5 CRELD1-201ENST00000326434 1994 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
H7C1C5 FAM46A-201ENST00000320172 5609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
H7C1C5 SFTPB-202ENST00000409383 1867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
H7C1C5 PTHLH-205ENST00000535992 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
H7C1C5 PCCB-201ENST00000251654 1833 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
H7C1C5 ANGPTL4-202ENST00000393962 1705 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
H7C1C5 SBNO2-204ENST00000587024 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
H7C1C5 GMPR-201ENST00000259727 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
H7C1C5 PGAP3-203ENST00000378011 2533 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
H7C1C5 ARHGAP33-201ENST00000007510 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
H7C1C5 ST8SIA5-202ENST00000536490 1499 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
H7C1C5 CDK10-208ENST00000505473 1424 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
H7C1C5 PRRT4-205ENST00000489835 2313 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
H7C1C5 ESYT3-201ENST00000289135 1356 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
H7C1C5 LINC00960-201ENST00000463183 1333 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
H7C1C5 NFATC2-206ENST00000609943 5690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
H7C1C5 SZT2-202ENST00000372450 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
H7C1C5 PFDN6-201ENST00000374606 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
H7C1C5 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
H7C1C5 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
H7C1C5 AC093734.1-201ENST00000416100 242 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
H7C1C5 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
H7C1C5 TSSC2-201ENST00000450217 709 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
H7C1C5 LINC00882-201ENST00000473636 710 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
H7C1C5 AC122714.2-201ENST00000502787 707 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
H7C1C5 PACRGL-218ENST00000507634 1142 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
H7C1C5 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
H7C1C5 AC111152.3-201ENST00000569699 673 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
H7C1C5 TNNT1-204ENST00000585321 995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
H7C1C5 AC087645.2-201ENST00000586321 799 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
H7C1C5 AC116407.4-201ENST00000623319 1061 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
H7C1C5 AC112229.1-202ENST00000490013 2918 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
H7C1C5 EML2-203ENST00000536630 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
H7C1C5 LINC00671-201ENST00000301683 1958 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
H7C1C5 GABRB2-202ENST00000353437 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
H7C1C5 NRXN2-202ENST00000301894 3535 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
H7C1C5 PPT2-246ENST00000375137 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
H7C1C5 RABGAP1L-204ENST00000357444 2605 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.5 ms