Protein–RNA interactions for Protein: E9PBE3

Uncharacterized protein, humanhuman

Predictions only

Length 544 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E9PBE3 PAX4-202ENST00000341640 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
E9PBE3 ESR2-205ENST00000358599 1899 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
E9PBE3 LRP11-201ENST00000239367 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
E9PBE3 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
E9PBE3 BCAR1-206ENST00000535626 2894 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
E9PBE3 AC093525.9-201ENST00000624961 1746 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
E9PBE3 VWA1-203ENST00000476993 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
E9PBE3 DNAAF2-201ENST00000298292 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
E9PBE3 LTBP2-205ENST00000556690 5614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
E9PBE3 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
E9PBE3 MIER1-206ENST00000371016 1802 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
E9PBE3 CHGA-201ENST00000216492 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
E9PBE3 WDR45B-201ENST00000392325 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
E9PBE3 DLG4-201ENST00000302955 3184 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
E9PBE3 DLG4-202ENST00000399506 3185 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
E9PBE3 GPR158-AS1-201ENST00000449643 2433 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
E9PBE3 ZSCAN25-201ENST00000262941 1652 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
E9PBE3 SYTL2-215ENST00000527523 3049 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
E9PBE3 FGFR4-201ENST00000292408 3122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
E9PBE3 SLC9A2-201ENST00000233969 5410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
E9PBE3 C21orf58-201ENST00000291691 2975 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
E9PBE3 DHX36-202ENST00000329463 2985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
E9PBE3 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
E9PBE3 HDAC8-206ENST00000373571 2133 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
E9PBE3 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
E9PBE3 SLC25A1P3-201ENST00000395415 828 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
E9PBE3 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.98■□□□□ 0.31
E9PBE3 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
E9PBE3 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
E9PBE3 AC112698.1-201ENST00000510299 916 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
E9PBE3 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
E9PBE3 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
E9PBE3 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
E9PBE3 MDGA1-203ENST00000434837 10736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
E9PBE3 LAT2-201ENST00000275635 1869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
E9PBE3 ATP6V0E2-202ENST00000425642 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
E9PBE3 ZNF773-201ENST00000282292 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
E9PBE3 AC009041.2-206ENST00000563863 1728 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
E9PBE3 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
E9PBE3 ZFP64-205ENST00000371518 1841 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
E9PBE3 ZNF707-223ENST00000532205 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
E9PBE3 WDR81-204ENST00000419248 3315 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
E9PBE3 ATP6V0E2-AS1-201ENST00000461019 2973 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
E9PBE3 PCDHGA11-202ENST00000518882 2263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
E9PBE3 TTBK2-208ENST00000622375 6891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
E9PBE3 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
E9PBE3 KPNA2-202ENST00000537025 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
E9PBE3 SPINT1-202ENST00000562057 2456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
E9PBE3 CHEK2-202ENST00000348295 1771 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
E9PBE3 MYBPH-202ENST00000621380 1772 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
E9PBE3 SCUBE2-207ENST00000520467 3148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
E9PBE3 HMBS-203ENST00000442944 1548 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
E9PBE3 NPRL3-211ENST00000611875 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
E9PBE3 CD5L-201ENST00000368174 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
E9PBE3 PCDHA1-203ENST00000504120 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
E9PBE3 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
E9PBE3 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
E9PBE3 CR769775.1-204ENST00000439760 747 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
E9PBE3 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
E9PBE3 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
E9PBE3 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
E9PBE3 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
E9PBE3 AC069281.2-201ENST00000485071 4401 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
E9PBE3 MAP2K7-202ENST00000397981 3430 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
E9PBE3 TRIM7-203ENST00000393315 2851 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
E9PBE3 SLC1A6-208ENST00000598504 2987 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
E9PBE3 ARL14EP-201ENST00000282032 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
E9PBE3 AP2A2-201ENST00000332231 4656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
E9PBE3 GALNT6-201ENST00000356317 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
E9PBE3 MYB-203ENST00000341911 3672 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
E9PBE3 SERTM1-201ENST00000315190 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
E9PBE3 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
E9PBE3 AC068831.1-204ENST00000501381 1621 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
E9PBE3 ARHGEF4-205ENST00000409359 5489 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
E9PBE3 WRAP53-203ENST00000431639 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
E9PBE3 WRAP53-204ENST00000457584 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
E9PBE3 GNG2-213ENST00000556766 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
E9PBE3 LETM2-205ENST00000519476 2240 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
E9PBE3 ZNF414-202ENST00000393927 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
E9PBE3 STKLD1-201ENST00000371957 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
E9PBE3 AL662844.4-201ENST00000606367 2838 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
E9PBE3 PPP1CB-202ENST00000358506 4771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
E9PBE3 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
E9PBE3 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
E9PBE3 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC16.96■□□□□ 0.31
E9PBE3 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
E9PBE3 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
E9PBE3 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
E9PBE3 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
E9PBE3 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
E9PBE3 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
E9PBE3 MAGI2-AS3-208ENST00000446159 670 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
E9PBE3 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
E9PBE3 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
E9PBE3 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
E9PBE3 AL132780.2-201ENST00000557615 1021 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
E9PBE3 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
E9PBE3 AC009154.2-201ENST00000621177 724 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
E9PBE3 TBC1D10C-201ENST00000312390 1497 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
E9PBE3 CD151-203ENST00000397421 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.2 ms