Protein–RNA interactions for Protein: B6SEH8

ERVV-1, Endogenous retrovirus group V member 1 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 477 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVV-1B6SEH8 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
ERVV-1B6SEH8 EPHX1-206ENST00000614058 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ERVV-1B6SEH8 CFAP77-201ENST00000343036 1818 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
ERVV-1B6SEH8 HLA-DRB6-201ENST00000411500 1235 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
ERVV-1B6SEH8 AC092474.2-201ENST00000424288 719 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
ERVV-1B6SEH8 BCRP1-201ENST00000444246 691 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
ERVV-1B6SEH8 ITGA9-AS1-209ENST00000450990 562 ntTSL 4 BASIC21.46■■□□□ 1.03
ERVV-1B6SEH8 PTGES3-205ENST00000456859 957 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
ERVV-1B6SEH8 RAB3D-202ENST00000589655 924 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
ERVV-1B6SEH8 COLCA2-204ENST00000610738 975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ERVV-1B6SEH8 COLCA2-206ENST00000638573 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ERVV-1B6SEH8 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ERVV-1B6SEH8 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
ERVV-1B6SEH8 ATP6V0E2-202ENST00000425642 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ERVV-1B6SEH8 RPS6KB1-203ENST00000406116 1982 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ERVV-1B6SEH8 TNFAIP1-202ENST00000544907 1656 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
ERVV-1B6SEH8 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ERVV-1B6SEH8 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ERVV-1B6SEH8 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
ERVV-1B6SEH8 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ERVV-1B6SEH8 LRRC71-201ENST00000337428 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ERVV-1B6SEH8 TDRKH-202ENST00000368823 2751 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
ERVV-1B6SEH8 CHRM2-201ENST00000320658 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ERVV-1B6SEH8 C16orf92-201ENST00000300575 895 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ERVV-1B6SEH8 METTL26-202ENST00000338401 544 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ERVV-1B6SEH8 SNHG11-201ENST00000359074 1031 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ERVV-1B6SEH8 GRTP1-AS1-201ENST00000419199 867 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
ERVV-1B6SEH8 FAM58DP-201ENST00000428076 619 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
ERVV-1B6SEH8 ARPIN-202ENST00000460685 2145 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
ERVV-1B6SEH8 APBB2-208ENST00000504305 1274 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
ERVV-1B6SEH8 C8orf46-213ENST00000521495 557 ntTSL 4 BASIC21.45■■□□□ 1.02
ERVV-1B6SEH8 TSFM-210ENST00000550559 897 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
ERVV-1B6SEH8 LINC01225-203ENST00000563550 1244 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
ERVV-1B6SEH8 AC013565.3-202ENST00000570120 460 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
ERVV-1B6SEH8 LRRC42-201ENST00000319223 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ERVV-1B6SEH8 BEST2-202ENST00000549706 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
ERVV-1B6SEH8 HYAL3-205ENST00000450982 1402 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ERVV-1B6SEH8 TPGS2-220ENST00000610723 1426 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
ERVV-1B6SEH8 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
ERVV-1B6SEH8 AC090286.1-201ENST00000354432 1489 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ERVV-1B6SEH8 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ERVV-1B6SEH8 CAPN1-201ENST00000279247 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ERVV-1B6SEH8 EGFEM1P-202ENST00000431685 1563 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
ERVV-1B6SEH8 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
ERVV-1B6SEH8 PRR15-201ENST00000319694 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ERVV-1B6SEH8 TEAD4-202ENST00000359864 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ERVV-1B6SEH8 NR4A2-203ENST00000409108 1735 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
ERVV-1B6SEH8 PDE4D-204ENST00000358923 2969 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ERVV-1B6SEH8 HOTAIR-201ENST00000424518 2421 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
ERVV-1B6SEH8 TINF2-201ENST00000267415 1852 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ERVV-1B6SEH8 HIC1-202ENST00000399849 3156 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ERVV-1B6SEH8 HCG4-201ENST00000418983 998 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
ERVV-1B6SEH8 FAM86GP-201ENST00000448322 971 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
ERVV-1B6SEH8 AC067863.1-201ENST00000494933 530 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
ERVV-1B6SEH8 AC005498.2-205ENST00000593218 784 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
ERVV-1B6SEH8 AC084121.4-201ENST00000641598 221 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
ERVV-1B6SEH8 AF228730.8-201ENST00000642140 221 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
ERVV-1B6SEH8 TMEM143-202ENST00000377431 1960 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ERVV-1B6SEH8 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
ERVV-1B6SEH8 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
ERVV-1B6SEH8 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
ERVV-1B6SEH8 PLXNB2-214ENST00000614805 1387 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
ERVV-1B6SEH8 CHRFAM7A-202ENST00000397827 2794 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
ERVV-1B6SEH8 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ERVV-1B6SEH8 ATP6V1E1-201ENST00000253413 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ERVV-1B6SEH8 LINC02167-203ENST00000566900 1489 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
ERVV-1B6SEH8 GNAZ-203ENST00000615612 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ERVV-1B6SEH8 CHEK1-202ENST00000427383 1670 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ERVV-1B6SEH8 NPM1-201ENST00000296930 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ERVV-1B6SEH8 GAL3ST1-201ENST00000338911 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ERVV-1B6SEH8 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ERVV-1B6SEH8 BECN1-201ENST00000361523 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ERVV-1B6SEH8 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ERVV-1B6SEH8 ZBTB16-201ENST00000335953 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ERVV-1B6SEH8 RNF151-201ENST00000321392 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ERVV-1B6SEH8 SIVA1-202ENST00000347067 550 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ERVV-1B6SEH8 STOML1-203ENST00000359750 984 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ERVV-1B6SEH8 CD99-202ENST00000381180 530 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ERVV-1B6SEH8 GPS2P2-201ENST00000430745 888 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
ERVV-1B6SEH8 SPCS2P4-201ENST00000436160 681 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
ERVV-1B6SEH8 LINC02055-207ENST00000524346 706 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ERVV-1B6SEH8 FGFR1OP2-206ENST00000546072 956 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ERVV-1B6SEH8 LINC01481-203ENST00000549651 883 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ERVV-1B6SEH8 RNF151-203ENST00000569714 796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ERVV-1B6SEH8 FSTL3-202ENST00000588773 746 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ERVV-1B6SEH8 AP001059.3-201ENST00000619053 235 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
ERVV-1B6SEH8 Z92544.3-201ENST00000624747 417 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
ERVV-1B6SEH8 CHPF-203ENST00000535926 2634 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ERVV-1B6SEH8 LILRA6-201ENST00000245621 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ERVV-1B6SEH8 ZFPL1-201ENST00000294258 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ERVV-1B6SEH8 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ERVV-1B6SEH8 CCDC28B-202ENST00000421922 1415 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ERVV-1B6SEH8 FAM53B-AS1-202ENST00000448422 1491 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ERVV-1B6SEH8 PCGF2-206ENST00000618941 1499 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ERVV-1B6SEH8 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ERVV-1B6SEH8 AL139398.1-201ENST00000638795 1529 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ERVV-1B6SEH8 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ERVV-1B6SEH8 HMOX2-217ENST00000619528 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ERVV-1B6SEH8 PODNL1-201ENST00000254320 1859 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ERVV-1B6SEH8 PPARD-202ENST00000337400 2041 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70.5 ms