Protein–RNA interactions for Protein: B2RD01

CENPBD1, CENPB DNA-binding domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 187 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPBD1B2RD01 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CENPBD1B2RD01 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CENPBD1B2RD01 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CENPBD1B2RD01 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CENPBD1B2RD01 AL121956.5-201ENST00000625261 221 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
CENPBD1B2RD01 KCNA5-201ENST00000252321 2800 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CENPBD1B2RD01 AL355312.1-201ENST00000407115 2176 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
CENPBD1B2RD01 CARNS1-201ENST00000307823 3942 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CENPBD1B2RD01 NFATC2-206ENST00000609943 5690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CENPBD1B2RD01 DUOXA1-201ENST00000267803 1996 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CENPBD1B2RD01 TMEM216-203ENST00000515837 1958 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CENPBD1B2RD01 PDZD8-201ENST00000334464 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CENPBD1B2RD01 RAB15-203ENST00000533601 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CENPBD1B2RD01 HARS-201ENST00000307633 1780 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CENPBD1B2RD01 KCTD20-202ENST00000373731 5619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CENPBD1B2RD01 RBFOX1-222ENST00000585867 1580 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CENPBD1B2RD01 SLC22A7-201ENST00000372574 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CENPBD1B2RD01 IL27RA-201ENST00000263379 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CENPBD1B2RD01 SLC8A3-203ENST00000357887 5259 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CENPBD1B2RD01 SLC8A3-204ENST00000381269 5268 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CENPBD1B2RD01 ZNF84-208ENST00000539354 3237 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CENPBD1B2RD01 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CENPBD1B2RD01 AL079301.1-201ENST00000424580 1633 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CENPBD1B2RD01 AC008969.1-203ENST00000313957 1897 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CENPBD1B2RD01 AC074117.1-201ENST00000447070 3060 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CENPBD1B2RD01 CXorf67-201ENST00000342995 1929 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CENPBD1B2RD01 GHR-201ENST00000230882 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CENPBD1B2RD01 AC007495.1-201ENST00000501259 2678 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CENPBD1B2RD01 SALL3-202ENST00000537592 6555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CENPBD1B2RD01 AQP1-201ENST00000311813 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CENPBD1B2RD01 PTK6-202ENST00000542869 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CENPBD1B2RD01 GGA1-203ENST00000343632 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CENPBD1B2RD01 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CENPBD1B2RD01 SMARCA4-203ENST00000429416 5691 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CENPBD1B2RD01 C8orf49-201ENST00000525043 1968 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
CENPBD1B2RD01 ATP6V0E2-AS1-201ENST00000461019 2973 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CENPBD1B2RD01 CTSB-228ENST00000533455 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CENPBD1B2RD01 DBNDD2-204ENST00000372712 1537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CENPBD1B2RD01 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CENPBD1B2RD01 AC004540.1-201ENST00000439120 891 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CENPBD1B2RD01 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
CENPBD1B2RD01 AC008610.1-201ENST00000504573 393 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CENPBD1B2RD01 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CENPBD1B2RD01 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CENPBD1B2RD01 ECSIT-207ENST00000588998 818 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CENPBD1B2RD01 AC133561.2-201ENST00000380145 1802 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CENPBD1B2RD01 DNAAF1-201ENST00000378553 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CENPBD1B2RD01 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CENPBD1B2RD01 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CENPBD1B2RD01 CD68-201ENST00000250092 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CENPBD1B2RD01 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CENPBD1B2RD01 FGF4-201ENST00000168712 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CENPBD1B2RD01 ACHE-202ENST00000302913 2956 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CENPBD1B2RD01 AC023824.1-201ENST00000562945 2975 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
CENPBD1B2RD01 ZBTB5-201ENST00000307750 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CENPBD1B2RD01 RALGDS-205ENST00000393160 3801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CENPBD1B2RD01 PRAG1-201ENST00000615670 4903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CENPBD1B2RD01 SYVN1-201ENST00000294256 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CENPBD1B2RD01 FSCN1-201ENST00000382361 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CENPBD1B2RD01 GLG1-202ENST00000422840 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CENPBD1B2RD01 NIPA2-204ENST00000398014 3130 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CENPBD1B2RD01 PIP5K1A-207ENST00000441902 2297 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CENPBD1B2RD01 PCDHA2-201ENST00000378132 2626 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CENPBD1B2RD01 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CENPBD1B2RD01 CACNA1H-206ENST00000565831 7815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CENPBD1B2RD01 ADAM23-201ENST00000264377 6330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CENPBD1B2RD01 ASL-201ENST00000304874 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CENPBD1B2RD01 BAIAP2-205ENST00000435091 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CENPBD1B2RD01 SLC16A5-203ENST00000538213 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CENPBD1B2RD01 ZMIZ1-205ENST00000611351 2196 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CENPBD1B2RD01 MAZ-212ENST00000568282 1593 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CENPBD1B2RD01 FRMD6-AS1-201ENST00000617151 2229 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
CENPBD1B2RD01 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CENPBD1B2RD01 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CENPBD1B2RD01 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CENPBD1B2RD01 AC005091.1-201ENST00000441955 1190 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CENPBD1B2RD01 MTCL1P1-201ENST00000446207 792 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
CENPBD1B2RD01 MHENCR-202ENST00000449500 801 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CENPBD1B2RD01 AC068472.1-201ENST00000474589 881 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
CENPBD1B2RD01 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CENPBD1B2RD01 AL023806.1-201ENST00000603994 1649 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
CENPBD1B2RD01 Z83836.1-201ENST00000624605 1642 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
CENPBD1B2RD01 EWSR1-202ENST00000332035 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CENPBD1B2RD01 AC100803.2-201ENST00000562459 1963 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
CENPBD1B2RD01 DIDO1-207ENST00000395343 8477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CENPBD1B2RD01 BMI1-201ENST00000376663 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CENPBD1B2RD01 GBA2-202ENST00000378094 3757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CENPBD1B2RD01 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CENPBD1B2RD01 HECTD1-201ENST00000399332 9134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CENPBD1B2RD01 DUS3L-201ENST00000309061 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CENPBD1B2RD01 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CENPBD1B2RD01 FAM157B-201ENST00000446912 1795 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CENPBD1B2RD01 PRKCSH-205ENST00000587327 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CENPBD1B2RD01 SUSD4-204ENST00000366878 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CENPBD1B2RD01 AHRR-201ENST00000316418 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CENPBD1B2RD01 BCL11B-202ENST00000357195 7559 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CENPBD1B2RD01 CYP2D7-208ENST00000614967 1504 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CENPBD1B2RD01 ANKRD33B-201ENST00000296657 9188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CENPBD1B2RD01 SPRYD7-202ENST00000378195 3086 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CENPBD1B2RD01 CGB7-202ENST00000596965 1949 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.8 ms