Protein–RNA interactions for Protein: A8MVJ9

Putative histone PARylation factor 1-like, humanhuman

Predictions only

Length 347 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A8MVJ9 CFC1B-203ENST00000620207 1444 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
A8MVJ9 CFC1-203ENST00000621673 1444 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
A8MVJ9 CACNG7-201ENST00000222212 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
A8MVJ9 PRSS38-201ENST00000366757 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
A8MVJ9 C1orf43-204ENST00000368518 1278 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
A8MVJ9 CYCS-202ENST00000409409 974 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
A8MVJ9 LSM5-204ENST00000409909 740 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
A8MVJ9 CAMTA1-IT1-201ENST00000427317 365 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
A8MVJ9 ZNF436-AS1-203ENST00000454117 997 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
A8MVJ9 AL133343.2-201ENST00000457213 370 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
A8MVJ9 HOXB-AS2-201ENST00000464382 845 ntTSL 4 BASIC16.4■□□□□ 0.22
A8MVJ9 AC136604.3-201ENST00000508188 429 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
A8MVJ9 ZBED5-AS1-202ENST00000529014 771 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
A8MVJ9 ADA-207ENST00000537820 1128 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
A8MVJ9 AC020934.1-201ENST00000588469 739 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
A8MVJ9 AC011467.2-201ENST00000598425 242 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
A8MVJ9 LINC00454-206ENST00000609861 841 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
A8MVJ9 REXO1L6P-202ENST00000619970 1078 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
A8MVJ9 KIAA1324L-207ENST00000444627 3527 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
A8MVJ9 SWAP70-202ENST00000447399 3538 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
A8MVJ9 PROC-201ENST00000234071 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
A8MVJ9 ITGB2-AS1-202ENST00000441379 2282 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
A8MVJ9 EML2-203ENST00000536630 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
A8MVJ9 DNAJC28-203ENST00000402202 1480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
A8MVJ9 WDR90-215ENST00000549091 5589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
A8MVJ9 MAPKAP1-208ENST00000394063 2977 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
A8MVJ9 RAB8A-201ENST00000300935 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
A8MVJ9 TRMT44-205ENST00000513449 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
A8MVJ9 LCAT-201ENST00000264005 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
A8MVJ9 AC126755.2-202ENST00000427999 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
A8MVJ9 WNK1-206ENST00000535572 9886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
A8MVJ9 SLC10A3-203ENST00000393586 1893 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.22
A8MVJ9 SEPT11-209ENST00000510515 1886 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.22
A8MVJ9 MAIP1-202ENST00000392290 1386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
A8MVJ9 MICA-209ENST00000449934 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
A8MVJ9 NAA50-209ENST00000497525 1385 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
A8MVJ9 PPOX-202ENST00000367999 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
A8MVJ9 LPAR3-201ENST00000370611 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
A8MVJ9 MEST-202ENST00000341441 2443 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
A8MVJ9 AC016396.2-201ENST00000562575 1417 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
A8MVJ9 TNFAIP3-207ENST00000614035 1430 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
A8MVJ9 DOCK7-203ENST00000404627 2678 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
A8MVJ9 PCDH7-206ENST00000543491 4457 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
A8MVJ9 EXD3-201ENST00000340951 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
A8MVJ9 P2RY6-209ENST00000540342 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
A8MVJ9 TMEM234-202ENST00000344461 721 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
A8MVJ9 EMD-201ENST00000369835 966 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
A8MVJ9 CD99-205ENST00000381192 1245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
A8MVJ9 MYL6-203ENST00000536128 1221 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
A8MVJ9 AC135586.2-201ENST00000537262 567 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.39■□□□□ 0.21
A8MVJ9 AC015712.1-203ENST00000559331 593 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
A8MVJ9 ATP6V0C-202ENST00000564973 1081 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
A8MVJ9 AC010632.1-201ENST00000590376 572 ntTSL 4 BASIC16.39■□□□□ 0.21
A8MVJ9 C19orf25-210ENST00000591027 574 ntTSL 4 BASIC16.39■□□□□ 0.21
A8MVJ9 ZNF554-204ENST00000591265 1148 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
A8MVJ9 TMED1-207ENST00000591695 809 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
A8MVJ9 KLK8-205ENST00000593490 267 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
A8MVJ9 SEH1L-202ENST00000399892 1846 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
A8MVJ9 LRPPRC-203ENST00000409946 1848 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
A8MVJ9 SH2B1-216ENST00000618521 2935 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
A8MVJ9 LINC00847-201ENST00000501855 1871 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
A8MVJ9 CACNG5-202ENST00000533854 1311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
A8MVJ9 NCOA5-201ENST00000290231 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
A8MVJ9 AL445238.1-203ENST00000606050 1525 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
A8MVJ9 PHKA1-201ENST00000339490 6121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
A8MVJ9 ISLR2-203ENST00000435464 4259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
A8MVJ9 PPP2R5B-201ENST00000164133 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
A8MVJ9 TM2D3-201ENST00000333202 1381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
A8MVJ9 CAMK1D-201ENST00000378845 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
A8MVJ9 PML-206ENST00000395135 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
A8MVJ9 ZNF286A-204ENST00000464847 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
A8MVJ9 PCDHA7-202ENST00000525929 5221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
A8MVJ9 ZBTB10-202ENST00000426744 9878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
A8MVJ9 ETNK2-202ENST00000367201 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
A8MVJ9 GRB7-201ENST00000309156 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
A8MVJ9 OSGIN1-202ENST00000361711 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
A8MVJ9 LYPLA2-205ENST00000374514 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
A8MVJ9 SLBP-202ENST00000429429 1623 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
A8MVJ9 CDCP2-202ENST00000530059 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
A8MVJ9 SENP5-201ENST00000323460 6308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
A8MVJ9 PRPF31-203ENST00000419967 2269 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
A8MVJ9 TBXAS1-206ENST00000425687 2080 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
A8MVJ9 COL4A2-201ENST00000360467 6281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
A8MVJ9 PTRHD1-201ENST00000328379 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
A8MVJ9 COX5BP2-201ENST00000392354 334 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
A8MVJ9 AQP12A-202ENST00000429564 1110 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
A8MVJ9 AC132008.2-207ENST00000454517 770 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
A8MVJ9 NOP16-205ENST00000509257 1000 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
A8MVJ9 AC012645.3-201ENST00000568506 470 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
A8MVJ9 AC114488.2-214ENST00000609033 813 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
A8MVJ9 AL031008.1-201ENST00000619963 541 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
A8MVJ9 HNF1B-206ENST00000620125 1103 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
A8MVJ9 CLEC18C-201ENST00000314151 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
A8MVJ9 INTS4P1-201ENST00000438455 1935 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
A8MVJ9 CLEC18A-208ENST00000568461 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
A8MVJ9 AL079303.2-201ENST00000555107 2613 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
A8MVJ9 C14orf93-204ENST00000397377 1776 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
A8MVJ9 CALB2-202ENST00000349553 1373 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
A8MVJ9 FAM237A-203ENST00000543490 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
A8MVJ9 RTCA-203ENST00000370128 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.9 ms