Protein–RNA interactions for Protein: A8MTQ0

NOTO, Homeobox protein notochord, humanhuman

Predictions only

Length 251 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NOTOA8MTQ0 F2RL1-201ENST00000296677 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NOTOA8MTQ0 BBS7-204ENST00000506636 2570 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NOTOA8MTQ0 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
NOTOA8MTQ0 CYLD-202ENST00000398568 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NOTOA8MTQ0 ZNF212-201ENST00000335870 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NOTOA8MTQ0 C1orf115-201ENST00000294889 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NOTOA8MTQ0 ANHX-201ENST00000419717 1765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
NOTOA8MTQ0 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NOTOA8MTQ0 MIB2-217ENST00000504599 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
NOTOA8MTQ0 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
NOTOA8MTQ0 AC005915.1-201ENST00000624912 2018 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
NOTOA8MTQ0 SLC29A1-203ENST00000371724 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
NOTOA8MTQ0 SHISA9-203ENST00000558583 6724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
NOTOA8MTQ0 SMARCA4-203ENST00000429416 5691 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
NOTOA8MTQ0 THAP8-201ENST00000292894 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NOTOA8MTQ0 AL662899.1-201ENST00000461287 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
NOTOA8MTQ0 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NOTOA8MTQ0 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
NOTOA8MTQ0 TRIM17-201ENST00000295033 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NOTOA8MTQ0 TRIM17-204ENST00000366698 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NOTOA8MTQ0 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
NOTOA8MTQ0 ZDHHC9-202ENST00000371064 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NOTOA8MTQ0 ARNT2-204ENST00000527771 2458 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
NOTOA8MTQ0 PCIF1-201ENST00000372409 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NOTOA8MTQ0 FHL1-207ENST00000394155 2706 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
NOTOA8MTQ0 PTGES2-201ENST00000277462 1614 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
NOTOA8MTQ0 HADHB-208ENST00000537713 2142 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
NOTOA8MTQ0 PELP1-208ENST00000572293 5272 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NOTOA8MTQ0 WASHC2C-209ENST00000540872 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NOTOA8MTQ0 FAM227B-201ENST00000299338 2008 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
NOTOA8MTQ0 MORN1-203ENST00000378531 1798 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
NOTOA8MTQ0 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NOTOA8MTQ0 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NOTOA8MTQ0 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NOTOA8MTQ0 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NOTOA8MTQ0 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
NOTOA8MTQ0 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NOTOA8MTQ0 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NOTOA8MTQ0 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
NOTOA8MTQ0 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NOTOA8MTQ0 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
NOTOA8MTQ0 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
NOTOA8MTQ0 AC002985.2-201ENST00000601106 957 ntTSL 4 BASIC15.4■□□□□ 0.06
NOTOA8MTQ0 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
NOTOA8MTQ0 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
NOTOA8MTQ0 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
NOTOA8MTQ0 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
NOTOA8MTQ0 UBE3D-203ENST00000369747 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NOTOA8MTQ0 MIOX-202ENST00000395732 1658 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NOTOA8MTQ0 AC116353.5-201ENST00000638148 1699 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
NOTOA8MTQ0 CD72-211ENST00000612238 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
NOTOA8MTQ0 AL162586.1-201ENST00000439298 2055 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
NOTOA8MTQ0 PKLR-202ENST00000392414 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NOTOA8MTQ0 SLIT1-204ENST00000371070 4564 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
NOTOA8MTQ0 KCNQ2-204ENST00000359125 3253 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NOTOA8MTQ0 FAM222B-211ENST00000582266 2613 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NOTOA8MTQ0 KCNMA1-201ENST00000286627 6194 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NOTOA8MTQ0 SLC18B1-201ENST00000275227 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NOTOA8MTQ0 PRAG1-202ENST00000622241 4639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
NOTOA8MTQ0 TACR3-201ENST00000304883 5190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NOTOA8MTQ0 PDAP1-201ENST00000350498 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NOTOA8MTQ0 HIP1R-201ENST00000253083 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NOTOA8MTQ0 IPO8-201ENST00000256079 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NOTOA8MTQ0 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NOTOA8MTQ0 AP2A2-201ENST00000332231 4656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NOTOA8MTQ0 NDOR1-202ENST00000371521 2497 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NOTOA8MTQ0 SLC6A11-201ENST00000254488 4296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NOTOA8MTQ0 EPHA10-203ENST00000427468 3167 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
NOTOA8MTQ0 RABGGTA-201ENST00000216840 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NOTOA8MTQ0 NUP50-203ENST00000407019 2059 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NOTOA8MTQ0 HOXC12-201ENST00000243103 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NOTOA8MTQ0 AC073324.2-201ENST00000626532 2941 ntTSL 4 BASIC15.39■□□□□ 0.05
NOTOA8MTQ0 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
NOTOA8MTQ0 ANTXRL-206ENST00000622632 1964 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
NOTOA8MTQ0 MBD1-202ENST00000269471 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
NOTOA8MTQ0 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NOTOA8MTQ0 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
NOTOA8MTQ0 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NOTOA8MTQ0 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NOTOA8MTQ0 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
NOTOA8MTQ0 MIR3936HG-202ENST00000457998 733 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
NOTOA8MTQ0 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
NOTOA8MTQ0 C14orf144-201ENST00000553757 537 ntTSL 4 BASIC15.39■□□□□ 0.05
NOTOA8MTQ0 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
NOTOA8MTQ0 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
NOTOA8MTQ0 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
NOTOA8MTQ0 AC010240.3-201ENST00000607688 395 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
NOTOA8MTQ0 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
NOTOA8MTQ0 MTA2-204ENST00000527204 2265 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
NOTOA8MTQ0 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NOTOA8MTQ0 GNB4-201ENST00000232564 6434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NOTOA8MTQ0 CICP14-201ENST00000629111 2732 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
NOTOA8MTQ0 PRKD2-206ENST00000595515 3012 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
NOTOA8MTQ0 TTC24-201ENST00000368236 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
NOTOA8MTQ0 LINC01250-201ENST00000457478 2344 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
NOTOA8MTQ0 POLR3E-202ENST00000359210 2469 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NOTOA8MTQ0 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NOTOA8MTQ0 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NOTOA8MTQ0 AL079301.1-201ENST00000424580 1633 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
NOTOA8MTQ0 ADGRG3-202ENST00000450388 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.6 ms