Protein–RNA interactions for Protein: A6NGN4

PRAMEF25, PRAME family member 25, humanhuman

Predictions only

Length 478 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAMEF25A6NGN4 KRT28-201ENST00000306658 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
PRAMEF25A6NGN4 CNTNAP3-205ENST00000377659 2649 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
PRAMEF25A6NGN4 ZBTB33-201ENST00000326624 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
PRAMEF25A6NGN4 NADK2-206ENST00000506945 1437 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
PRAMEF25A6NGN4 SLC9A6-208ENST00000636206 4711 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
PRAMEF25A6NGN4 CCDC78-201ENST00000293889 1611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
PRAMEF25A6NGN4 FOXE1-201ENST00000375123 3462 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.19
PRAMEF25A6NGN4 CHST11-205ENST00000549260 5696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PRAMEF25A6NGN4 C14orf28-201ENST00000325192 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PRAMEF25A6NGN4 CAMK1D-201ENST00000378845 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PRAMEF25A6NGN4 TBX18-202ENST00000369663 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PRAMEF25A6NGN4 ZNF385A-203ENST00000394313 2430 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PRAMEF25A6NGN4 SRSF1-201ENST00000258962 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PRAMEF25A6NGN4 PYCR2-208ENST00000612039 1549 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PRAMEF25A6NGN4 PYCR2-209ENST00000612651 1538 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PRAMEF25A6NGN4 HSD17B12-201ENST00000278353 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PRAMEF25A6NGN4 UBE3D-203ENST00000369747 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PRAMEF25A6NGN4 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PRAMEF25A6NGN4 PRMT2-201ENST00000291705 1011 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PRAMEF25A6NGN4 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PRAMEF25A6NGN4 CDKN1C-201ENST00000380725 1220 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PRAMEF25A6NGN4 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PRAMEF25A6NGN4 FAM220CP-201ENST00000395253 831 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
PRAMEF25A6NGN4 KRTAP5-11-201ENST00000398530 1021 ntAPPRIS P2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PRAMEF25A6NGN4 ELOB-202ENST00000409477 997 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PRAMEF25A6NGN4 METTL21A-205ENST00000426075 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PRAMEF25A6NGN4 THAP5-204ENST00000438865 868 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PRAMEF25A6NGN4 SDHD-206ENST00000528182 754 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PRAMEF25A6NGN4 ERCC5-207ENST00000535557 1125 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PRAMEF25A6NGN4 EFCAB11-211ENST00000556609 568 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PRAMEF25A6NGN4 RNPS1-224ENST00000569598 918 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PRAMEF25A6NGN4 CTDNEP1-207ENST00000572043 857 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PRAMEF25A6NGN4 NOL12-207ENST00000611699 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PRAMEF25A6NGN4 PRSS16-201ENST00000230582 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PRAMEF25A6NGN4 TRMT44-205ENST00000513449 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PRAMEF25A6NGN4 CELF6-204ENST00000543764 1676 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PRAMEF25A6NGN4 ZNF786-201ENST00000316286 3144 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PRAMEF25A6NGN4 ADCYAP1R1-203ENST00000409363 1889 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PRAMEF25A6NGN4 NCAPH2-203ENST00000395701 2077 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PRAMEF25A6NGN4 VPS37A-201ENST00000324849 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PRAMEF25A6NGN4 F12-201ENST00000253496 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PRAMEF25A6NGN4 TRPV4-205ENST00000537083 2436 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PRAMEF25A6NGN4 PLBD2-201ENST00000280800 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PRAMEF25A6NGN4 NINL-201ENST00000278886 4969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PRAMEF25A6NGN4 PFKP-202ENST00000381075 2769 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PRAMEF25A6NGN4 SERPINA4-202ENST00000555095 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PRAMEF25A6NGN4 CXorf58-201ENST00000379211 1752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PRAMEF25A6NGN4 AC010460.3-201ENST00000511359 1579 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
PRAMEF25A6NGN4 LARP4-210ENST00000522085 1577 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PRAMEF25A6NGN4 PIGX-202ENST00000392391 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PRAMEF25A6NGN4 KIFC2-201ENST00000301332 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PRAMEF25A6NGN4 PLTP-202ENST00000372420 1530 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PRAMEF25A6NGN4 BET1L-203ENST00000382762 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PRAMEF25A6NGN4 NSFL1C-202ENST00000353088 2611 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PRAMEF25A6NGN4 SGPP2-201ENST00000321276 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PRAMEF25A6NGN4 SEH1L-202ENST00000399892 1846 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PRAMEF25A6NGN4 SUSD4-208ENST00000494793 1833 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PRAMEF25A6NGN4 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PRAMEF25A6NGN4 ID2-202ENST00000331129 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PRAMEF25A6NGN4 SEC61G-203ENST00000415949 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PRAMEF25A6NGN4 KRT16P4-201ENST00000453883 522 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
PRAMEF25A6NGN4 TOLLIP-AS1-201ENST00000530897 939 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
PRAMEF25A6NGN4 ADA-207ENST00000537820 1128 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PRAMEF25A6NGN4 SPAG7-207ENST00000575142 1094 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PRAMEF25A6NGN4 AC008735.1-201ENST00000592252 802 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PRAMEF25A6NGN4 SMN2-213ENST00000614240 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PRAMEF25A6NGN4 ANKRD6-202ENST00000369408 5258 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PRAMEF25A6NGN4 HYAL3-202ENST00000359051 1635 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PRAMEF25A6NGN4 LINC01148-201ENST00000557527 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PRAMEF25A6NGN4 SDCBP2-204ENST00000381812 1550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PRAMEF25A6NGN4 PTPRA-205ENST00000399903 3337 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PRAMEF25A6NGN4 DFNA5-207ENST00000419307 2265 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PRAMEF25A6NGN4 GJA3-201ENST00000241125 5211 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PRAMEF25A6NGN4 C1QTNF1-202ENST00000339142 3100 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PRAMEF25A6NGN4 CACNA1A-225ENST00000636389 8137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PRAMEF25A6NGN4 SRPX-202ENST00000432886 1725 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PRAMEF25A6NGN4 EWSAT1-206ENST00000558922 1725 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PRAMEF25A6NGN4 YDJC-201ENST00000292778 1351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PRAMEF25A6NGN4 AC011840.1-202ENST00000436477 1351 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PRAMEF25A6NGN4 TBC1D30-203ENST00000539867 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PRAMEF25A6NGN4 PDPK2P-201ENST00000382326 2387 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PRAMEF25A6NGN4 DCHS2-201ENST00000339452 5064 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PRAMEF25A6NGN4 GUCY1A2-202ENST00000347596 2532 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PRAMEF25A6NGN4 CLDN14-203ENST00000399136 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PRAMEF25A6NGN4 ARL13B-203ENST00000394222 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PRAMEF25A6NGN4 IL6R-202ENST00000368485 5914 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PRAMEF25A6NGN4 RANBP9-201ENST00000011619 3113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PRAMEF25A6NGN4 TRAF2-201ENST00000247668 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PRAMEF25A6NGN4 ADM-208ENST00000534464 1640 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PRAMEF25A6NGN4 UBL3-201ENST00000380680 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PRAMEF25A6NGN4 CNTNAP3B-201ENST00000276974 3240 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PRAMEF25A6NGN4 ITGA6-201ENST00000264107 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PRAMEF25A6NGN4 NRXN2-202ENST00000301894 3535 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PRAMEF25A6NGN4 KRT86-201ENST00000293525 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PRAMEF25A6NGN4 TBXAS1-206ENST00000425687 2080 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PRAMEF25A6NGN4 EDN3-203ENST00000371025 1153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PRAMEF25A6NGN4 RCN1P2-201ENST00000398357 915 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
PRAMEF25A6NGN4 UFD1-202ENST00000399523 1007 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PRAMEF25A6NGN4 TSPY19P-201ENST00000418461 509 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
PRAMEF25A6NGN4 TSPY18P-201ENST00000441642 509 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.7 ms