Protein–RNA interactions for Protein: A0AVK6

E2F8, Transcription factor E2F8, humanhuman

Predictions only

Length 867 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2F8A0AVK6 GNE-204ENST00000539208 2190 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
E2F8A0AVK6 CDH24-204ENST00000487137 3438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
E2F8A0AVK6 AC139713.2-201ENST00000641328 2723 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
E2F8A0AVK6 TNFAIP1-202ENST00000544907 1656 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
E2F8A0AVK6 FIP1L1-207ENST00000507922 1335 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
E2F8A0AVK6 SLC39A1-210ENST00000617697 2214 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
E2F8A0AVK6 DLGAP1-222ENST00000639615 1898 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
E2F8A0AVK6 KRT18P55-202ENST00000578578 1546 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
E2F8A0AVK6 CLDN9-201ENST00000445369 2050 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
E2F8A0AVK6 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
E2F8A0AVK6 ELN-202ENST00000320399 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
E2F8A0AVK6 SUPT20H-202ENST00000356185 2681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
E2F8A0AVK6 LRRC20-203ENST00000358141 2924 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
E2F8A0AVK6 LYRM9-203ENST00000460380 2196 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
E2F8A0AVK6 CEBPG-201ENST00000284000 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
E2F8A0AVK6 RNPS1-205ENST00000561718 1806 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
E2F8A0AVK6 SNTB1-201ENST00000395601 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
E2F8A0AVK6 DUSP12-201ENST00000367943 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
E2F8A0AVK6 AL355310.2-201ENST00000369843 688 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
E2F8A0AVK6 MRPL23-201ENST00000381514 919 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
E2F8A0AVK6 CLDN14-205ENST00000399139 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
E2F8A0AVK6 CENPM-204ENST00000402420 688 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
E2F8A0AVK6 KLF4P1-201ENST00000412782 1185 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
E2F8A0AVK6 KRT18P27-201ENST00000427733 1299 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
E2F8A0AVK6 AC134772.1-202ENST00000435578 549 ntTSL 4 BASIC18.17■□□□□ 0.5
E2F8A0AVK6 AL807752.7-201ENST00000471521 989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
E2F8A0AVK6 RNA5SP415-201ENST00000517246 115 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
E2F8A0AVK6 AC109462.3-201ENST00000573934 613 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
E2F8A0AVK6 SDCCAG3P1-201ENST00000589292 1150 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
E2F8A0AVK6 CYGB-205ENST00000590175 830 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
E2F8A0AVK6 COPE-211ENST00000600932 1144 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
E2F8A0AVK6 CHGA-202ENST00000334654 1474 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
E2F8A0AVK6 AP002414.3-201ENST00000589352 1468 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
E2F8A0AVK6 CSF3-202ENST00000331769 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
E2F8A0AVK6 CD14-201ENST00000302014 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
E2F8A0AVK6 MPP2-206ENST00000518766 1896 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
E2F8A0AVK6 ETFBKMT-202ENST00000395763 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
E2F8A0AVK6 CHTOP-201ENST00000368686 2250 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
E2F8A0AVK6 POLR1D-221ENST00000637180 2262 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
E2F8A0AVK6 COL4A2-201ENST00000360467 6281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
E2F8A0AVK6 DENND6B-201ENST00000413817 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
E2F8A0AVK6 NAA60-201ENST00000360862 2522 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
E2F8A0AVK6 CORO6-210ENST00000580212 2345 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
E2F8A0AVK6 SATB2-203ENST00000428695 2135 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
E2F8A0AVK6 MIF4GD-204ENST00000577542 1531 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
E2F8A0AVK6 ENPP1-201ENST00000360971 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
E2F8A0AVK6 CLN3-216ENST00000565316 1318 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
E2F8A0AVK6 ZBTB4-202ENST00000380599 5866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
E2F8A0AVK6 RASL11B-201ENST00000248706 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
E2F8A0AVK6 PITPNM2-209ENST00000546049 1793 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
E2F8A0AVK6 FOLH1-204ENST00000356696 2403 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
E2F8A0AVK6 SWAP70-202ENST00000447399 3538 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
E2F8A0AVK6 LRCH3-201ENST00000334859 2258 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
E2F8A0AVK6 CLUH-201ENST00000435359 5224 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
E2F8A0AVK6 KDM6A-213ENST00000611820 5924 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
E2F8A0AVK6 MTHFD1L-211ENST00000611279 3475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
E2F8A0AVK6 METTL21A-203ENST00000411432 4805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
E2F8A0AVK6 EDA-204ENST00000374553 5272 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
E2F8A0AVK6 METTL9-201ENST00000358154 3256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
E2F8A0AVK6 PLD3-206ENST00000409587 2180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
E2F8A0AVK6 PIH1D1-201ENST00000262265 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
E2F8A0AVK6 GUK1-202ENST00000366716 940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
E2F8A0AVK6 OPN1LW-201ENST00000369951 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
E2F8A0AVK6 GYG2P1-204ENST00000382966 639 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
E2F8A0AVK6 NDUFB2-208ENST00000471136 499 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
E2F8A0AVK6 IGHV3-52-201ENST00000519770 353 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
E2F8A0AVK6 AC068389.2-201ENST00000529518 430 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
E2F8A0AVK6 H2AFJ-203ENST00000544848 644 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
E2F8A0AVK6 AC034105.1-201ENST00000563488 319 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
E2F8A0AVK6 NUBP2-214ENST00000568706 913 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
E2F8A0AVK6 MNT-208ENST00000575394 606 ntTSL 4 BASIC18.16■□□□□ 0.5
E2F8A0AVK6 AC107896.1-201ENST00000593212 548 ntTSL 4 BASIC18.16■□□□□ 0.5
E2F8A0AVK6 FAM71E1-202ENST00000595790 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
E2F8A0AVK6 Z83851.2-201ENST00000609564 659 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
E2F8A0AVK6 MIR1199-201ENST00000621445 119 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
E2F8A0AVK6 PEX13-204ENST00000444100 1533 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
E2F8A0AVK6 PPT2-247ENST00000375143 1754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
E2F8A0AVK6 TOM1L2-203ENST00000395739 1766 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
E2F8A0AVK6 NEU1-206ENST00000375631 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
E2F8A0AVK6 ESM1-201ENST00000381403 1326 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
E2F8A0AVK6 TSPYL5-201ENST00000322128 4491 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
E2F8A0AVK6 THNSL2-203ENST00000377254 1560 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
E2F8A0AVK6 SYDE2-202ENST00000341460 5512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
E2F8A0AVK6 CTSA-204ENST00000372484 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
E2F8A0AVK6 FLOT2-202ENST00000394908 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
E2F8A0AVK6 ZCWPW1-202ENST00000398027 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
E2F8A0AVK6 ROCK2-209ENST00000616279 6401 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
E2F8A0AVK6 TCIRG1-201ENST00000265686 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
E2F8A0AVK6 ADGRG2-202ENST00000354791 4494 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
E2F8A0AVK6 BPIFB4-201ENST00000375483 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
E2F8A0AVK6 TOM1L2-207ENST00000535933 1748 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
E2F8A0AVK6 BTG3-202ENST00000348354 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
E2F8A0AVK6 AC062028.1-203ENST00000447433 1472 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
E2F8A0AVK6 NKIRAS2-207ENST00000449471 1461 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
E2F8A0AVK6 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
E2F8A0AVK6 GSTZ1-202ENST00000349555 867 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
E2F8A0AVK6 AC078883.2-201ENST00000441212 558 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
E2F8A0AVK6 SIGLEC30P-201ENST00000455569 941 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
E2F8A0AVK6 POLD2P1-201ENST00000511220 997 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
E2F8A0AVK6 AC067930.3-201ENST00000524808 701 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.1 ms