Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6R4

MAP3K4, Mitogen-activated protein kinase kinase kinase 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,608 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MAP3K4Q9Y6R4 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
MAP3K4Q9Y6R4 AC090206.1-201ENST00000615734 1678 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
MAP3K4Q9Y6R4 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
MAP3K4Q9Y6R4 BEND5-201ENST00000371833 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
MAP3K4Q9Y6R4 BAGE2-202ENST00000474011 1482 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
MAP3K4Q9Y6R4 AL353732.1-201ENST00000569618 1459 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
MAP3K4Q9Y6R4 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
MAP3K4Q9Y6R4 MFF-201ENST00000304593 2004 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
MAP3K4Q9Y6R4 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
MAP3K4Q9Y6R4 SCAND1-201ENST00000305978 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
MAP3K4Q9Y6R4 WWOX-201ENST00000355860 710 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
MAP3K4Q9Y6R4 CDKN1A-202ENST00000373711 793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
MAP3K4Q9Y6R4 RAC2-203ENST00000405484 842 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC26.03■■□□□ 1.76
MAP3K4Q9Y6R4 AL353597.1-201ENST00000414875 998 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
MAP3K4Q9Y6R4 GGTLC2-202ENST00000448514 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
MAP3K4Q9Y6R4 CACNA2D4-208ENST00000538027 952 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
MAP3K4Q9Y6R4 AC092552.1-201ENST00000547243 906 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
MAP3K4Q9Y6R4 AL138918.1-201ENST00000568306 659 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
MAP3K4Q9Y6R4 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
MAP3K4Q9Y6R4 SNRPN-201ENST00000346403 1304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
MAP3K4Q9Y6R4 ASNA1-204ENST00000591090 1368 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
MAP3K4Q9Y6R4 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
MAP3K4Q9Y6R4 BHMT2-205ENST00000521567 1537 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
MAP3K4Q9Y6R4 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
MAP3K4Q9Y6R4 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
MAP3K4Q9Y6R4 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
MAP3K4Q9Y6R4 ZDHHC12-201ENST00000372663 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
MAP3K4Q9Y6R4 PRAF2-201ENST00000376386 801 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
MAP3K4Q9Y6R4 SZT2-AS1-201ENST00000396885 699 ntTSL 3 BASIC26.03■■□□□ 1.76
MAP3K4Q9Y6R4 SPDYE18-201ENST00000510091 1050 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
MAP3K4Q9Y6R4 AC008115.1-201ENST00000542291 150 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
MAP3K4Q9Y6R4 AC005520.2-201ENST00000556194 573 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
MAP3K4Q9Y6R4 TMEM106C-203ENST00000449758 1414 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
MAP3K4Q9Y6R4 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
MAP3K4Q9Y6R4 FBLIM1-201ENST00000332305 1530 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
MAP3K4Q9Y6R4 SLC22A20-204ENST00000530038 1673 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
MAP3K4Q9Y6R4 SRPK3-201ENST00000370100 1717 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
MAP3K4Q9Y6R4 NPM2-203ENST00000397940 1874 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
MAP3K4Q9Y6R4 SERPINB6-208ENST00000616722 2047 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
MAP3K4Q9Y6R4 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
MAP3K4Q9Y6R4 RN7SL752P-201ENST00000463779 287 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
MAP3K4Q9Y6R4 AC003101.2-201ENST00000612557 442 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
MAP3K4Q9Y6R4 MALAT1-211ENST00000617791 394 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
MAP3K4Q9Y6R4 CALM1-216ENST00000626705 1341 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
MAP3K4Q9Y6R4 STX3-203ENST00000529177 1571 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
MAP3K4Q9Y6R4 SEPT8-205ENST00000378701 1817 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
MAP3K4Q9Y6R4 NAT6-205ENST00000443842 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
MAP3K4Q9Y6R4 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
MAP3K4Q9Y6R4 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
MAP3K4Q9Y6R4 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
MAP3K4Q9Y6R4 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
MAP3K4Q9Y6R4 ZNF138-201ENST00000307355 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC26.01■■□□□ 1.75
MAP3K4Q9Y6R4 MFAP2-201ENST00000375534 970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
MAP3K4Q9Y6R4 ING1-204ENST00000375775 1074 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
MAP3K4Q9Y6R4 SLC35G6-201ENST00000412468 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
MAP3K4Q9Y6R4 SLC7A15P-201ENST00000424028 1363 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
MAP3K4Q9Y6R4 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
MAP3K4Q9Y6R4 C8orf46-205ENST00000480005 865 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
MAP3K4Q9Y6R4 ROPN1-207ENST00000484329 566 ntTSL 3 BASIC26.01■■□□□ 1.75
MAP3K4Q9Y6R4 LINC01184-209ENST00000514573 609 ntTSL 3 BASIC26.01■■□□□ 1.75
MAP3K4Q9Y6R4 IL32-232ENST00000552356 623 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.01■■□□□ 1.75
MAP3K4Q9Y6R4 AC046168.2-201ENST00000560590 875 ntTSL 3 BASIC26.01■■□□□ 1.75
MAP3K4Q9Y6R4 LLGL2-209ENST00000578363 1393 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
MAP3K4Q9Y6R4 AC087645.2-202ENST00000586583 643 ntTSL 4 BASIC26.01■■□□□ 1.75
MAP3K4Q9Y6R4 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
MAP3K4Q9Y6R4 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
MAP3K4Q9Y6R4 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
MAP3K4Q9Y6R4 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
MAP3K4Q9Y6R4 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
MAP3K4Q9Y6R4 AC004951.4-201ENST00000454572 2076 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
MAP3K4Q9Y6R4 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
MAP3K4Q9Y6R4 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
MAP3K4Q9Y6R4 RPF1-202ENST00000370656 724 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
MAP3K4Q9Y6R4 ASMT-201ENST00000381229 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
MAP3K4Q9Y6R4 MSC-AS1-206ENST00000519751 596 ntTSL 4 BASIC26■■□□□ 1.75
MAP3K4Q9Y6R4 CHCHD2P3-201ENST00000603038 451 ntBASIC26■■□□□ 1.75
MAP3K4Q9Y6R4 PHOSPHO2-207ENST00000616524 1253 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26■■□□□ 1.75
MAP3K4Q9Y6R4 COX11-210ENST00000639671 696 ntBASIC26■■□□□ 1.75
MAP3K4Q9Y6R4 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
MAP3K4Q9Y6R4 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
MAP3K4Q9Y6R4 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
MAP3K4Q9Y6R4 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
MAP3K4Q9Y6R4 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
MAP3K4Q9Y6R4 PSMD4-201ENST00000368881 1333 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
MAP3K4Q9Y6R4 ANKRD19P-201ENST00000338192 862 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
MAP3K4Q9Y6R4 CENPM-206ENST00000407253 818 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
MAP3K4Q9Y6R4 AL122035.1-201ENST00000556640 550 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
MAP3K4Q9Y6R4 ORC6-206ENST00000568364 888 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
MAP3K4Q9Y6R4 AL512343.1-201ENST00000605837 169 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
MAP3K4Q9Y6R4 AC068587.10-201ENST00000641210 219 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
MAP3K4Q9Y6R4 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
MAP3K4Q9Y6R4 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
MAP3K4Q9Y6R4 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
MAP3K4Q9Y6R4 CETN4P-206ENST00000642099 2168 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
MAP3K4Q9Y6R4 SLC25A35-205ENST00000580340 1541 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
MAP3K4Q9Y6R4 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
MAP3K4Q9Y6R4 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
MAP3K4Q9Y6R4 PPT2-247ENST00000375143 1754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
MAP3K4Q9Y6R4 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
MAP3K4Q9Y6R4 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69.2 ms