Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y620

RAD54B, DNA repair and recombination protein RAD54B, humanhuman

Predictions only

Length 910 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAD54BQ9Y620 NOTCH2NL-201ENST00000362074 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
RAD54BQ9Y620 MCCC1-201ENST00000265594 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
RAD54BQ9Y620 GTPBP8-203ENST00000383678 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
RAD54BQ9Y620 C16orf70-208ENST00000569600 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
RAD54BQ9Y620 ANAPC11-211ENST00000575195 1361 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
RAD54BQ9Y620 RNF169-201ENST00000299563 7823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
RAD54BQ9Y620 ZNF280D-205ENST00000559000 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
RAD54BQ9Y620 CROCCP2-202ENST00000412962 2773 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
RAD54BQ9Y620 LRRC20-203ENST00000358141 2924 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
RAD54BQ9Y620 C9orf66-201ENST00000382387 2918 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
RAD54BQ9Y620 SLC30A2-202ENST00000374278 3097 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
RAD54BQ9Y620 EVPL-202ENST00000586740 6223 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
RAD54BQ9Y620 LINC00957-202ENST00000441052 2590 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
RAD54BQ9Y620 TMEM216-201ENST00000334888 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
RAD54BQ9Y620 FCER2-202ENST00000360067 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
RAD54BQ9Y620 IFNL4-204ENST00000634967 1493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
RAD54BQ9Y620 CHRD-202ENST00000348986 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
RAD54BQ9Y620 LAT-203ENST00000395456 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
RAD54BQ9Y620 TRAPPC2L-201ENST00000301021 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
RAD54BQ9Y620 WIPF2-210ENST00000585043 2693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
RAD54BQ9Y620 GGT5-201ENST00000263112 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
RAD54BQ9Y620 NXPH2-201ENST00000272641 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
RAD54BQ9Y620 ING5-201ENST00000313552 5196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
RAD54BQ9Y620 SOD2-201ENST00000337404 991 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
RAD54BQ9Y620 QRFP-201ENST00000343079 411 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
RAD54BQ9Y620 RPA2-202ENST00000373909 1162 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
RAD54BQ9Y620 KRT18P13-201ENST00000400056 1290 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
RAD54BQ9Y620 NEIL2-202ENST00000403422 2016 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
RAD54BQ9Y620 USH1C-205ENST00000527020 2159 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
RAD54BQ9Y620 MTHFSD-203ENST00000543303 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
RAD54BQ9Y620 AC092865.5-201ENST00000545435 363 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
RAD54BQ9Y620 AC055811.1-201ENST00000584203 1231 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
RAD54BQ9Y620 AC087645.2-201ENST00000586321 799 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
RAD54BQ9Y620 TK1-204ENST00000590430 683 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
RAD54BQ9Y620 AC104109.2-201ENST00000602919 1418 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
RAD54BQ9Y620 AC117500.6-201ENST00000624871 588 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
RAD54BQ9Y620 MTHFSD-220ENST00000634347 1207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
RAD54BQ9Y620 GCSH-209ENST00000639689 2412 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
RAD54BQ9Y620 SAR1B-208ENST00000507419 2287 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
RAD54BQ9Y620 FMR1-205ENST00000370475 4308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
RAD54BQ9Y620 SREK1-216ENST00000612404 2128 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
RAD54BQ9Y620 ZNF259P1-201ENST00000407656 1365 ntBASIC18.02■□□□□ 0.47
RAD54BQ9Y620 ZNF48-206ENST00000622647 2695 ntTSL 4 BASIC18.02■□□□□ 0.47
RAD54BQ9Y620 MTMR1-208ENST00000445323 4516 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
RAD54BQ9Y620 UBL3-201ENST00000380680 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
RAD54BQ9Y620 SNTB1-201ENST00000395601 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
RAD54BQ9Y620 PPP1R9B-202ENST00000612501 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RAD54BQ9Y620 THAP12-201ENST00000260045 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RAD54BQ9Y620 PCDHA13-201ENST00000289272 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RAD54BQ9Y620 AL353593.2-201ENST00000602529 1483 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
RAD54BQ9Y620 ARNTL-205ENST00000403510 2745 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
RAD54BQ9Y620 SCARB2-201ENST00000264896 4792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RAD54BQ9Y620 PDE4D-204ENST00000358923 2969 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RAD54BQ9Y620 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RAD54BQ9Y620 F11R-202ENST00000368026 4835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RAD54BQ9Y620 TCF7-204ENST00000395029 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
RAD54BQ9Y620 MUM1-216ENST00000627377 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
RAD54BQ9Y620 SNTB2-201ENST00000336278 9789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RAD54BQ9Y620 FGFR1-206ENST00000397091 5702 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RAD54BQ9Y620 NEK10-202ENST00000341435 2638 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
RAD54BQ9Y620 POM121L12-201ENST00000408890 1283 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
RAD54BQ9Y620 DMKN-206ENST00000418261 1257 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RAD54BQ9Y620 AC098831.1-202ENST00000438821 336 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
RAD54BQ9Y620 AL807752.7-201ENST00000471521 989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
RAD54BQ9Y620 BX005266.1-201ENST00000473402 457 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
RAD54BQ9Y620 AC009567.1-201ENST00000515071 525 ntTSL 4 BASIC18.01■□□□□ 0.47
RAD54BQ9Y620 AL049869.3-201ENST00000554918 558 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
RAD54BQ9Y620 BLOC1S6-214ENST00000567461 1052 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
RAD54BQ9Y620 MTDHP4-201ENST00000600287 670 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
RAD54BQ9Y620 LCE1E-203ENST00000619588 267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
RAD54BQ9Y620 AL139288.1-201ENST00000623748 933 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
RAD54BQ9Y620 AP000867.4-201ENST00000641616 219 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
RAD54BQ9Y620 NUP153-202ENST00000537253 6030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
RAD54BQ9Y620 NFATC1-210ENST00000587635 2195 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RAD54BQ9Y620 ANHX-201ENST00000419717 1765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
RAD54BQ9Y620 C9orf64-203ENST00000376344 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RAD54BQ9Y620 MIEF2-204ENST00000395706 2441 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RAD54BQ9Y620 RNH1-205ENST00000397615 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RAD54BQ9Y620 SNAP23-201ENST00000249647 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RAD54BQ9Y620 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RAD54BQ9Y620 P2RX5-209ENST00000552276 1642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
RAD54BQ9Y620 SNX2-213ENST00000514949 2119 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
RAD54BQ9Y620 EXOC5-201ENST00000340918 2632 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
RAD54BQ9Y620 STRN4-204ENST00000539396 2608 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
RAD54BQ9Y620 TOR3A-203ENST00000367627 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RAD54BQ9Y620 HAUS8-201ENST00000253669 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RAD54BQ9Y620 CAMK2G-205ENST00000372765 1822 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
RAD54BQ9Y620 RUNX1-207ENST00000437180 5967 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
RAD54BQ9Y620 EPHA10-201ENST00000319637 2050 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RAD54BQ9Y620 DNM3-203ENST00000367733 2322 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RAD54BQ9Y620 HTD2-201ENST00000461393 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RAD54BQ9Y620 ENSA-206ENST00000361631 725 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
RAD54BQ9Y620 FABP5-202ENST00000396359 986 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
RAD54BQ9Y620 CENPM-204ENST00000402420 688 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
RAD54BQ9Y620 AL096828.1-201ENST00000423020 542 ntTSL 4 BASIC18■□□□□ 0.47
RAD54BQ9Y620 B4GALT1-AS1-202ENST00000442432 843 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
RAD54BQ9Y620 MOGAT1-201ENST00000446656 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
RAD54BQ9Y620 IGHV3-22-201ENST00000520721 359 ntBASIC18■□□□□ 0.47
RAD54BQ9Y620 KLK12-203ENST00000525263 1077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RAD54BQ9Y620 AL589182.1-202ENST00000548416 533 ntTSL 4 BASIC18■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.3 ms