Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y4P1

ATG4B, Cysteine protease ATG4B, humanhuman

Predictions only

Length 393 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG4BQ9Y4P1 STXBP3-201ENST00000370008 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ATG4BQ9Y4P1 TEX264-209ENST00000457573 1448 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ATG4BQ9Y4P1 STAP2-201ENST00000594605 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ATG4BQ9Y4P1 CRB3-203ENST00000598494 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ATG4BQ9Y4P1 SIGLEC16-201ENST00000599858 1437 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
ATG4BQ9Y4P1 NOL4L-205ENST00000375678 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ATG4BQ9Y4P1 CCT7-215ENST00000539919 2031 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ATG4BQ9Y4P1 ICAM3-205ENST00000589261 2024 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ATG4BQ9Y4P1 HSF2-202ENST00000452194 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ATG4BQ9Y4P1 MFGE8-201ENST00000268150 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ATG4BQ9Y4P1 RNF222-201ENST00000344001 2786 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ATG4BQ9Y4P1 FBXO7-201ENST00000266087 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ATG4BQ9Y4P1 KCNV2-201ENST00000382082 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ATG4BQ9Y4P1 PRAMEF20-201ENST00000316412 1597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ATG4BQ9Y4P1 AC138969.1-205ENST00000381497 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ATG4BQ9Y4P1 IGSF8-201ENST00000314485 2343 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ATG4BQ9Y4P1 LBX1-AS1-201ENST00000430651 2553 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ATG4BQ9Y4P1 AC093525.9-201ENST00000624961 1746 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
ATG4BQ9Y4P1 SMOX-205ENST00000379460 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ATG4BQ9Y4P1 GALNT14-202ENST00000349752 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ATG4BQ9Y4P1 TBC1D20-201ENST00000354200 4466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ATG4BQ9Y4P1 WTAP-205ENST00000614346 1623 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ATG4BQ9Y4P1 LOXL3-205ENST00000409986 2005 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ATG4BQ9Y4P1 RANBP3-220ENST00000591092 1783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ATG4BQ9Y4P1 CBL-204ENST00000634840 4813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ATG4BQ9Y4P1 FAM210A-201ENST00000322247 4340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ATG4BQ9Y4P1 PHRF1-205ENST00000533464 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ATG4BQ9Y4P1 TMEM14A-201ENST00000211314 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ATG4BQ9Y4P1 RSPH14-201ENST00000216036 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ATG4BQ9Y4P1 NDUFS7-201ENST00000233627 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ATG4BQ9Y4P1 AKR1C7P-201ENST00000305623 895 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
ATG4BQ9Y4P1 PRSS38-201ENST00000366757 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ATG4BQ9Y4P1 CD99-205ENST00000381192 1245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ATG4BQ9Y4P1 RBM17P3-201ENST00000417687 1192 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
ATG4BQ9Y4P1 SIGLEC30P-201ENST00000455569 941 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
ATG4BQ9Y4P1 NDUFA6-202ENST00000498737 1256 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ATG4BQ9Y4P1 NDUFB9-204ENST00000518008 789 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ATG4BQ9Y4P1 PLPP5-214ENST00000531823 875 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ATG4BQ9Y4P1 TMEM135-209ENST00000532959 1149 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ATG4BQ9Y4P1 BLOC1S1-204ENST00000549147 1229 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ATG4BQ9Y4P1 GSTZ1-207ENST00000553586 979 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ATG4BQ9Y4P1 TRAF7-205ENST00000567653 666 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ATG4BQ9Y4P1 FGF11-204ENST00000575235 928 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ATG4BQ9Y4P1 RN7SL510P-201ENST00000581311 263 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
ATG4BQ9Y4P1 MTDHP3-201ENST00000594186 672 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
ATG4BQ9Y4P1 AC022150.1-201ENST00000599222 640 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ATG4BQ9Y4P1 ZSCAN1-203ENST00000601162 813 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ATG4BQ9Y4P1 NDUFA6-203ENST00000602404 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ATG4BQ9Y4P1 SSBP1-215ENST00000612337 884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ATG4BQ9Y4P1 REXO1L6P-202ENST00000619970 1078 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
ATG4BQ9Y4P1 AC080080.1-201ENST00000625121 2420 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
ATG4BQ9Y4P1 PHF12-205ENST00000577226 7679 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ATG4BQ9Y4P1 SDCBP-202ENST00000413219 2086 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ATG4BQ9Y4P1 HMOX2-217ENST00000619528 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ATG4BQ9Y4P1 LMBR1L-204ENST00000547382 2235 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ATG4BQ9Y4P1 FOXP1-210ENST00000484350 1996 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ATG4BQ9Y4P1 KLK6-202ENST00000376851 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ATG4BQ9Y4P1 ASB10-202ENST00000377867 1738 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ATG4BQ9Y4P1 PFN2-201ENST00000239940 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ATG4BQ9Y4P1 ARHGEF5-202ENST00000471847 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ATG4BQ9Y4P1 SEPT9-211ENST00000585930 1387 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ATG4BQ9Y4P1 ARID3A-201ENST00000263620 5941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ATG4BQ9Y4P1 FAM53A-207ENST00000489363 2776 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ATG4BQ9Y4P1 FGFR1-206ENST00000397091 5702 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ATG4BQ9Y4P1 CHRNA7-207ENST00000635884 1975 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ATG4BQ9Y4P1 DLC1-203ENST00000358919 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ATG4BQ9Y4P1 EGR2-203ENST00000439032 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ATG4BQ9Y4P1 ATPIF1-201ENST00000335514 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ATG4BQ9Y4P1 SIGLEC8-202ENST00000340550 1293 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ATG4BQ9Y4P1 MRPL52-202ENST00000355151 1118 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ATG4BQ9Y4P1 MRPL52-203ENST00000397496 1111 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ATG4BQ9Y4P1 EEF1E1-202ENST00000429723 562 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ATG4BQ9Y4P1 TMEM218-203ENST00000526175 972 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ATG4BQ9Y4P1 REXO2-206ENST00000539275 710 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ATG4BQ9Y4P1 MTHFSD-203ENST00000543303 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ATG4BQ9Y4P1 AC127496.4-201ENST00000571591 549 ntTSL 4 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ATG4BQ9Y4P1 LINC01711-201ENST00000598340 967 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
ATG4BQ9Y4P1 COPE-211ENST00000600932 1144 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ATG4BQ9Y4P1 FAM25C-201ENST00000617224 319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ATG4BQ9Y4P1 AC132872.3-201ENST00000620937 629 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ATG4BQ9Y4P1 AL355877.3-201ENST00000622820 899 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
ATG4BQ9Y4P1 MTHFSD-220ENST00000634347 1207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ATG4BQ9Y4P1 FARP1-242ENST00000627049 5103 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ATG4BQ9Y4P1 IL2RG-202ENST00000374188 1432 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ATG4BQ9Y4P1 SKIDA1-202ENST00000449193 6598 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ATG4BQ9Y4P1 SPAG1-201ENST00000251809 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ATG4BQ9Y4P1 PRSS36-207ENST00000569305 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ATG4BQ9Y4P1 NPRL2-201ENST00000232501 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ATG4BQ9Y4P1 AC016757.1-205ENST00000470346 1888 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ATG4BQ9Y4P1 CPEB3-203ENST00000614585 5789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ATG4BQ9Y4P1 PODXL-201ENST00000322985 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ATG4BQ9Y4P1 GPBAR1-204ENST00000522678 2003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ATG4BQ9Y4P1 GJA3-201ENST00000241125 5211 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ATG4BQ9Y4P1 TBXAS1-202ENST00000411653 1792 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ATG4BQ9Y4P1 C2orf81-202ENST00000612891 1902 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ATG4BQ9Y4P1 CERCAM-201ENST00000372838 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ATG4BQ9Y4P1 KIAA1522-202ENST00000373480 5294 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ATG4BQ9Y4P1 KIAA1522-203ENST00000373481 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ATG4BQ9Y4P1 EVI5L-202ENST00000538904 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ATG4BQ9Y4P1 LINC00671-201ENST00000301683 1958 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.8 ms