Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPX0

IGSF9B, Protein turtle homolog B, humanhuman

Predictions only

Length 1,349 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IGSF9BQ9UPX0 DHRS7-212ENST00000611054 1321 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
IGSF9BQ9UPX0 HSP90B1-210ENST00000614327 1338 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
IGSF9BQ9UPX0 TDRP-201ENST00000324079 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
IGSF9BQ9UPX0 TNFSF13-205ENST00000396545 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
IGSF9BQ9UPX0 RNF166-203ENST00000541206 2419 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
IGSF9BQ9UPX0 MCFD2-205ENST00000409218 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
IGSF9BQ9UPX0 TSTD1-204ENST00000423014 593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
IGSF9BQ9UPX0 C21orf33-205ENST00000427803 1077 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
IGSF9BQ9UPX0 ARPIN-202ENST00000460685 2145 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
IGSF9BQ9UPX0 AC108073.2-201ENST00000464002 357 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
IGSF9BQ9UPX0 ABO-202ENST00000538324 1147 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
IGSF9BQ9UPX0 PML-221ENST00000569965 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
IGSF9BQ9UPX0 SNHG15-206ENST00000580528 1073 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
IGSF9BQ9UPX0 TUFM-201ENST00000313511 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
IGSF9BQ9UPX0 CLDN9-201ENST00000445369 2050 ntAPPRIS P1 BASIC19.34■□□□□ 0.69
IGSF9BQ9UPX0 PDCD7-201ENST00000204549 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
IGSF9BQ9UPX0 UMOD-205ENST00000570689 2315 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
IGSF9BQ9UPX0 NEU1-206ENST00000375631 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
IGSF9BQ9UPX0 FBXL5-202ENST00000412094 2837 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
IGSF9BQ9UPX0 PCMTD1-206ENST00000521344 1712 ntTSL 3 BASIC19.34■□□□□ 0.69
IGSF9BQ9UPX0 APCDD1-201ENST00000355285 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
IGSF9BQ9UPX0 BAG5-201ENST00000299204 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
IGSF9BQ9UPX0 MUS81-215ENST00000533035 2180 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
IGSF9BQ9UPX0 PRKCB-202ENST00000321728 2689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
IGSF9BQ9UPX0 PRR29-AS1-202ENST00000580942 2926 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
IGSF9BQ9UPX0 ERMARD-210ENST00000588451 2146 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
IGSF9BQ9UPX0 KIAA1324L-208ENST00000450689 6841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
IGSF9BQ9UPX0 XRCC3-201ENST00000352127 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
IGSF9BQ9UPX0 SLC7A9-204ENST00000590341 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
IGSF9BQ9UPX0 MYBPH-202ENST00000621380 1772 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
IGSF9BQ9UPX0 MXRA8-202ENST00000342753 2231 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
IGSF9BQ9UPX0 SNX1-208ENST00000559844 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
IGSF9BQ9UPX0 ELOF1-201ENST00000252445 1019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.69
IGSF9BQ9UPX0 BRCC3-202ENST00000340647 1101 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.69
IGSF9BQ9UPX0 CRCP-205ENST00000431089 942 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.69
IGSF9BQ9UPX0 AFG3L1P-210ENST00000431757 569 ntTSL 4 BASIC19.33■□□□□ 0.69
IGSF9BQ9UPX0 CR559946.1-201ENST00000453835 531 ntTSL 4 BASIC19.33■□□□□ 0.69
IGSF9BQ9UPX0 C9orf147-204ENST00000463223 863 ntTSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.69
IGSF9BQ9UPX0 HS6ST1P1-201ENST00000481504 1234 ntBASIC19.33■□□□□ 0.69
IGSF9BQ9UPX0 RIN3-211ENST00000557762 517 ntTSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.69
IGSF9BQ9UPX0 TUBB4A-209ENST00000598006 565 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.69
IGSF9BQ9UPX0 LRCH1-201ENST00000311191 4710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
IGSF9BQ9UPX0 SLC30A2-202ENST00000374278 3097 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
IGSF9BQ9UPX0 P2RY6-202ENST00000393590 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
IGSF9BQ9UPX0 CBX2-202ENST00000310942 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
IGSF9BQ9UPX0 CFLAR-208ENST00000423241 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
IGSF9BQ9UPX0 SLC35F3-201ENST00000366617 2762 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
IGSF9BQ9UPX0 RBBP7-203ENST00000380087 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
IGSF9BQ9UPX0 HLA-A-204ENST00000396634 1868 ntAPPRIS P1 BASIC19.33■□□□□ 0.68
IGSF9BQ9UPX0 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
IGSF9BQ9UPX0 SPSB4-201ENST00000310546 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
IGSF9BQ9UPX0 MED25-202ENST00000538643 1623 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
IGSF9BQ9UPX0 AC093627.4-201ENST00000484550 5008 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
IGSF9BQ9UPX0 CDK11A-203ENST00000357760 2446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
IGSF9BQ9UPX0 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
IGSF9BQ9UPX0 CDK11A-206ENST00000378638 2429 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
IGSF9BQ9UPX0 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
IGSF9BQ9UPX0 CLEC18A-202ENST00000393701 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
IGSF9BQ9UPX0 CLEC18C-203ENST00000541793 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
IGSF9BQ9UPX0 SH2D3C-203ENST00000373277 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
IGSF9BQ9UPX0 AL590787.1-201ENST00000568856 1315 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
IGSF9BQ9UPX0 ALAS2-203ENST00000396198 1936 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
IGSF9BQ9UPX0 SATB2-203ENST00000428695 2135 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
IGSF9BQ9UPX0 FZD10-201ENST00000229030 3281 ntAPPRIS P1 BASIC19.32■□□□□ 0.68
IGSF9BQ9UPX0 FZD10-202ENST00000539839 3282 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
IGSF9BQ9UPX0 SGF29-201ENST00000317058 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
IGSF9BQ9UPX0 LCE1B-201ENST00000360090 1139 ntAPPRIS P1 BASIC19.32■□□□□ 0.68
IGSF9BQ9UPX0 AP002414.1-201ENST00000391405 1147 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
IGSF9BQ9UPX0 GRM5-203ENST00000393294 1268 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
IGSF9BQ9UPX0 TIMM17B-202ENST00000396779 1099 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
IGSF9BQ9UPX0 BAX-213ENST00000539787 458 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
IGSF9BQ9UPX0 HAGH-208ENST00000566709 1291 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
IGSF9BQ9UPX0 C1QL3-202ENST00000619991 783 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
IGSF9BQ9UPX0 RNH1-205ENST00000397615 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
IGSF9BQ9UPX0 INPP5A-203ENST00000368594 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
IGSF9BQ9UPX0 LEMD2-214ENST00000614475 2883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
IGSF9BQ9UPX0 CNNM3-201ENST00000305510 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
IGSF9BQ9UPX0 FAM234A-203ENST00000399932 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
IGSF9BQ9UPX0 ADAM15-207ENST00000368413 1901 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
IGSF9BQ9UPX0 SUPT20H-203ENST00000360252 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
IGSF9BQ9UPX0 CHRD-202ENST00000348986 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
IGSF9BQ9UPX0 CNST-202ENST00000366512 2422 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
IGSF9BQ9UPX0 TMEM175-201ENST00000264771 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
IGSF9BQ9UPX0 NOMO1-201ENST00000287667 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
IGSF9BQ9UPX0 GPBAR1-201ENST00000479077 1869 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
IGSF9BQ9UPX0 EIF4A1-203ENST00000577269 1319 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
IGSF9BQ9UPX0 ZCWPW1-202ENST00000398027 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
IGSF9BQ9UPX0 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
IGSF9BQ9UPX0 CLDN5-202ENST00000406028 2548 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
IGSF9BQ9UPX0 IL18BP-207ENST00000404792 2172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
IGSF9BQ9UPX0 PUF60-201ENST00000313352 1804 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
IGSF9BQ9UPX0 SYBU-224ENST00000529690 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
IGSF9BQ9UPX0 SLC38A11-202ENST00000409058 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
IGSF9BQ9UPX0 PF4-201ENST00000296029 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
IGSF9BQ9UPX0 AQP12A-201ENST00000337801 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
IGSF9BQ9UPX0 ZNF789-202ENST00000379724 510 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
IGSF9BQ9UPX0 PTCHD3P3-201ENST00000403073 906 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
IGSF9BQ9UPX0 ZGLP1-201ENST00000403352 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
IGSF9BQ9UPX0 RFXANK-203ENST00000407360 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
IGSF9BQ9UPX0 KIRREL3-AS1-201ENST00000548204 586 ntTSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 107.5 ms