Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPV7

PHF24, PHD finger protein 24, humanhuman

Predictions only

Length 400 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHF24Q9UPV7 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
PHF24Q9UPV7 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
PHF24Q9UPV7 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
PHF24Q9UPV7 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
PHF24Q9UPV7 WDR45-234ENST00000634838 1545 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
PHF24Q9UPV7 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
PHF24Q9UPV7 AC046185.3-201ENST00000623228 1824 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
PHF24Q9UPV7 AMT-250ENST00000637682 1823 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
PHF24Q9UPV7 AL139099.2-201ENST00000555043 2469 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
PHF24Q9UPV7 ARNTL-201ENST00000389707 2776 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
PHF24Q9UPV7 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
PHF24Q9UPV7 CDK10-202ENST00000353379 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
PHF24Q9UPV7 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
PHF24Q9UPV7 KCNC4-203ENST00000413138 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
PHF24Q9UPV7 TMEM106C-203ENST00000449758 1414 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
PHF24Q9UPV7 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
PHF24Q9UPV7 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
PHF24Q9UPV7 TNFRSF13B-201ENST00000261652 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
PHF24Q9UPV7 AC099508.1-201ENST00000499110 1666 ntTSL 4 BASIC19.08■□□□□ 0.65
PHF24Q9UPV7 SOD2-215ENST00000546087 2558 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
PHF24Q9UPV7 HIPK1-207ENST00000369561 3777 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
PHF24Q9UPV7 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
PHF24Q9UPV7 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
PHF24Q9UPV7 SPERT-201ENST00000310521 1613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
PHF24Q9UPV7 TRIP6-209ENST00000619988 1303 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
PHF24Q9UPV7 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
PHF24Q9UPV7 RAB37-208ENST00000402449 1560 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
PHF24Q9UPV7 TCEAL3-201ENST00000243286 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
PHF24Q9UPV7 CABP2-201ENST00000294288 925 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
PHF24Q9UPV7 ZNF524-201ENST00000301073 1102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
PHF24Q9UPV7 C10orf35-201ENST00000373279 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
PHF24Q9UPV7 WRB-204ENST00000398753 699 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
PHF24Q9UPV7 IGFALS-202ENST00000415638 2136 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
PHF24Q9UPV7 FAM207CP-201ENST00000443486 507 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
PHF24Q9UPV7 AC106795.3-201ENST00000511650 547 ntTSL 4 BASIC19.08■□□□□ 0.64
PHF24Q9UPV7 RNF24-204ENST00000545616 1128 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
PHF24Q9UPV7 WASHC3-213ENST00000545679 865 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
PHF24Q9UPV7 ZNF710-AS1-201ENST00000558334 1168 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
PHF24Q9UPV7 TRAPPC6A-202ENST00000585934 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
PHF24Q9UPV7 GMFG-207ENST00000598034 1028 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
PHF24Q9UPV7 RBP1-207ENST00000619087 516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
PHF24Q9UPV7 HIST1H3D-202ENST00000635200 948 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
PHF24Q9UPV7 BANP-223ENST00000538234 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
PHF24Q9UPV7 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
PHF24Q9UPV7 CLN3-229ENST00000567963 1452 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
PHF24Q9UPV7 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
PHF24Q9UPV7 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
PHF24Q9UPV7 TRNT1-205ENST00000402675 1935 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
PHF24Q9UPV7 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
PHF24Q9UPV7 USP18-201ENST00000215794 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
PHF24Q9UPV7 WDR13-201ENST00000218056 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
PHF24Q9UPV7 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
PHF24Q9UPV7 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
PHF24Q9UPV7 ZNF419-201ENST00000221735 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
PHF24Q9UPV7 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
PHF24Q9UPV7 RUBCNL-203ENST00000378787 2731 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
PHF24Q9UPV7 FMR1-206ENST00000370477 3437 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
PHF24Q9UPV7 HLA-F-218ENST00000376861 1544 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
PHF24Q9UPV7 CLPP-201ENST00000245816 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
PHF24Q9UPV7 HNRNPA1P40-201ENST00000426371 1278 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
PHF24Q9UPV7 SPCS2P4-201ENST00000436160 681 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
PHF24Q9UPV7 RBPMS2P1-201ENST00000437762 623 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
PHF24Q9UPV7 HLA-J-202ENST00000469281 1241 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
PHF24Q9UPV7 AC125807.1-201ENST00000483097 614 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
PHF24Q9UPV7 DUX4L17-201ENST00000557360 1267 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
PHF24Q9UPV7 AC027088.1-201ENST00000557966 1117 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
PHF24Q9UPV7 AC140878.1-201ENST00000565277 250 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
PHF24Q9UPV7 AC243571.2-201ENST00000615265 628 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
PHF24Q9UPV7 ANGPTL4-202ENST00000393962 1705 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
PHF24Q9UPV7 FDXR-203ENST00000420580 1705 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
PHF24Q9UPV7 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
PHF24Q9UPV7 HGNC:18790-211ENST00000621129 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
PHF24Q9UPV7 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
PHF24Q9UPV7 TPD52L1-202ENST00000368388 2147 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
PHF24Q9UPV7 ELL-203ENST00000596124 1852 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
PHF24Q9UPV7 ATP6V0E1-203ENST00000519374 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
PHF24Q9UPV7 LGMN-216ENST00000557434 1797 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
PHF24Q9UPV7 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
PHF24Q9UPV7 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
PHF24Q9UPV7 PSMD4-201ENST00000368881 1333 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
PHF24Q9UPV7 AL139398.1-201ENST00000638795 1529 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
PHF24Q9UPV7 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
PHF24Q9UPV7 ATP6AP2-214ENST00000636287 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
PHF24Q9UPV7 RNH1-201ENST00000354420 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
PHF24Q9UPV7 NPM2-209ENST00000521157 1484 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
PHF24Q9UPV7 LRRC37A5P-201ENST00000374304 1103 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
PHF24Q9UPV7 NME1-NME2-202ENST00000393193 1021 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
PHF24Q9UPV7 GSAP-205ENST00000430584 600 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
PHF24Q9UPV7 AL513327.2-201ENST00000432703 490 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
PHF24Q9UPV7 AC026202.2-201ENST00000439325 672 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
PHF24Q9UPV7 AC108047.1-201ENST00000457407 404 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
PHF24Q9UPV7 AC002310.2-201ENST00000486926 950 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
PHF24Q9UPV7 GNAO1-210ENST00000569295 930 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
PHF24Q9UPV7 MIR4515-201ENST00000584082 81 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
PHF24Q9UPV7 RNF32-201ENST00000311822 1842 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
PHF24Q9UPV7 GYG1-214ENST00000627418 1831 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
PHF24Q9UPV7 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
PHF24Q9UPV7 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
PHF24Q9UPV7 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
PHF24Q9UPV7 NAA60-201ENST00000360862 2522 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.9 ms