Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULB5

CDH7, Cadherin-7, humanhuman

Predictions only

Length 785 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDH7Q9ULB5 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CDH7Q9ULB5 BICD1-207ENST00000551848 1962 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
CDH7Q9ULB5 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CDH7Q9ULB5 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CDH7Q9ULB5 PTK6-201ENST00000217185 2401 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CDH7Q9ULB5 SLCO6A1-201ENST00000379807 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CDH7Q9ULB5 ALDH3A1-202ENST00000395555 1495 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CDH7Q9ULB5 LINC00535-201ENST00000501400 1914 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CDH7Q9ULB5 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CDH7Q9ULB5 CA4-201ENST00000300900 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CDH7Q9ULB5 VIPR1-201ENST00000325123 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CDH7Q9ULB5 ASTL-201ENST00000342380 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CDH7Q9ULB5 PP7080-201ENST00000342584 1876 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CDH7Q9ULB5 AL139400.1-201ENST00000366220 510 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
CDH7Q9ULB5 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CDH7Q9ULB5 DTX2-206ENST00000430490 2623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CDH7Q9ULB5 CHD1L-204ENST00000431239 2907 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CDH7Q9ULB5 KCNK9-203ENST00000520439 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CDH7Q9ULB5 PCMTD1-206ENST00000521344 1712 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CDH7Q9ULB5 AC068137.2-201ENST00000605408 478 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
CDH7Q9ULB5 MED16-214ENST00000617672 554 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CDH7Q9ULB5 BEGAIN-211ENST00000637646 2911 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CDH7Q9ULB5 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CDH7Q9ULB5 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
CDH7Q9ULB5 C12orf42-201ENST00000378113 1513 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
CDH7Q9ULB5 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
CDH7Q9ULB5 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
CDH7Q9ULB5 RNF121-201ENST00000361756 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
CDH7Q9ULB5 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CDH7Q9ULB5 FAM50B-201ENST00000380272 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CDH7Q9ULB5 TM2D2-201ENST00000397070 1631 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CDH7Q9ULB5 LZTS1-203ENST00000522290 1614 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CDH7Q9ULB5 ZNF296-202ENST00000622376 1631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CDH7Q9ULB5 JAK2-201ENST00000381652 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CDH7Q9ULB5 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CDH7Q9ULB5 FOXS1-201ENST00000375978 1319 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CDH7Q9ULB5 ZDHHC4-206ENST00000405731 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CDH7Q9ULB5 NKIRAS1-207ENST00000437230 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CDH7Q9ULB5 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CDH7Q9ULB5 SPDYE5-203ENST00000625065 1700 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CDH7Q9ULB5 CLEC18A-202ENST00000393701 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CDH7Q9ULB5 CLEC18C-203ENST00000541793 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CDH7Q9ULB5 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CDH7Q9ULB5 LONRF1-208ENST00000533751 3043 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CDH7Q9ULB5 CTRB2-201ENST00000303037 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CDH7Q9ULB5 AC013270.1-201ENST00000425578 440 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CDH7Q9ULB5 AL109613.1-202ENST00000427243 639 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CDH7Q9ULB5 NRSN2-AS1-202ENST00000442637 762 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CDH7Q9ULB5 SLC25A36-204ENST00000453248 1040 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CDH7Q9ULB5 CD99L2-206ENST00000466436 988 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CDH7Q9ULB5 AC020659.2-201ENST00000510176 585 ntTSL 4 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CDH7Q9ULB5 LINC00596-201ENST00000559615 937 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CDH7Q9ULB5 AC004449.1-201ENST00000564240 433 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
CDH7Q9ULB5 AC010776.2-201ENST00000588946 1081 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CDH7Q9ULB5 RAMP2-205ENST00000589683 858 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CDH7Q9ULB5 TK1-204ENST00000590430 683 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CDH7Q9ULB5 SELENOH-206ENST00000622257 1291 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CDH7Q9ULB5 AC105339.1-204ENST00000636249 355 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
CDH7Q9ULB5 CLASRP-203ENST00000391953 1941 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CDH7Q9ULB5 EIPR1-201ENST00000382125 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CDH7Q9ULB5 C14orf93-204ENST00000397377 1776 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CDH7Q9ULB5 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CDH7Q9ULB5 GRB10-208ENST00000403097 5432 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CDH7Q9ULB5 CCNI2-201ENST00000378731 2355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CDH7Q9ULB5 IGSF11-209ENST00000491903 1487 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CDH7Q9ULB5 AL590787.1-201ENST00000568856 1315 ntBASIC18■□□□□ 0.47
CDH7Q9ULB5 SLC7A9-202ENST00000587772 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CDH7Q9ULB5 PPP2R2C-209ENST00000515571 1832 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CDH7Q9ULB5 PDZD3-202ENST00000355547 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CDH7Q9ULB5 TDRP-201ENST00000324079 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CDH7Q9ULB5 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CDH7Q9ULB5 HSD17B6-203ENST00000554150 1547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
CDH7Q9ULB5 H3F3C-201ENST00000340398 1057 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
CDH7Q9ULB5 PRUNE2-202ENST00000376713 1069 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
CDH7Q9ULB5 AC004461.1-201ENST00000412461 403 ntBASIC18■□□□□ 0.47
CDH7Q9ULB5 SLC26A4-AS1-202ENST00000449741 586 ntTSL 4 BASIC18■□□□□ 0.47
CDH7Q9ULB5 BRF1-219ENST00000551787 824 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CDH7Q9ULB5 CYB561-216ENST00000582297 897 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
CDH7Q9ULB5 AC090164.3-201ENST00000610780 2143 ntBASIC18■□□□□ 0.47
CDH7Q9ULB5 SREK1-216ENST00000612404 2128 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CDH7Q9ULB5 REXO1L3P-201ENST00000622202 1288 ntBASIC18■□□□□ 0.47
CDH7Q9ULB5 TCTN1-204ENST00000397659 1885 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CDH7Q9ULB5 GOLGA6L17P-202ENST00000614358 1398 ntBASIC18■□□□□ 0.47
CDH7Q9ULB5 MTG1-201ENST00000317502 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CDH7Q9ULB5 SYNM-202ENST00000336292 7394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CDH7Q9ULB5 NETO1-201ENST00000327305 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CDH7Q9ULB5 TFEB-201ENST00000230323 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CDH7Q9ULB5 GNAI2-204ENST00000440628 1663 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CDH7Q9ULB5 FAM131A-207ENST00000450976 1335 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CDH7Q9ULB5 SIT1-204ENST00000618781 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CDH7Q9ULB5 AC135776.1-201ENST00000319817 2481 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
CDH7Q9ULB5 MARK4-210ENST00000620044 2105 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CDH7Q9ULB5 B3GNT9-201ENST00000449549 2917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CDH7Q9ULB5 CDK10-202ENST00000353379 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CDH7Q9ULB5 INPP5J-205ENST00000404390 2215 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CDH7Q9ULB5 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CDH7Q9ULB5 DFFA-201ENST00000377036 1403 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CDH7Q9ULB5 KANK3-201ENST00000330915 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CDH7Q9ULB5 SNX1-208ENST00000559844 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CDH7Q9ULB5 PDE9A-209ENST00000398227 1606 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39 ms