Protein–RNA interactions for Protein: Q9UL33

TRAPPC2L, Trafficking protein particle complex subunit 2-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 140 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC2LQ9UL33 AL138752.2-201ENST00000540557 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
TRAPPC2LQ9UL33 BATF2-202ENST00000435842 1949 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TRAPPC2LQ9UL33 RB1CC1-202ENST00000435644 6614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TRAPPC2LQ9UL33 UNC119-204ENST00000470125 2050 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TRAPPC2LQ9UL33 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TRAPPC2LQ9UL33 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TRAPPC2LQ9UL33 MYCLP1-201ENST00000372451 1075 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
TRAPPC2LQ9UL33 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
TRAPPC2LQ9UL33 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
TRAPPC2LQ9UL33 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TRAPPC2LQ9UL33 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
TRAPPC2LQ9UL33 AC004540.1-201ENST00000439120 891 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
TRAPPC2LQ9UL33 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
TRAPPC2LQ9UL33 PON3-205ENST00000451904 1053 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
TRAPPC2LQ9UL33 AC073111.4-202ENST00000486297 585 ntTSL 4 BASIC14.63□□□□□ -0.07
TRAPPC2LQ9UL33 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
TRAPPC2LQ9UL33 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
TRAPPC2LQ9UL33 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.63□□□□□ -0.07
TRAPPC2LQ9UL33 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TRAPPC2LQ9UL33 AC011840.4-201ENST00000578471 627 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
TRAPPC2LQ9UL33 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
TRAPPC2LQ9UL33 FCGRT-210ENST00000596975 1054 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
TRAPPC2LQ9UL33 MAPRE1-201ENST00000375571 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TRAPPC2LQ9UL33 FOXD4L4-201ENST00000377413 2230 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
TRAPPC2LQ9UL33 ZNF134-201ENST00000396161 4914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TRAPPC2LQ9UL33 LZTS1-201ENST00000265801 5459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TRAPPC2LQ9UL33 ZSCAN10-202ENST00000538082 2350 ntTSL 4 BASIC14.63□□□□□ -0.07
TRAPPC2LQ9UL33 AC009779.2-201ENST00000552576 1443 ntTSL 4 BASIC14.63□□□□□ -0.07
TRAPPC2LQ9UL33 CDK11B-201ENST00000340677 2534 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TRAPPC2LQ9UL33 CHUK-201ENST00000370397 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TRAPPC2LQ9UL33 WASF1-205ENST00000392587 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TRAPPC2LQ9UL33 KDM4B-203ENST00000536461 5027 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TRAPPC2LQ9UL33 TTLL10-202ENST00000379289 2259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
TRAPPC2LQ9UL33 EIF3L-202ENST00000406934 2282 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
TRAPPC2LQ9UL33 TOM1L2-207ENST00000535933 1748 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
TRAPPC2LQ9UL33 SAP130-202ENST00000259235 4065 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TRAPPC2LQ9UL33 ETNK2-202ENST00000367201 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
TRAPPC2LQ9UL33 NCOA1-205ENST00000406961 7289 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
TRAPPC2LQ9UL33 KLHL33-201ENST00000344581 1863 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
TRAPPC2LQ9UL33 SCART1-206ENST00000640237 4351 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
TRAPPC2LQ9UL33 PDE4A-201ENST00000293683 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TRAPPC2LQ9UL33 TUBB2B-201ENST00000259818 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TRAPPC2LQ9UL33 TMPRSS5-207ENST00000540540 2001 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
TRAPPC2LQ9UL33 GALNT11-205ENST00000430044 2727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
TRAPPC2LQ9UL33 TADA1-201ENST00000367874 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TRAPPC2LQ9UL33 MFSD2A-201ENST00000372809 2173 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
TRAPPC2LQ9UL33 CD24-201ENST00000606017 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TRAPPC2LQ9UL33 NEK3-206ENST00000611833 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
TRAPPC2LQ9UL33 PCDHGC3-205ENST00000617641 2346 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TRAPPC2LQ9UL33 LGALS12-205ENST00000425950 1789 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
TRAPPC2LQ9UL33 PFKFB3-215ENST00000536985 2094 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
TRAPPC2LQ9UL33 MPPE1-211ENST00000588072 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
TRAPPC2LQ9UL33 RRM2-202ENST00000360566 3673 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
TRAPPC2LQ9UL33 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
TRAPPC2LQ9UL33 PDE2A-226ENST00000544570 3119 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
TRAPPC2LQ9UL33 PRCC-201ENST00000271526 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
TRAPPC2LQ9UL33 SREK1-216ENST00000612404 2128 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
TRAPPC2LQ9UL33 ABCB9-207ENST00000442833 2587 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
TRAPPC2LQ9UL33 RPH3AL-222ENST00000618002 2578 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
TRAPPC2LQ9UL33 EML3-201ENST00000278845 3017 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
TRAPPC2LQ9UL33 ARHGAP39-202ENST00000377307 4673 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
TRAPPC2LQ9UL33 SULT2B1-201ENST00000201586 1295 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
TRAPPC2LQ9UL33 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
TRAPPC2LQ9UL33 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
TRAPPC2LQ9UL33 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
TRAPPC2LQ9UL33 TINF2-201ENST00000267415 1852 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
TRAPPC2LQ9UL33 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
TRAPPC2LQ9UL33 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
TRAPPC2LQ9UL33 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
TRAPPC2LQ9UL33 GCLM-201ENST00000370238 4857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
TRAPPC2LQ9UL33 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
TRAPPC2LQ9UL33 FERMT2-203ENST00000395631 3369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
TRAPPC2LQ9UL33 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
TRAPPC2LQ9UL33 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
TRAPPC2LQ9UL33 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
TRAPPC2LQ9UL33 MHENCR-202ENST00000449500 801 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
TRAPPC2LQ9UL33 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
TRAPPC2LQ9UL33 CLEC10A-204ENST00000571664 1442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
TRAPPC2LQ9UL33 AC090616.6-201ENST00000582640 721 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
TRAPPC2LQ9UL33 KMT5C-212ENST00000630497 2037 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
TRAPPC2LQ9UL33 ASAH1-251ENST00000637561 929 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
TRAPPC2LQ9UL33 DYSF-207ENST00000409762 6727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
TRAPPC2LQ9UL33 DYSF-211ENST00000429174 6739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
TRAPPC2LQ9UL33 LINC01569-202ENST00000573042 2093 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
TRAPPC2LQ9UL33 OPN5-204ENST00000489301 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
TRAPPC2LQ9UL33 POC1A-203ENST00000474012 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
TRAPPC2LQ9UL33 PEX16-201ENST00000241041 1479 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
TRAPPC2LQ9UL33 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
TRAPPC2LQ9UL33 NF2-208ENST00000403435 2568 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
TRAPPC2LQ9UL33 USB1-201ENST00000219281 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
TRAPPC2LQ9UL33 NEO1-207ENST00000560262 4315 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
TRAPPC2LQ9UL33 AL731569.1-201ENST00000428940 3058 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
TRAPPC2LQ9UL33 ARID5A-203ENST00000454558 3079 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
TRAPPC2LQ9UL33 BCL11A-201ENST00000335712 5942 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
TRAPPC2LQ9UL33 EPHX2-204ENST00000518379 1959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
TRAPPC2LQ9UL33 HNRNPLL-202ENST00000358367 2779 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
TRAPPC2LQ9UL33 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
TRAPPC2LQ9UL33 LSP1-201ENST00000311604 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
TRAPPC2LQ9UL33 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
TRAPPC2LQ9UL33 RAB31-207ENST00000578921 4055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.4 ms