Protein–RNA interactions for Protein: Q9UII2

ATPIF1, ATPase inhibitor, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 106 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATPIF1Q9UII2 FAM184B-201ENST00000265018 6622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ATPIF1Q9UII2 SLAIN2-201ENST00000264313 6299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ATPIF1Q9UII2 KIZ-211ENST00000619574 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ATPIF1Q9UII2 TUFM-201ENST00000313511 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ATPIF1Q9UII2 CLDN9-201ENST00000445369 2050 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ATPIF1Q9UII2 DPP9-AS1-201ENST00000381796 3071 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ATPIF1Q9UII2 STAT5A-207ENST00000546010 3086 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ATPIF1Q9UII2 GPAT3-202ENST00000395226 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ATPIF1Q9UII2 NFKBID-210ENST00000606253 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ATPIF1Q9UII2 AC104809.2-201ENST00000418218 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ATPIF1Q9UII2 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ATPIF1Q9UII2 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ATPIF1Q9UII2 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ATPIF1Q9UII2 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ATPIF1Q9UII2 PCED1CP-201ENST00000419887 785 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
ATPIF1Q9UII2 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ATPIF1Q9UII2 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ATPIF1Q9UII2 AC004130.1-202ENST00000603156 666 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ATPIF1Q9UII2 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
ATPIF1Q9UII2 EML2-AS1-203ENST00000623430 886 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ATPIF1Q9UII2 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ATPIF1Q9UII2 GGT2-202ENST00000405188 1845 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ATPIF1Q9UII2 CARNS1-201ENST00000307823 3942 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ATPIF1Q9UII2 CCDC120-206ENST00000603986 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ATPIF1Q9UII2 ACSS1-201ENST00000323482 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ATPIF1Q9UII2 SEPHS2-201ENST00000478753 2551 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ATPIF1Q9UII2 SCYL1-214ENST00000533862 2570 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ATPIF1Q9UII2 REPS1-208ENST00000450536 4537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ATPIF1Q9UII2 PLCB1-203ENST00000378641 7323 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ATPIF1Q9UII2 GGT5-201ENST00000263112 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ATPIF1Q9UII2 TLE2-217ENST00000590536 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ATPIF1Q9UII2 ZNF500-202ENST00000545009 2440 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ATPIF1Q9UII2 TTLL8-201ENST00000266182 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ATPIF1Q9UII2 VSIG10L-201ENST00000335624 3397 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ATPIF1Q9UII2 ANKHD1-EIF4EBP3-203ENST00000532219 8246 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ATPIF1Q9UII2 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ATPIF1Q9UII2 SHISA6-204ENST00000441885 7575 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ATPIF1Q9UII2 AC125634.1-201ENST00000438758 1403 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
ATPIF1Q9UII2 TCEAL4-201ENST00000372629 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ATPIF1Q9UII2 ARHGAP39-202ENST00000377307 4673 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ATPIF1Q9UII2 CCDC78-201ENST00000293889 1611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ATPIF1Q9UII2 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ATPIF1Q9UII2 AFTPH-201ENST00000238855 4113 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ATPIF1Q9UII2 LTV1-201ENST00000367576 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ATPIF1Q9UII2 PIAS4-201ENST00000262971 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ATPIF1Q9UII2 LMNA-208ENST00000448611 1943 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ATPIF1Q9UII2 APAF1-201ENST00000333991 4539 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ATPIF1Q9UII2 SERPINB6-208ENST00000616722 2047 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ATPIF1Q9UII2 ZNF454-202ENST00000519564 2142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ATPIF1Q9UII2 INPP5J-213ENST00000620191 2306 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ATPIF1Q9UII2 CNST-202ENST00000366512 2422 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ATPIF1Q9UII2 GIGYF1-201ENST00000275732 6530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ATPIF1Q9UII2 C12orf29-201ENST00000356891 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ATPIF1Q9UII2 STX2-201ENST00000261653 3331 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ATPIF1Q9UII2 CCS-201ENST00000310190 942 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ATPIF1Q9UII2 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ATPIF1Q9UII2 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ATPIF1Q9UII2 COX5BP2-201ENST00000392354 334 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
ATPIF1Q9UII2 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ATPIF1Q9UII2 AC122714.2-201ENST00000502787 707 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
ATPIF1Q9UII2 ENDOV-205ENST00000518644 625 ntTSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ATPIF1Q9UII2 AP002807.1-202ENST00000526897 791 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ATPIF1Q9UII2 KLK12-205ENST00000529888 735 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ATPIF1Q9UII2 ADA-207ENST00000537820 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ATPIF1Q9UII2 ATP6V0C-203ENST00000565223 668 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ATPIF1Q9UII2 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ATPIF1Q9UII2 ATP6V0C-204ENST00000568562 477 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ATPIF1Q9UII2 AL138831.2-201ENST00000606564 490 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
ATPIF1Q9UII2 IER3-202ENST00000376377 1350 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
ATPIF1Q9UII2 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ATPIF1Q9UII2 PHKG2-204ENST00000563588 5539 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ATPIF1Q9UII2 HNF1B-207ENST00000621123 1971 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ATPIF1Q9UII2 INPP5K-201ENST00000320345 2880 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ATPIF1Q9UII2 TTLL12-201ENST00000216129 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ATPIF1Q9UII2 FZD4-201ENST00000531380 7383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ATPIF1Q9UII2 SLCO6A1-202ENST00000389019 2340 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ATPIF1Q9UII2 FAM109A-204ENST00000548163 2317 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ATPIF1Q9UII2 SYNGR2-206ENST00000589711 2041 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ATPIF1Q9UII2 NUDC-201ENST00000321265 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ATPIF1Q9UII2 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ATPIF1Q9UII2 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ATPIF1Q9UII2 SLBP-202ENST00000429429 1623 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ATPIF1Q9UII2 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ATPIF1Q9UII2 AKIRIN1-201ENST00000372984 1330 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ATPIF1Q9UII2 STAT5A-201ENST00000345506 4301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ATPIF1Q9UII2 DTX2-202ENST00000413936 2472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ATPIF1Q9UII2 GSDMD-206ENST00000526406 2496 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ATPIF1Q9UII2 AL355312.1-201ENST00000407115 2176 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
ATPIF1Q9UII2 EWSR1-202ENST00000332035 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ATPIF1Q9UII2 TSPOAP1-202ENST00000343736 5947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ATPIF1Q9UII2 PHRF1-202ENST00000413872 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ATPIF1Q9UII2 SBF2-AS1-201ENST00000498905 2709 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ATPIF1Q9UII2 DIXDC1-208ENST00000615255 4825 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ATPIF1Q9UII2 PEX16-201ENST00000241041 1479 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ATPIF1Q9UII2 JKAMP-215ENST00000616435 2338 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ATPIF1Q9UII2 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
ATPIF1Q9UII2 NINL-201ENST00000278886 4969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ATPIF1Q9UII2 MRPS34-201ENST00000177742 1040 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ATPIF1Q9UII2 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ATPIF1Q9UII2 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.9 ms