Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHJ3

SFMBT1, Scm-like with four MBT domains protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 866 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFMBT1Q9UHJ3 OXSR1-201ENST00000311806 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SFMBT1Q9UHJ3 ALG3-201ENST00000397676 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SFMBT1Q9UHJ3 AJUBA-202ENST00000361265 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SFMBT1Q9UHJ3 CSNK1D-204ENST00000398519 1580 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SFMBT1Q9UHJ3 PABPC1L-217ENST00000537323 1910 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SFMBT1Q9UHJ3 AC097637.2-201ENST00000624096 1997 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
SFMBT1Q9UHJ3 RPS2P28-201ENST00000314255 741 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
SFMBT1Q9UHJ3 TOR3A-201ENST00000352445 1182 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SFMBT1Q9UHJ3 OPN1LW-201ENST00000369951 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SFMBT1Q9UHJ3 S100A2-206ENST00000497140 697 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SFMBT1Q9UHJ3 AP001107.6-201ENST00000526655 516 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SFMBT1Q9UHJ3 AC069287.3-201ENST00000527297 589 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SFMBT1Q9UHJ3 SPINT1-AS1-203ENST00000565315 629 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SFMBT1Q9UHJ3 AC133919.2-201ENST00000565965 589 ntTSL 4 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SFMBT1Q9UHJ3 MIR22HG-204ENST00000571595 767 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SFMBT1Q9UHJ3 TMEM220-203ENST00000578345 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SFMBT1Q9UHJ3 AC084125.4-201ENST00000580385 338 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SFMBT1Q9UHJ3 CIRBP-235ENST00000591935 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SFMBT1Q9UHJ3 PRKN-208ENST00000610470 531 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SFMBT1Q9UHJ3 LINC01197-204ENST00000611265 956 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SFMBT1Q9UHJ3 PRKN-209ENST00000612485 225 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SFMBT1Q9UHJ3 C1orf159-204ENST00000379339 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SFMBT1Q9UHJ3 ADARB1-202ENST00000360697 6604 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SFMBT1Q9UHJ3 ISPD-201ENST00000399310 1709 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SFMBT1Q9UHJ3 PHKA2-201ENST00000379942 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SFMBT1Q9UHJ3 GAL3ST1-201ENST00000338911 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SFMBT1Q9UHJ3 ARHGAP22-206ENST00000435790 2595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SFMBT1Q9UHJ3 PDZD3-202ENST00000355547 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SFMBT1Q9UHJ3 UBL3-201ENST00000380680 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SFMBT1Q9UHJ3 SPC24-206ENST00000592540 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SFMBT1Q9UHJ3 DBNL-213ENST00000452943 1513 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SFMBT1Q9UHJ3 SSBP3-203ENST00000371319 1578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SFMBT1Q9UHJ3 RAI2-203ENST00000415486 2037 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SFMBT1Q9UHJ3 CFAP100-201ENST00000352312 2086 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SFMBT1Q9UHJ3 SOCS2-AS1-202ENST00000500986 1655 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SFMBT1Q9UHJ3 KAT2A-201ENST00000225916 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SFMBT1Q9UHJ3 NRXN1-209ENST00000405581 5078 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SFMBT1Q9UHJ3 NUDT9-201ENST00000302174 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SFMBT1Q9UHJ3 NEIL2-203ENST00000436750 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SFMBT1Q9UHJ3 RUBCNL-203ENST00000378787 2731 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SFMBT1Q9UHJ3 FAM53A-207ENST00000489363 2776 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SFMBT1Q9UHJ3 GHSR-201ENST00000241256 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SFMBT1Q9UHJ3 RMDN1-202ENST00000430676 1106 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SFMBT1Q9UHJ3 AP000688.4-201ENST00000436303 446 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SFMBT1Q9UHJ3 AC078883.2-201ENST00000441212 558 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SFMBT1Q9UHJ3 HFE-210ENST00000470149 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SFMBT1Q9UHJ3 AC034243.1-201ENST00000520838 587 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SFMBT1Q9UHJ3 TSPAN4-214ENST00000525201 834 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SFMBT1Q9UHJ3 EEF1D-238ENST00000531621 840 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SFMBT1Q9UHJ3 PSME1-205ENST00000559123 1033 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SFMBT1Q9UHJ3 YPEL3-209ENST00000566595 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SFMBT1Q9UHJ3 SCN5A-214ENST00000612060 714 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SFMBT1Q9UHJ3 AC116407.3-201ENST00000623905 1129 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
SFMBT1Q9UHJ3 TMEM198-201ENST00000344458 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SFMBT1Q9UHJ3 PIGF-201ENST00000281382 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SFMBT1Q9UHJ3 RGS11-203ENST00000359740 1371 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SFMBT1Q9UHJ3 C19orf54-203ENST00000470681 2521 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SFMBT1Q9UHJ3 C6orf223-203ENST00000442114 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SFMBT1Q9UHJ3 RSRC1-211ENST00000480820 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SFMBT1Q9UHJ3 CRB3-203ENST00000598494 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SFMBT1Q9UHJ3 HMGXB3-206ENST00000613459 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SFMBT1Q9UHJ3 CLDN9-201ENST00000445369 2050 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SFMBT1Q9UHJ3 PPM1M-202ENST00000323588 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SFMBT1Q9UHJ3 IL18BP-207ENST00000404792 2172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SFMBT1Q9UHJ3 SLC7A9-202ENST00000587772 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SFMBT1Q9UHJ3 CXXC1-212ENST00000589940 2242 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SFMBT1Q9UHJ3 MBD4-202ENST00000393278 1684 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SFMBT1Q9UHJ3 PWP1-202ENST00000541166 1722 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SFMBT1Q9UHJ3 MYBPH-202ENST00000621380 1772 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SFMBT1Q9UHJ3 SUSD4-208ENST00000494793 1833 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SFMBT1Q9UHJ3 TMEM175-201ENST00000264771 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SFMBT1Q9UHJ3 DDIT4L-201ENST00000273990 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SFMBT1Q9UHJ3 CCDC177-201ENST00000599174 4131 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SFMBT1Q9UHJ3 APBB1-224ENST00000621678 1907 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SFMBT1Q9UHJ3 MARK2-209ENST00000509502 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SFMBT1Q9UHJ3 TBXAS1-206ENST00000425687 2080 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SFMBT1Q9UHJ3 CENPM-204ENST00000402420 688 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SFMBT1Q9UHJ3 NTMT1-205ENST00000459968 1123 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SFMBT1Q9UHJ3 NTMT1-207ENST00000482347 1072 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SFMBT1Q9UHJ3 AC093909.1-201ENST00000504731 1122 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
SFMBT1Q9UHJ3 AC099805.1-202ENST00000519927 1057 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SFMBT1Q9UHJ3 CNOT8-225ENST00000524105 904 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SFMBT1Q9UHJ3 PRSS8-206ENST00000568261 1214 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SFMBT1Q9UHJ3 PML-221ENST00000569965 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SFMBT1Q9UHJ3 AL512343.2-201ENST00000609423 490 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SFMBT1Q9UHJ3 TRAF3IP1-201ENST00000373327 4279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SFMBT1Q9UHJ3 ACTRT2-201ENST00000378404 1421 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SFMBT1Q9UHJ3 GPN3-202ENST00000537466 1491 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SFMBT1Q9UHJ3 PRKAR1B-204ENST00000406797 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SFMBT1Q9UHJ3 B4GALT2-202ENST00000356836 2629 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SFMBT1Q9UHJ3 AL135999.2-201ENST00000622438 1686 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
SFMBT1Q9UHJ3 HHATL-201ENST00000310417 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SFMBT1Q9UHJ3 RPS6KA5-201ENST00000418736 2249 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SFMBT1Q9UHJ3 ITGAV-202ENST00000374907 6903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SFMBT1Q9UHJ3 MAPKAPK3-201ENST00000357955 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SFMBT1Q9UHJ3 CAP2-208ENST00000611958 2686 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SFMBT1Q9UHJ3 SLC30A2-202ENST00000374278 3097 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SFMBT1Q9UHJ3 LENG8-202ENST00000376514 5146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SFMBT1Q9UHJ3 PCNX2-201ENST00000258229 7518 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SFMBT1Q9UHJ3 LGALS1-201ENST00000215909 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.6 ms