Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHG2

PCSK1N, ProSAAS, humanhuman

Predictions only

Length 260 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCSK1NQ9UHG2 PCDHA13-201ENST00000289272 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PCSK1NQ9UHG2 ZNF804A-201ENST00000302277 4690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PCSK1NQ9UHG2 FRMD4A-203ENST00000357447 6821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PCSK1NQ9UHG2 PCDHA6-202ENST00000527624 2231 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PCSK1NQ9UHG2 ANHX-201ENST00000419717 1765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PCSK1NQ9UHG2 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PCSK1NQ9UHG2 OGFR-201ENST00000290291 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PCSK1NQ9UHG2 RIC8B-203ENST00000392839 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PCSK1NQ9UHG2 C11orf80-203ENST00000525449 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PCSK1NQ9UHG2 LUC7L2-202ENST00000354926 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PCSK1NQ9UHG2 TRIM60-203ENST00000508504 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PCSK1NQ9UHG2 RNF128-201ENST00000255499 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PCSK1NQ9UHG2 PTPN18-201ENST00000175756 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PCSK1NQ9UHG2 PWP1-202ENST00000541166 1722 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PCSK1NQ9UHG2 BCS1L-202ENST00000392109 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PCSK1NQ9UHG2 BCS1L-204ENST00000392111 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PCSK1NQ9UHG2 LINC00271-201ENST00000421378 1580 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PCSK1NQ9UHG2 ISM1-201ENST00000262487 2593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PCSK1NQ9UHG2 SLC12A9-202ENST00000415287 1912 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PCSK1NQ9UHG2 RAB40C-205ENST00000539661 2609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PCSK1NQ9UHG2 OR10H5-201ENST00000308940 1132 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PCSK1NQ9UHG2 FAM86B2-202ENST00000309608 806 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PCSK1NQ9UHG2 GNB1L-203ENST00000405009 1076 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PCSK1NQ9UHG2 AKR7L-201ENST00000420396 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PCSK1NQ9UHG2 AP000344.1-201ENST00000454268 641 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PCSK1NQ9UHG2 AP000344.1-202ENST00000457193 586 ntTSL 4 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PCSK1NQ9UHG2 CCDC112-205ENST00000506442 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PCSK1NQ9UHG2 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PCSK1NQ9UHG2 AC087289.1-201ENST00000586808 890 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PCSK1NQ9UHG2 AC114488.2-214ENST00000609033 813 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PCSK1NQ9UHG2 AXIN2-208ENST00000611991 1019 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PCSK1NQ9UHG2 AL162497.1-201ENST00000615635 518 ntTSL 4 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PCSK1NQ9UHG2 AC073592.5-201ENST00000624854 528 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
PCSK1NQ9UHG2 CCNC-219ENST00000627680 896 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PCSK1NQ9UHG2 ATP6V0E2-202ENST00000425642 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PCSK1NQ9UHG2 NSDHL-203ENST00000440023 1630 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PCSK1NQ9UHG2 ATAD3A-207ENST00000536055 2332 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PCSK1NQ9UHG2 ARHGAP8-201ENST00000336963 1487 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PCSK1NQ9UHG2 DNAJC28-203ENST00000402202 1480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PCSK1NQ9UHG2 KCNV2-201ENST00000382082 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PCSK1NQ9UHG2 ICAM3-205ENST00000589261 2024 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PCSK1NQ9UHG2 AC116353.5-201ENST00000638148 1699 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
PCSK1NQ9UHG2 C11orf68-203ENST00000530188 1528 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PCSK1NQ9UHG2 UNC119-204ENST00000470125 2050 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PCSK1NQ9UHG2 KIF16B-203ENST00000408042 4640 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PCSK1NQ9UHG2 TTLL10-202ENST00000379289 2259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PCSK1NQ9UHG2 MFGE8-201ENST00000268150 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PCSK1NQ9UHG2 CACNA1G-206ENST00000416767 4899 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PCSK1NQ9UHG2 CDKN1B-201ENST00000228872 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PCSK1NQ9UHG2 HES1-201ENST00000232424 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PCSK1NQ9UHG2 PRDM5-203ENST00000428209 2338 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PCSK1NQ9UHG2 TTC29-201ENST00000325106 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PCSK1NQ9UHG2 PAPD5-203ENST00000561678 2916 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PCSK1NQ9UHG2 SGPP2-201ENST00000321276 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PCSK1NQ9UHG2 TMEM106C-203ENST00000449758 1414 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PCSK1NQ9UHG2 FOXO3-202ENST00000406360 7341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PCSK1NQ9UHG2 MAP3K8-207ENST00000542547 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PCSK1NQ9UHG2 CLDN4-201ENST00000340958 1831 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PCSK1NQ9UHG2 TRAPPC11-201ENST00000334690 4552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PCSK1NQ9UHG2 PSCA-201ENST00000301258 1020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PCSK1NQ9UHG2 MRPL23-201ENST00000381514 919 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PCSK1NQ9UHG2 METTL21A-205ENST00000426075 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PCSK1NQ9UHG2 HCG4P8-203ENST00000443049 980 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
PCSK1NQ9UHG2 COX18-204ENST00000507544 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PCSK1NQ9UHG2 ZFPM1-205ENST00000569086 563 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PCSK1NQ9UHG2 MIR5100-201ENST00000579544 119 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
PCSK1NQ9UHG2 SRSF1-209ENST00000585096 568 ntTSL 4 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PCSK1NQ9UHG2 AL513523.2-201ENST00000633218 660 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PCSK1NQ9UHG2 MAP3K9-206ENST00000555993 4449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PCSK1NQ9UHG2 TNFSF14-202ENST00000599359 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PCSK1NQ9UHG2 WWTR1-201ENST00000360632 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PCSK1NQ9UHG2 TRIM17-201ENST00000295033 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PCSK1NQ9UHG2 ADARB1-204ENST00000389863 3563 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PCSK1NQ9UHG2 ITGB7-202ENST00000422257 2791 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PCSK1NQ9UHG2 KCNK3-201ENST00000302909 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PCSK1NQ9UHG2 MAPK11-201ENST00000330651 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PCSK1NQ9UHG2 B3GNT3-201ENST00000318683 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PCSK1NQ9UHG2 SLC1A5-205ENST00000594991 2031 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PCSK1NQ9UHG2 LINC00595-204ENST00000434974 2692 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PCSK1NQ9UHG2 RDH12-201ENST00000267502 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PCSK1NQ9UHG2 ORAOV1-206ENST00000536870 2274 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PCSK1NQ9UHG2 SCRIB-203ENST00000377533 5108 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PCSK1NQ9UHG2 MOV10L1-203ENST00000395852 1422 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PCSK1NQ9UHG2 CHUK-201ENST00000370397 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PCSK1NQ9UHG2 DIP2A-204ENST00000457905 3044 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PCSK1NQ9UHG2 TRA2A-212ENST00000621813 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PCSK1NQ9UHG2 CHGA-202ENST00000334654 1474 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PCSK1NQ9UHG2 TBX6-203ENST00000553607 2162 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PCSK1NQ9UHG2 MAP7-209ENST00000618822 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PCSK1NQ9UHG2 ZADH2-201ENST00000322342 7732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PCSK1NQ9UHG2 CDKN1C-201ENST00000380725 1220 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PCSK1NQ9UHG2 UBE2J2-204ENST00000400929 1057 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PCSK1NQ9UHG2 AL096828.1-201ENST00000423020 542 ntTSL 4 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PCSK1NQ9UHG2 PHGR1-201ENST00000448599 436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PCSK1NQ9UHG2 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PCSK1NQ9UHG2 FOSL1P1-201ENST00000511041 816 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
PCSK1NQ9UHG2 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PCSK1NQ9UHG2 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PCSK1NQ9UHG2 AL157871.1-202ENST00000556458 478 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PCSK1NQ9UHG2 COX5A-204ENST00000567270 579 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.2 ms