Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBY8

CLN8, Protein CLN8, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLN8Q9UBY8 AL121912.1-201ENST00000603683 238 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
CLN8Q9UBY8 LINC00454-206ENST00000609861 841 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
CLN8Q9UBY8 LRRC23-215ENST00000622489 1061 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
CLN8Q9UBY8 PP12613-201ENST00000424958 2230 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
CLN8Q9UBY8 ETV7-204ENST00000373738 1570 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
CLN8Q9UBY8 RBFOX1-222ENST00000585867 1580 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
CLN8Q9UBY8 AL138828.1-202ENST00000576956 1881 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
CLN8Q9UBY8 SERPINB6-208ENST00000616722 2047 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
CLN8Q9UBY8 MFSD2A-202ENST00000372811 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
CLN8Q9UBY8 AC108860.2-201ENST00000562760 2183 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
CLN8Q9UBY8 FCGBP-203ENST00000620799 4926 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
CLN8Q9UBY8 NR1H3-202ENST00000405576 1352 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
CLN8Q9UBY8 BX276092.7-203ENST00000637198 1536 ntBASIC14.71□□□□□ -0.06
CLN8Q9UBY8 DDX1-207ENST00000617198 2257 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
CLN8Q9UBY8 VPS51-201ENST00000279281 2714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
CLN8Q9UBY8 EPM2A-201ENST00000367519 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
CLN8Q9UBY8 SEPHS1-202ENST00000378614 2387 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CLN8Q9UBY8 ARHGAP8-201ENST00000336963 1487 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CLN8Q9UBY8 VIPR2-202ENST00000377633 1491 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CLN8Q9UBY8 CD151-203ENST00000397421 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CLN8Q9UBY8 C8orf46-215ENST00000522977 1347 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CLN8Q9UBY8 C2orf27B-201ENST00000623129 1325 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CLN8Q9UBY8 MAP7-203ENST00000438100 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CLN8Q9UBY8 SATB1-201ENST00000338745 7810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CLN8Q9UBY8 NKIRAS1-207ENST00000437230 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CLN8Q9UBY8 EIF2AK4-201ENST00000263791 5499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CLN8Q9UBY8 IMP4-201ENST00000259239 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CLN8Q9UBY8 KXD1-201ENST00000222307 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CLN8Q9UBY8 METTL9-201ENST00000358154 3256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CLN8Q9UBY8 RAB23-202ENST00000468148 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CLN8Q9UBY8 RSPH14-201ENST00000216036 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CLN8Q9UBY8 AKR1C7P-201ENST00000305623 895 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
CLN8Q9UBY8 SZT2-202ENST00000372450 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CLN8Q9UBY8 GGT1-207ENST00000404532 853 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CLN8Q9UBY8 AC026396.1-201ENST00000419388 421 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
CLN8Q9UBY8 AC103564.2-201ENST00000432853 1299 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
CLN8Q9UBY8 CUTA-210ENST00000488034 769 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CLN8Q9UBY8 REXO2-206ENST00000539275 710 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CLN8Q9UBY8 SMAD3-210ENST00000559092 584 ntTSL 4 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CLN8Q9UBY8 AL096870.2-201ENST00000565988 2108 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CLN8Q9UBY8 ZNF554-204ENST00000591265 1148 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CLN8Q9UBY8 AC008608.2-201ENST00000606089 416 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
CLN8Q9UBY8 LDHAL6A-203ENST00000615355 1042 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CLN8Q9UBY8 ECE2-201ENST00000324557 1823 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CLN8Q9UBY8 BCL11B-202ENST00000357195 7559 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CLN8Q9UBY8 PFKL-201ENST00000349048 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CLN8Q9UBY8 MICA-209ENST00000449934 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CLN8Q9UBY8 IGF2-205ENST00000416167 5585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CLN8Q9UBY8 AL355312.1-201ENST00000407115 2176 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
CLN8Q9UBY8 TLK2-201ENST00000326270 3512 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CLN8Q9UBY8 COBL-201ENST00000265136 5291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CLN8Q9UBY8 ERO1A-201ENST00000395686 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CLN8Q9UBY8 ACTN4-201ENST00000252699 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CLN8Q9UBY8 TRAF3IP1-202ENST00000391993 4003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CLN8Q9UBY8 MAP4K2-202ENST00000377350 2931 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CLN8Q9UBY8 ORAI2-202ENST00000403646 2528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CLN8Q9UBY8 ZBTB45-202ENST00000594051 2541 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CLN8Q9UBY8 FFAR2-202ENST00000599180 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CLN8Q9UBY8 LRRC27-214ENST00000625755 1738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CLN8Q9UBY8 NFATC2-206ENST00000609943 5690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CLN8Q9UBY8 EWSR1-202ENST00000332035 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CLN8Q9UBY8 FLOT2-202ENST00000394908 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CLN8Q9UBY8 TRABD2A-202ENST00000409133 1554 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CLN8Q9UBY8 AC141586.5-201ENST00000624546 2050 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
CLN8Q9UBY8 ZBTB7C-221ENST00000590800 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CLN8Q9UBY8 DNM1-202ENST00000372923 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
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CLN8Q9UBY8 PRPF19-201ENST00000227524 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CLN8Q9UBY8 RGS14-201ENST00000408923 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CLN8Q9UBY8 TMEM14A-201ENST00000211314 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
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CLN8Q9UBY8 GNMT-201ENST00000372808 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CLN8Q9UBY8 COX5BP2-201ENST00000392354 334 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
CLN8Q9UBY8 SLC9A3R1-202ENST00000413388 1285 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CLN8Q9UBY8 AL096828.1-201ENST00000423020 542 ntTSL 4 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CLN8Q9UBY8 ABCD1P5-201ENST00000445663 754 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
CLN8Q9UBY8 PON3-205ENST00000451904 1053 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CLN8Q9UBY8 AP000344.1-201ENST00000454268 641 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CLN8Q9UBY8 AP000344.1-202ENST00000457193 586 ntTSL 4 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CLN8Q9UBY8 AC026336.2-201ENST00000563922 763 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CLN8Q9UBY8 KLK8-205ENST00000593490 267 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CLN8Q9UBY8 AL031008.1-201ENST00000619963 541 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
CLN8Q9UBY8 ANKMY2-206ENST00000628652 1270 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CLN8Q9UBY8 AC023830.1-201ENST00000569678 1543 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CLN8Q9UBY8 TNIP1-211ENST00000521591 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CLN8Q9UBY8 ZNF668-201ENST00000300849 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CLN8Q9UBY8 HRAT92-201ENST00000452622 3506 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CLN8Q9UBY8 DUS3L-201ENST00000309061 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CLN8Q9UBY8 NTRK2-207ENST00000376214 5608 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CLN8Q9UBY8 CFLAR-208ENST00000423241 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CLN8Q9UBY8 ZBTB10-202ENST00000426744 9878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CLN8Q9UBY8 SNX1-208ENST00000559844 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CLN8Q9UBY8 SRPX-202ENST00000432886 1725 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CLN8Q9UBY8 COL8A2-202ENST00000397799 4670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CLN8Q9UBY8 RABL6-203ENST00000371663 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CLN8Q9UBY8 ZNF500-201ENST00000219478 5880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
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