Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBT3

DKK4, Dickkopf-related protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DKK4Q9UBT3 GS1-24F4.2-201ENST00000500823 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
DKK4Q9UBT3 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
DKK4Q9UBT3 API5-211ENST00000534695 560 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
DKK4Q9UBT3 AC007216.4-201ENST00000574364 562 ntTSL 4 BASIC15.98■□□□□ 0.15
DKK4Q9UBT3 KF456478.1-201ENST00000585980 472 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
DKK4Q9UBT3 AC027307.2-201ENST00000591252 911 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
DKK4Q9UBT3 GPER1-207ENST00000619052 571 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
DKK4Q9UBT3 PRRT2-219ENST00000637565 1733 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
DKK4Q9UBT3 AC104581.1-203ENST00000640240 353 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
DKK4Q9UBT3 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
DKK4Q9UBT3 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
DKK4Q9UBT3 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
DKK4Q9UBT3 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
DKK4Q9UBT3 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
DKK4Q9UBT3 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
DKK4Q9UBT3 C1orf159-205ENST00000421241 1841 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
DKK4Q9UBT3 RSRP1-201ENST00000243189 1502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
DKK4Q9UBT3 NR1H3-202ENST00000405576 1352 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
DKK4Q9UBT3 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
DKK4Q9UBT3 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
DKK4Q9UBT3 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
DKK4Q9UBT3 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
DKK4Q9UBT3 SIGLEC10-204ENST00000436984 1776 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
DKK4Q9UBT3 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
DKK4Q9UBT3 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
DKK4Q9UBT3 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
DKK4Q9UBT3 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
DKK4Q9UBT3 GLYCTK-207ENST00000477382 1304 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
DKK4Q9UBT3 TCTN1-204ENST00000397659 1885 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
DKK4Q9UBT3 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
DKK4Q9UBT3 CCDC94-201ENST00000262962 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
DKK4Q9UBT3 SLCO4A1-AS1-202ENST00000433126 1420 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
DKK4Q9UBT3 SLC22A7-201ENST00000372574 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
DKK4Q9UBT3 AC009949.1-201ENST00000623048 1830 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
DKK4Q9UBT3 AC073349.1-201ENST00000340779 1062 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
DKK4Q9UBT3 C1orf68-201ENST00000368775 949 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
DKK4Q9UBT3 FAM19A3-202ENST00000369630 1282 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
DKK4Q9UBT3 TCEAL3-203ENST00000372628 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
DKK4Q9UBT3 PRAP1-201ENST00000433452 971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
DKK4Q9UBT3 SMCO4-204ENST00000527149 472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
DKK4Q9UBT3 SCN4B-204ENST00000529878 566 ntTSL 4 BASIC15.97■□□□□ 0.15
DKK4Q9UBT3 NR2C2AP-204ENST00000538165 891 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
DKK4Q9UBT3 MPI-209ENST00000564003 1195 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
DKK4Q9UBT3 AL031717.1-201ENST00000569670 565 ntTSL 4 BASIC15.97■□□□□ 0.15
DKK4Q9UBT3 AC087645.2-202ENST00000586583 643 ntTSL 4 BASIC15.97■□□□□ 0.15
DKK4Q9UBT3 AC012615.6-204ENST00000587741 477 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
DKK4Q9UBT3 AL132655.2-201ENST00000596276 594 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
DKK4Q9UBT3 AC007967.4-201ENST00000614700 386 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
DKK4Q9UBT3 SFT2D2-204ENST00000630869 1073 ntTSL 4 BASIC15.97■□□□□ 0.15
DKK4Q9UBT3 RAB34-223ENST00000636154 730 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
DKK4Q9UBT3 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
DKK4Q9UBT3 AL135999.2-201ENST00000622438 1686 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
DKK4Q9UBT3 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
DKK4Q9UBT3 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
DKK4Q9UBT3 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
DKK4Q9UBT3 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
DKK4Q9UBT3 F10-202ENST00000375559 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
DKK4Q9UBT3 HPCAL1-206ENST00000613496 1547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
DKK4Q9UBT3 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
DKK4Q9UBT3 MTERF2-201ENST00000240050 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
DKK4Q9UBT3 HTR1A-201ENST00000323865 1778 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
DKK4Q9UBT3 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
DKK4Q9UBT3 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
DKK4Q9UBT3 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
DKK4Q9UBT3 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
DKK4Q9UBT3 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
DKK4Q9UBT3 SRGAP2C-201ENST00000304465 1477 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
DKK4Q9UBT3 SRGAP2-201ENST00000419187 1477 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
DKK4Q9UBT3 SRGAP2B-205ENST00000619678 1477 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
DKK4Q9UBT3 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
DKK4Q9UBT3 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
DKK4Q9UBT3 DIABLO-203ENST00000353548 1345 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
DKK4Q9UBT3 FUT2-201ENST00000391876 1593 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
DKK4Q9UBT3 AC073592.3-201ENST00000625118 1834 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
DKK4Q9UBT3 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
DKK4Q9UBT3 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
DKK4Q9UBT3 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
DKK4Q9UBT3 PDHX-203ENST00000448838 2653 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
DKK4Q9UBT3 AC012569.1-201ENST00000591191 1524 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
DKK4Q9UBT3 NDUFB7-201ENST00000215565 531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
DKK4Q9UBT3 MAGEC1-202ENST00000406005 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
DKK4Q9UBT3 Z94721.1-201ENST00000444102 385 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
DKK4Q9UBT3 PAX5-207ENST00000446742 885 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
DKK4Q9UBT3 SFTPC-204ENST00000520605 519 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
DKK4Q9UBT3 AC084125.2-203ENST00000532766 821 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
DKK4Q9UBT3 FAM192A-212ENST00000566077 1066 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
DKK4Q9UBT3 PSMD7-204ENST00000567958 692 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
DKK4Q9UBT3 NAA38-206ENST00000576384 424 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
DKK4Q9UBT3 MIR3909-201ENST00000579518 119 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
DKK4Q9UBT3 TMEM205-208ENST00000587948 688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
DKK4Q9UBT3 TMEM205-211ENST00000589555 788 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
DKK4Q9UBT3 MRPL34-202ENST00000594999 555 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
DKK4Q9UBT3 AC018529.1-201ENST00000613063 361 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
DKK4Q9UBT3 AL138828.2-201ENST00000615812 383 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
DKK4Q9UBT3 SPDYE12P-201ENST00000618416 771 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
DKK4Q9UBT3 EIF6-209ENST00000621148 1054 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
DKK4Q9UBT3 IGHV3-72-202ENST00000621503 303 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
DKK4Q9UBT3 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
DKK4Q9UBT3 FHL2-201ENST00000322142 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
DKK4Q9UBT3 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.6 ms