Protein–RNA interactions for Protein: Q9P219

CCDC88C, Protein Daple, humanhuman

Predictions only

Length 2,028 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC88CQ9P219 CSF3-202ENST00000331769 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CCDC88CQ9P219 HNRNPM-217ENST00000620401 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CCDC88CQ9P219 PMEPA1-202ENST00000341744 4845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CCDC88CQ9P219 AL096870.2-201ENST00000565988 2108 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CCDC88CQ9P219 SLC7A9-204ENST00000590341 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CCDC88CQ9P219 HAS3-205ENST00000569188 2170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CCDC88CQ9P219 MAPKAP1-208ENST00000394063 2977 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CCDC88CQ9P219 ANAPC2-201ENST00000323927 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CCDC88CQ9P219 HFE2-201ENST00000336751 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CCDC88CQ9P219 DNM2-201ENST00000355667 3541 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CCDC88CQ9P219 FAM234A-202ENST00000301679 1936 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CCDC88CQ9P219 GPANK1-201ENST00000375893 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CCDC88CQ9P219 NOMO1-208ENST00000620755 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CCDC88CQ9P219 PDE2A-226ENST00000544570 3119 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CCDC88CQ9P219 CBWD1-202ENST00000356521 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CCDC88CQ9P219 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CCDC88CQ9P219 GOSR2-201ENST00000225567 1245 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CCDC88CQ9P219 COX10-202ENST00000429152 875 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CCDC88CQ9P219 PMS2P1-201ENST00000431037 1228 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
CCDC88CQ9P219 HCG15-203ENST00000438190 1032 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CCDC88CQ9P219 CHMP1A-208ENST00000550102 803 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CCDC88CQ9P219 AC243965.1-201ENST00000557595 781 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CCDC88CQ9P219 AC018529.2-201ENST00000612024 828 ntTSL 4 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CCDC88CQ9P219 RBPMS-203ENST00000339877 1341 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CCDC88CQ9P219 SNX17-210ENST00000537606 2400 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CCDC88CQ9P219 EML3-201ENST00000278845 3017 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CCDC88CQ9P219 EIF4E1B-201ENST00000318682 1974 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CCDC88CQ9P219 MACF1-233ENST00000602421 1423 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CCDC88CQ9P219 IGLON5-201ENST00000270642 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CCDC88CQ9P219 EGR3-204ENST00000522910 1553 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CCDC88CQ9P219 TTC8-202ENST00000345383 2329 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CCDC88CQ9P219 EZR-202ENST00000367075 3096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CCDC88CQ9P219 SIPA1-209ENST00000534313 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CCDC88CQ9P219 ADCY9-201ENST00000294016 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CCDC88CQ9P219 DNAH14-205ENST00000366850 1103 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CCDC88CQ9P219 AC034213.1-201ENST00000507681 806 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CCDC88CQ9P219 MSRA-206ENST00000521209 814 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CCDC88CQ9P219 DYNLL1-204ENST00000548214 616 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CCDC88CQ9P219 YPEL3-209ENST00000566595 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CCDC88CQ9P219 MED16-213ENST00000616387 1078 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CCDC88CQ9P219 LINC01097-201ENST00000627163 2122 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CCDC88CQ9P219 WDFY4-202ENST00000360890 2193 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CCDC88CQ9P219 AL731569.1-201ENST00000428940 3058 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CCDC88CQ9P219 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CCDC88CQ9P219 DIABLO-206ENST00000443649 2250 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CCDC88CQ9P219 MYB-205ENST00000367814 3302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CCDC88CQ9P219 ABCB9-207ENST00000442833 2587 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CCDC88CQ9P219 BDKRB1-201ENST00000216629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CCDC88CQ9P219 SOCS2-AS1-202ENST00000500986 1655 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CCDC88CQ9P219 DNM1-216ENST00000634267 2909 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CCDC88CQ9P219 TOM1L2-203ENST00000395739 1766 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CCDC88CQ9P219 C12orf56-207ENST00000543942 3242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CCDC88CQ9P219 AGFG1-201ENST00000310078 8668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CCDC88CQ9P219 SYNGR2-206ENST00000589711 2041 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CCDC88CQ9P219 CCDC112-205ENST00000506442 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CCDC88CQ9P219 GAL3ST4-201ENST00000360039 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CCDC88CQ9P219 KRTCAP2-201ENST00000295682 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CCDC88CQ9P219 CENPM-203ENST00000402338 1002 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CCDC88CQ9P219 AL450267.1-201ENST00000557174 520 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CCDC88CQ9P219 AC008687.7-201ENST00000593309 920 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CCDC88CQ9P219 AL356488.2-201ENST00000602755 427 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
CCDC88CQ9P219 ALKBH3-201ENST00000302708 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CCDC88CQ9P219 LZTS1-203ENST00000522290 1614 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CCDC88CQ9P219 MARK4-210ENST00000620044 2105 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CCDC88CQ9P219 STRADA-254ENST00000640999 2336 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CCDC88CQ9P219 SEPHS1-202ENST00000378614 2387 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CCDC88CQ9P219 GLIS1-202ENST00000628545 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CCDC88CQ9P219 QSOX2-201ENST00000358701 4530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CCDC88CQ9P219 NADSYN1-201ENST00000319023 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CCDC88CQ9P219 PHF20L1-203ENST00000337920 2311 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CCDC88CQ9P219 FFAR2-202ENST00000599180 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CCDC88CQ9P219 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CCDC88CQ9P219 DYRK1B-203ENST00000430012 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CCDC88CQ9P219 CDH23-212ENST00000616684 4814 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CCDC88CQ9P219 PIR-202ENST00000380421 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CCDC88CQ9P219 ANAPC13-206ENST00000514612 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CCDC88CQ9P219 ANAPC11-211ENST00000575195 1361 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CCDC88CQ9P219 C12orf76-202ENST00000546627 461 ntTSL 4 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CCDC88CQ9P219 AC004801.5-202ENST00000546804 530 ntTSL 4 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CCDC88CQ9P219 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CCDC88CQ9P219 SH2D3C-205ENST00000420366 2682 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CCDC88CQ9P219 JMJD4-201ENST00000366758 2595 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CCDC88CQ9P219 ACBD3-201ENST00000366812 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CCDC88CQ9P219 UNC119-204ENST00000470125 2050 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CCDC88CQ9P219 AC008969.1-203ENST00000313957 1897 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CCDC88CQ9P219 VAC14-201ENST00000261776 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CCDC88CQ9P219 TMEM59L-205ENST00000600490 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CCDC88CQ9P219 RNF128-201ENST00000255499 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CCDC88CQ9P219 TRIM60-203ENST00000508504 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CCDC88CQ9P219 MGAT2-201ENST00000305386 2687 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CCDC88CQ9P219 ISM1-201ENST00000262487 2593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CCDC88CQ9P219 FUT8-AS1-201ENST00000621019 1521 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
CCDC88CQ9P219 AL353593.2-201ENST00000602529 1483 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
CCDC88CQ9P219 ST6GALNAC6-202ENST00000373141 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CCDC88CQ9P219 AC074389.1-201ENST00000382528 1423 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CCDC88CQ9P219 TFAP2E-201ENST00000373235 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CCDC88CQ9P219 AGTRAP-205ENST00000400895 786 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CCDC88CQ9P219 SPCS2-207ENST00000530257 612 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CCDC88CQ9P219 PIN1-206ENST00000587625 878 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CCDC88CQ9P219 HOTTIP_1.1-201ENST00000620415 57 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37 ms