Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0W5

SCHIP1, Schwannomin-interacting protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 487 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCHIP1Q9P0W5 PLCB2-202ENST00000456256 4242 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SCHIP1Q9P0W5 CD276-201ENST00000318424 2738 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SCHIP1Q9P0W5 LINC00683-201ENST00000578803 2221 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SCHIP1Q9P0W5 BMS1P4-202ENST00000584747 1716 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SCHIP1Q9P0W5 SPDYE5-203ENST00000625065 1700 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SCHIP1Q9P0W5 MAN2A2-216ENST00000559717 6704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SCHIP1Q9P0W5 RTKN-203ENST00000305557 2646 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SCHIP1Q9P0W5 TAPBP-233ENST00000426633 1888 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SCHIP1Q9P0W5 ADGRA1-203ENST00000607359 6004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SCHIP1Q9P0W5 GAL3ST4-201ENST00000360039 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SCHIP1Q9P0W5 CEBPG-201ENST00000284000 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SCHIP1Q9P0W5 TM2D3-201ENST00000333202 1381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SCHIP1Q9P0W5 C8orf58-207ENST00000615223 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SCHIP1Q9P0W5 TMEM237-213ENST00000621467 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SCHIP1Q9P0W5 HIC1-202ENST00000399849 3156 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SCHIP1Q9P0W5 DENND5B-201ENST00000354285 3132 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SCHIP1Q9P0W5 CTIF-201ENST00000256413 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SCHIP1Q9P0W5 SIRPAP1-201ENST00000448467 1770 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
SCHIP1Q9P0W5 LYRM9-203ENST00000460380 2196 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SCHIP1Q9P0W5 CACNA1G-201ENST00000352832 7848 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SCHIP1Q9P0W5 PURB-201ENST00000395699 9069 ntAPPRIS P1 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SCHIP1Q9P0W5 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SCHIP1Q9P0W5 MFSD14A-201ENST00000370152 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SCHIP1Q9P0W5 MCFD2-208ENST00000409973 821 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SCHIP1Q9P0W5 PON3-205ENST00000451904 1053 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SCHIP1Q9P0W5 LAT-205ENST00000454369 1262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SCHIP1Q9P0W5 PQLC2L-205ENST00000461040 563 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SCHIP1Q9P0W5 ATP5G2-204ENST00000549164 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SCHIP1Q9P0W5 AC025259.3-201ENST00000564531 542 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SCHIP1Q9P0W5 TMEM220-AS1-202ENST00000580899 561 ntTSL 4 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SCHIP1Q9P0W5 ATP5G2-209ENST00000602871 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SCHIP1Q9P0W5 IZUMO4-213ENST00000620263 947 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SCHIP1Q9P0W5 TLL1-204ENST00000507499 4818 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SCHIP1Q9P0W5 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SCHIP1Q9P0W5 CCDC115-201ENST00000259229 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SCHIP1Q9P0W5 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SCHIP1Q9P0W5 SRF-201ENST00000265354 4202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SCHIP1Q9P0W5 MYO1D-201ENST00000318217 5563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SCHIP1Q9P0W5 RNF222-201ENST00000344001 2786 ntAPPRIS P1 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SCHIP1Q9P0W5 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SCHIP1Q9P0W5 CLDND1-204ENST00000394185 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SCHIP1Q9P0W5 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SCHIP1Q9P0W5 NSUN5P2-205ENST00000602348 1776 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SCHIP1Q9P0W5 SLC39A3-202ENST00000455372 2940 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
SCHIP1Q9P0W5 SLC30A4-201ENST00000261867 7157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
SCHIP1Q9P0W5 LINC00574-201ENST00000420557 2318 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
SCHIP1Q9P0W5 CLPB-212ENST00000543042 2133 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
SCHIP1Q9P0W5 FDXR-203ENST00000420580 1705 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
SCHIP1Q9P0W5 HECTD2-204ENST00000446394 4939 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
SCHIP1Q9P0W5 TSC2-207ENST00000439673 5287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
SCHIP1Q9P0W5 NOTCH2NL-201ENST00000362074 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
SCHIP1Q9P0W5 ZNF133-211ENST00000538547 2245 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
SCHIP1Q9P0W5 ELF2-204ENST00000394235 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
SCHIP1Q9P0W5 INPP5J-202ENST00000400294 2393 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
SCHIP1Q9P0W5 GPS1-201ENST00000306823 1842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
SCHIP1Q9P0W5 GML-201ENST00000220940 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
SCHIP1Q9P0W5 IGLL1-202ENST00000330377 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
SCHIP1Q9P0W5 QRFP-201ENST00000343079 411 ntAPPRIS P1 BASIC17.27■□□□□ 0.36
SCHIP1Q9P0W5 CD9-202ENST00000382515 1229 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
SCHIP1Q9P0W5 RBM17P3-201ENST00000417687 1192 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
SCHIP1Q9P0W5 FAM197Y8-203ENST00000450145 560 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
SCHIP1Q9P0W5 TSTD3-201ENST00000452647 962 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
SCHIP1Q9P0W5 AC122714.2-201ENST00000502787 707 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
SCHIP1Q9P0W5 MOK-208ENST00000519058 917 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
SCHIP1Q9P0W5 RAD52-211ENST00000536177 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
SCHIP1Q9P0W5 AXIN2-208ENST00000611991 1019 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
SCHIP1Q9P0W5 AC148477.8-201ENST00000624298 468 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
SCHIP1Q9P0W5 ANKMY2-206ENST00000628652 1270 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
SCHIP1Q9P0W5 AP000867.4-201ENST00000641616 219 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
SCHIP1Q9P0W5 DCAF8-218ENST00000610139 1607 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
SCHIP1Q9P0W5 CBL-204ENST00000634840 4813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
SCHIP1Q9P0W5 KXD1-201ENST00000222307 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
SCHIP1Q9P0W5 LIFR-202ENST00000453190 4253 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
SCHIP1Q9P0W5 FAM69C-201ENST00000343998 3671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
SCHIP1Q9P0W5 COLEC11-206ENST00000403096 1557 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
SCHIP1Q9P0W5 HOTTIP-202ENST00000472494 2285 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
SCHIP1Q9P0W5 FOLH1-204ENST00000356696 2403 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
SCHIP1Q9P0W5 RNFT2-204ENST00000407967 2415 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
SCHIP1Q9P0W5 HYAL1-204ENST00000395144 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
SCHIP1Q9P0W5 BFSP1-205ENST00000536626 2075 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
SCHIP1Q9P0W5 SNTB1-201ENST00000395601 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
SCHIP1Q9P0W5 PAN3-AS1-201ENST00000563843 1351 ntBASIC17.27■□□□□ 0.35
SCHIP1Q9P0W5 AL590648.2-201ENST00000427949 2225 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
SCHIP1Q9P0W5 SMARCA4-215ENST00000590574 5282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
SCHIP1Q9P0W5 SLC44A3-201ENST00000271227 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SCHIP1Q9P0W5 KRT18P55-202ENST00000578578 1546 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
SCHIP1Q9P0W5 GINS4-206ENST00000520710 2022 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
SCHIP1Q9P0W5 SERPINB6-208ENST00000616722 2047 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
SCHIP1Q9P0W5 NOVA2-201ENST00000263257 7803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SCHIP1Q9P0W5 KLHL24-201ENST00000242810 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SCHIP1Q9P0W5 MMP17-206ENST00000535291 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SCHIP1Q9P0W5 TSSK2-201ENST00000399635 1816 ntAPPRIS P1 BASIC17.26■□□□□ 0.35
SCHIP1Q9P0W5 C2orf27B-201ENST00000623129 1325 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SCHIP1Q9P0W5 MIS18BP1-212ENST00000627697 1950 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
SCHIP1Q9P0W5 FCER2-202ENST00000360067 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
SCHIP1Q9P0W5 HADHB-208ENST00000537713 2142 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
SCHIP1Q9P0W5 PTGES2-201ENST00000277462 1614 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
SCHIP1Q9P0W5 MRPL10-203ENST00000414011 1622 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
SCHIP1Q9P0W5 DSCR9-201ENST00000454482 1644 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SCHIP1Q9P0W5 LZTS1-203ENST00000522290 1614 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.7 ms