Protein–RNA interactions for Protein: Q9NT62

ATG3, Ubiquitin-like-conjugating enzyme ATG3, humanhuman

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG3Q9NT62 HPSE-207ENST00000513463 1458 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ATG3Q9NT62 WDR53-201ENST00000332629 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ATG3Q9NT62 BPGM-203ENST00000418040 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ATG3Q9NT62 RPS6KB1-203ENST00000406116 1982 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ATG3Q9NT62 HNRNPH3-202ENST00000354695 1332 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ATG3Q9NT62 TUBB3P1-201ENST00000405796 1332 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
ATG3Q9NT62 AKAP8P1-201ENST00000434743 1349 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
ATG3Q9NT62 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ATG3Q9NT62 OCIAD1-213ENST00000508293 1423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ATG3Q9NT62 RSRP1-201ENST00000243189 1502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ATG3Q9NT62 MFSD2B-202ENST00000406420 1528 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ATG3Q9NT62 COQ6-220ENST00000629426 1538 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ATG3Q9NT62 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ATG3Q9NT62 NEIL2-203ENST00000436750 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ATG3Q9NT62 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ATG3Q9NT62 NME1-NME2-202ENST00000393193 1021 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ATG3Q9NT62 SNCA-205ENST00000394991 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ATG3Q9NT62 RPL30-202ENST00000396070 440 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ATG3Q9NT62 LINC01812-201ENST00000457448 725 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ATG3Q9NT62 AC009053.3-201ENST00000567148 574 ntTSL 4 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ATG3Q9NT62 THAP3-201ENST00000054650 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ATG3Q9NT62 MTERF2-201ENST00000240050 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ATG3Q9NT62 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ATG3Q9NT62 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ATG3Q9NT62 BIRC8-201ENST00000426466 2026 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ATG3Q9NT62 ELOA3-201ENST00000330682 1877 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ATG3Q9NT62 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ATG3Q9NT62 ACP5-212ENST00000592828 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ATG3Q9NT62 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ATG3Q9NT62 PSMD6-210ENST00000492933 1495 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ATG3Q9NT62 PMS2P4-201ENST00000412466 1052 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
ATG3Q9NT62 AL354836.1-201ENST00000414042 681 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ATG3Q9NT62 NAGK-205ENST00000443938 1221 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ATG3Q9NT62 UGT1A2P-201ENST00000454886 866 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
ATG3Q9NT62 INGX-202ENST00000489074 768 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
ATG3Q9NT62 GNAO1-210ENST00000569295 930 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ATG3Q9NT62 KRT16P2-202ENST00000579062 563 ntTSL 4 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ATG3Q9NT62 AC010336.3-201ENST00000597156 667 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ATG3Q9NT62 AQP12B-206ENST00000621682 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ATG3Q9NT62 FDXR-203ENST00000420580 1705 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ATG3Q9NT62 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ATG3Q9NT62 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ATG3Q9NT62 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ATG3Q9NT62 THNSL2-202ENST00000343544 2052 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ATG3Q9NT62 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ATG3Q9NT62 SIL1-201ENST00000265195 1895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ATG3Q9NT62 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ATG3Q9NT62 GGT3P-201ENST00000412448 2340 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ATG3Q9NT62 PPT2-247ENST00000375143 1754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ATG3Q9NT62 TBXAS1-202ENST00000411653 1792 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ATG3Q9NT62 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ATG3Q9NT62 RAB37-208ENST00000402449 1560 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ATG3Q9NT62 REEP1-208ENST00000538924 1702 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ATG3Q9NT62 SMPD3-211ENST00000568373 2073 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ATG3Q9NT62 MIR943-201ENST00000401286 94 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
ATG3Q9NT62 RBPMS2P1-201ENST00000437762 623 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
ATG3Q9NT62 AC004865.2-202ENST00000444348 852 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ATG3Q9NT62 AL391261.2-201ENST00000554907 773 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ATG3Q9NT62 COX5A-203ENST00000564811 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ATG3Q9NT62 SNHG8-201ENST00000602414 672 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ATG3Q9NT62 SNHG8-205ENST00000602819 470 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ATG3Q9NT62 AC243571.2-201ENST00000615265 628 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ATG3Q9NT62 RAB34-224ENST00000636513 888 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ATG3Q9NT62 GOLGA2-215ENST00000639983 1038 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ATG3Q9NT62 GABARAPL1-201ENST00000266458 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ATG3Q9NT62 FAM153A-203ENST00000440605 1966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ATG3Q9NT62 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ATG3Q9NT62 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ATG3Q9NT62 MTMR12-201ENST00000264934 2215 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ATG3Q9NT62 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ATG3Q9NT62 RUVBL1-202ENST00000464873 2126 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ATG3Q9NT62 WSCD1-209ENST00000574232 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ATG3Q9NT62 CCDC94-201ENST00000262962 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ATG3Q9NT62 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
ATG3Q9NT62 SFN-201ENST00000339276 1320 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ATG3Q9NT62 IGLL5-203ENST00000532223 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ATG3Q9NT62 RAB17-201ENST00000264601 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ATG3Q9NT62 POLR3E-209ENST00000564209 2464 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ATG3Q9NT62 TMEM41A-201ENST00000296254 1060 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ATG3Q9NT62 XAGE1A-203ENST00000375602 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ATG3Q9NT62 XAGE1B-203ENST00000375616 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ATG3Q9NT62 NQO2-203ENST00000380441 1021 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ATG3Q9NT62 AC104135.1-201ENST00000418001 763 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ATG3Q9NT62 AC015922.1-201ENST00000421102 1152 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
ATG3Q9NT62 TSPAN32-207ENST00000451520 1236 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ATG3Q9NT62 ST7-OT4-203ENST00000466018 894 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ATG3Q9NT62 FBXO4-206ENST00000509134 1284 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ATG3Q9NT62 KRTAP5-9-201ENST00000528743 1136 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ATG3Q9NT62 WASHC3-213ENST00000545679 865 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ATG3Q9NT62 FAM177A1-207ENST00000554052 540 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ATG3Q9NT62 AL583722.3-202ENST00000554954 486 ntTSL 4 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ATG3Q9NT62 AC015712.4-202ENST00000558641 1007 ntTSL 4 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ATG3Q9NT62 PMF1-BGLAP-204ENST00000567140 655 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ATG3Q9NT62 AC108010.1-201ENST00000605862 1107 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ATG3Q9NT62 RCAN3-211ENST00000630217 658 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ATG3Q9NT62 OPN5-206ENST00000638973 1090 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ATG3Q9NT62 AF228730.6-201ENST00000641497 218 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
ATG3Q9NT62 AC084121.3-201ENST00000641716 218 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
ATG3Q9NT62 AC105233.6-201ENST00000642093 218 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
ATG3Q9NT62 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.4 ms