Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRW1

RAB6B, Ras-related protein Rab-6B, humanhuman

Predictions only

Length 208 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB6BQ9NRW1 CD72-211ENST00000612238 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
RAB6BQ9NRW1 CDKN1A-204ENST00000448526 2104 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
RAB6BQ9NRW1 ARHGAP44-202ENST00000340825 4211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
RAB6BQ9NRW1 ARHGAP44-203ENST00000379672 4228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
RAB6BQ9NRW1 CNTRL-208ENST00000373865 1917 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
RAB6BQ9NRW1 C2orf81-202ENST00000612891 1902 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
RAB6BQ9NRW1 EWSR1-222ENST00000629659 2446 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
RAB6BQ9NRW1 ILVBL-209ENST00000534378 2067 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
RAB6BQ9NRW1 ADCYAP1R1-203ENST00000409363 1889 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
RAB6BQ9NRW1 BLOC1S5-202ENST00000397457 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
RAB6BQ9NRW1 CCT6P1-202ENST00000442266 1317 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
RAB6BQ9NRW1 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
RAB6BQ9NRW1 GABRB2-202ENST00000353437 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
RAB6BQ9NRW1 MREG-205ENST00000620139 2618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
RAB6BQ9NRW1 C14orf28-201ENST00000325192 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
RAB6BQ9NRW1 ZNF302-201ENST00000423823 2590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
RAB6BQ9NRW1 UBE3D-203ENST00000369747 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
RAB6BQ9NRW1 NCAPH2-203ENST00000395701 2077 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
RAB6BQ9NRW1 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
RAB6BQ9NRW1 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
RAB6BQ9NRW1 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
RAB6BQ9NRW1 GPX4-201ENST00000354171 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
RAB6BQ9NRW1 CHCHD2P8-201ENST00000429873 447 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
RAB6BQ9NRW1 AC246785.2-201ENST00000432512 513 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
RAB6BQ9NRW1 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
RAB6BQ9NRW1 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
RAB6BQ9NRW1 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
RAB6BQ9NRW1 PCAT7-201ENST00000452148 1164 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
RAB6BQ9NRW1 LINC00882-201ENST00000473636 710 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
RAB6BQ9NRW1 AC136604.3-201ENST00000508188 429 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
RAB6BQ9NRW1 MYL6-203ENST00000536128 1221 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
RAB6BQ9NRW1 TSFM-208ENST00000543727 651 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
RAB6BQ9NRW1 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
RAB6BQ9NRW1 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
RAB6BQ9NRW1 AL121672.3-201ENST00000608644 468 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
RAB6BQ9NRW1 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
RAB6BQ9NRW1 LINC00094-205ENST00000603928 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
RAB6BQ9NRW1 ZFP3-201ENST00000318833 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
RAB6BQ9NRW1 PGAP3-203ENST00000378011 2533 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
RAB6BQ9NRW1 INPP5J-207ENST00000405300 2515 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
RAB6BQ9NRW1 POLR3E-203ENST00000418581 2529 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
RAB6BQ9NRW1 WNK1-206ENST00000535572 9886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
RAB6BQ9NRW1 EXT2-202ENST00000358681 2997 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
RAB6BQ9NRW1 LYPLAL1-202ENST00000366928 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
RAB6BQ9NRW1 LBX2-AS1-201ENST00000548978 1852 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.43
RAB6BQ9NRW1 ZNF414-202ENST00000393927 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
RAB6BQ9NRW1 LRRC56-201ENST00000270115 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
RAB6BQ9NRW1 SPG7-201ENST00000268704 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
RAB6BQ9NRW1 CACNA1I-201ENST00000401624 6740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
RAB6BQ9NRW1 GLYCTK-201ENST00000305690 1371 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
RAB6BQ9NRW1 MYC-202ENST00000377970 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
RAB6BQ9NRW1 GJB3-201ENST00000373362 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
RAB6BQ9NRW1 NDUFV1-223ENST00000532303 1493 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
RAB6BQ9NRW1 ST8SIA5-202ENST00000536490 1499 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
RAB6BQ9NRW1 ZNF133-205ENST00000401790 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
RAB6BQ9NRW1 ZNF133-206ENST00000402618 2622 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
RAB6BQ9NRW1 PRRT4-205ENST00000489835 2313 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
RAB6BQ9NRW1 SLC44A3-207ENST00000529450 2045 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
RAB6BQ9NRW1 AC005915.1-201ENST00000624912 2018 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
RAB6BQ9NRW1 TRAF3IP1-202ENST00000391993 4003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
RAB6BQ9NRW1 AD000671.3-202ENST00000591091 1712 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
RAB6BQ9NRW1 TRABD2A-202ENST00000409133 1554 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
RAB6BQ9NRW1 SYT6-205ENST00000609117 4424 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
RAB6BQ9NRW1 CDK10-208ENST00000505473 1424 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
RAB6BQ9NRW1 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
RAB6BQ9NRW1 HGS-201ENST00000329138 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
RAB6BQ9NRW1 MADCAM1-203ENST00000382683 603 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
RAB6BQ9NRW1 GOSR2-202ENST00000393456 788 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
RAB6BQ9NRW1 SSR4P1-202ENST00000429427 967 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
RAB6BQ9NRW1 VENTXP7-201ENST00000475503 772 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
RAB6BQ9NRW1 AL049597.2-201ENST00000565575 961 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
RAB6BQ9NRW1 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
RAB6BQ9NRW1 AC007220.1-201ENST00000572466 1055 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
RAB6BQ9NRW1 STK25P1-201ENST00000585406 838 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
RAB6BQ9NRW1 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
RAB6BQ9NRW1 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
RAB6BQ9NRW1 FAM153A-203ENST00000440605 1966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
RAB6BQ9NRW1 AP1S2-201ENST00000329235 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
RAB6BQ9NRW1 SPAG6-202ENST00000376603 2770 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
RAB6BQ9NRW1 SMUG1-209ENST00000505128 2607 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
RAB6BQ9NRW1 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
RAB6BQ9NRW1 MAGI1-213ENST00000483466 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
RAB6BQ9NRW1 FBXO18-203ENST00000397269 3640 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
RAB6BQ9NRW1 WDR90-202ENST00000315764 1454 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
RAB6BQ9NRW1 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
RAB6BQ9NRW1 CRTC3-201ENST00000268184 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
RAB6BQ9NRW1 AGGF1P2-201ENST00000426656 2106 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
RAB6BQ9NRW1 AKIRIN1-201ENST00000372984 1330 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
RAB6BQ9NRW1 CROCCP1-201ENST00000426910 5675 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
RAB6BQ9NRW1 MTG1-201ENST00000317502 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
RAB6BQ9NRW1 ZFP64-205ENST00000371518 1841 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
RAB6BQ9NRW1 RBPJL-201ENST00000343694 2489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
RAB6BQ9NRW1 TLCD2-201ENST00000330676 5971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
RAB6BQ9NRW1 FAM178B-204ENST00000490605 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
RAB6BQ9NRW1 CDK19-202ENST00000368911 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
RAB6BQ9NRW1 ZBTB7C-221ENST00000590800 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
RAB6BQ9NRW1 ZSCAN25-201ENST00000262941 1652 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
RAB6BQ9NRW1 CHRM2-201ENST00000320658 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
RAB6BQ9NRW1 NKAIN1-201ENST00000373736 2589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
RAB6BQ9NRW1 PGLS-201ENST00000252603 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.1 ms