Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPD8

UBE2T, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 T, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 197 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2TQ9NPD8 SIPA1-209ENST00000534313 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
UBE2TQ9NPD8 CSTB-204ENST00000640406 2354 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
UBE2TQ9NPD8 DIP2A-204ENST00000457905 3044 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
UBE2TQ9NPD8 PBK-201ENST00000301905 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
UBE2TQ9NPD8 PTHLH-205ENST00000535992 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
UBE2TQ9NPD8 ZNF584-209ENST00000599238 2288 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
UBE2TQ9NPD8 AD000864.1-201ENST00000624076 2295 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
UBE2TQ9NPD8 FAM237A-203ENST00000543490 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
UBE2TQ9NPD8 CMIP-201ENST00000398040 2825 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
UBE2TQ9NPD8 HTR1A-201ENST00000323865 1778 ntAPPRIS P1 BASIC18.71■□□□□ 0.59
UBE2TQ9NPD8 ETV4-205ENST00000545954 1775 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
UBE2TQ9NPD8 NRXN1-209ENST00000405581 5078 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
UBE2TQ9NPD8 C2orf81-202ENST00000612891 1902 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
UBE2TQ9NPD8 CEACAM21-203ENST00000407170 1691 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
UBE2TQ9NPD8 AL135999.2-201ENST00000622438 1686 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
UBE2TQ9NPD8 QRFP-201ENST00000343079 411 ntAPPRIS P1 BASIC18.71■□□□□ 0.59
UBE2TQ9NPD8 CDKN1C-201ENST00000380725 1220 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
UBE2TQ9NPD8 GNB1L-203ENST00000405009 1076 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
UBE2TQ9NPD8 AK2-204ENST00000467905 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
UBE2TQ9NPD8 SRSF1-209ENST00000585096 568 ntTSL 4 BASIC18.71■□□□□ 0.59
UBE2TQ9NPD8 FLT3LG-206ENST00000597551 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
UBE2TQ9NPD8 AC138894.3-201ENST00000603787 634 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
UBE2TQ9NPD8 TXNDC12-205ENST00000610127 806 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
UBE2TQ9NPD8 EML3-201ENST00000278845 3017 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
UBE2TQ9NPD8 C5orf30-201ENST00000319933 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
UBE2TQ9NPD8 ZNF302-202ENST00000446502 2635 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
UBE2TQ9NPD8 CDH23-205ENST00000398809 4533 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
UBE2TQ9NPD8 HMOX2-217ENST00000619528 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
UBE2TQ9NPD8 IL2RG-202ENST00000374188 1432 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
UBE2TQ9NPD8 LINC00671-201ENST00000301683 1958 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
UBE2TQ9NPD8 CFC1-202ENST00000615342 1554 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
UBE2TQ9NPD8 CFC1B-202ENST00000619050 1554 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
UBE2TQ9NPD8 RNF128-201ENST00000255499 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
UBE2TQ9NPD8 NAT9-201ENST00000357814 1875 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
UBE2TQ9NPD8 SMARCC2-202ENST00000347471 3839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
UBE2TQ9NPD8 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
UBE2TQ9NPD8 KMT5C-212ENST00000630497 2037 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
UBE2TQ9NPD8 PRICKLE4-204ENST00000458694 1646 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.58
UBE2TQ9NPD8 NFATC4-215ENST00000554661 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
UBE2TQ9NPD8 PROC-201ENST00000234071 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
UBE2TQ9NPD8 ARNTL-201ENST00000389707 2776 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
UBE2TQ9NPD8 PPT2-246ENST00000375137 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
UBE2TQ9NPD8 CDC25A-202ENST00000351231 3663 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
UBE2TQ9NPD8 IRF5-210ENST00000477535 1374 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
UBE2TQ9NPD8 SGCE-206ENST00000445866 1666 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
UBE2TQ9NPD8 TAPBP-238ENST00000475304 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
UBE2TQ9NPD8 GABRB2-202ENST00000353437 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
UBE2TQ9NPD8 EIF3L-202ENST00000406934 2282 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
UBE2TQ9NPD8 TIMM50-202ENST00000544017 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
UBE2TQ9NPD8 ITGA8-201ENST00000378076 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
UBE2TQ9NPD8 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC18.7■□□□□ 0.58
UBE2TQ9NPD8 BRPF1-201ENST00000383829 4736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
UBE2TQ9NPD8 TMEM213-202ENST00000413208 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
UBE2TQ9NPD8 RAI2-203ENST00000415486 2037 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
UBE2TQ9NPD8 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
UBE2TQ9NPD8 FICD-205ENST00000552758 603 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
UBE2TQ9NPD8 PAPD5-203ENST00000561678 2916 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
UBE2TQ9NPD8 ZFPM1-205ENST00000569086 563 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
UBE2TQ9NPD8 AL513523.2-201ENST00000633218 660 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
UBE2TQ9NPD8 PCGF3-201ENST00000362003 5685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
UBE2TQ9NPD8 MYO1B-204ENST00000392318 5082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
UBE2TQ9NPD8 TRIL-201ENST00000539664 4935 ntAPPRIS P1 BASIC18.7■□□□□ 0.58
UBE2TQ9NPD8 LINC00595-204ENST00000434974 2692 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
UBE2TQ9NPD8 TTC29-205ENST00000504425 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
UBE2TQ9NPD8 WTAP-205ENST00000614346 1623 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
UBE2TQ9NPD8 IDH3G-201ENST00000217901 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
UBE2TQ9NPD8 SAMD11-202ENST00000342066 2551 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
UBE2TQ9NPD8 SAMD11-217ENST00000622503 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
UBE2TQ9NPD8 TRAF2-201ENST00000247668 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
UBE2TQ9NPD8 UQCC3-202ENST00000531323 2288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
UBE2TQ9NPD8 PCCB-201ENST00000251654 1833 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
UBE2TQ9NPD8 ACBD3-201ENST00000366812 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
UBE2TQ9NPD8 IPMK-201ENST00000373935 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
UBE2TQ9NPD8 LCAT-201ENST00000264005 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
UBE2TQ9NPD8 PIR-202ENST00000380421 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
UBE2TQ9NPD8 F12-201ENST00000253496 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
UBE2TQ9NPD8 SLC44A3-207ENST00000529450 2045 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
UBE2TQ9NPD8 RABGGTA-201ENST00000216840 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
UBE2TQ9NPD8 IRF3-202ENST00000377135 1442 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
UBE2TQ9NPD8 OR10H5-201ENST00000308940 1132 ntAPPRIS P1 BASIC18.69■□□□□ 0.58
UBE2TQ9NPD8 NAT6-202ENST00000417393 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
UBE2TQ9NPD8 BPHL-208ENST00000434640 1186 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
UBE2TQ9NPD8 PHGR1-201ENST00000448599 436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
UBE2TQ9NPD8 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
UBE2TQ9NPD8 AL591684.3-201ENST00000605187 298 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
UBE2TQ9NPD8 AP000867.4-201ENST00000641616 219 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
UBE2TQ9NPD8 FOSB-209ENST00000590335 2170 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
UBE2TQ9NPD8 GATA2-202ENST00000430265 2525 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
UBE2TQ9NPD8 AC009053.2-201ENST00000563701 2365 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
UBE2TQ9NPD8 AC060834.1-201ENST00000443027 2032 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
UBE2TQ9NPD8 PDE4A-201ENST00000293683 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
UBE2TQ9NPD8 ITGB7-202ENST00000422257 2791 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
UBE2TQ9NPD8 MAP3K8-207ENST00000542547 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
UBE2TQ9NPD8 NUDT9-201ENST00000302174 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
UBE2TQ9NPD8 LINC02012-201ENST00000608206 1725 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
UBE2TQ9NPD8 RNF187-201ENST00000305943 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
UBE2TQ9NPD8 ZDHHC9-202ENST00000371064 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
UBE2TQ9NPD8 APBB1-224ENST00000621678 1907 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
UBE2TQ9NPD8 ADGRB2-201ENST00000373655 5400 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
UBE2TQ9NPD8 PTPRF-209ENST00000438120 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.5 ms