Protein–RNA interactions for Protein: Q9HC16

APOBEC3G, DNA dC->dU-editing enzyme APOBEC-3G, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 384 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOBEC3GQ9HC16 PLEKHG5-212ENST00000537245 4794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
APOBEC3GQ9HC16 PCMTD1-206ENST00000521344 1712 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
APOBEC3GQ9HC16 FAM46A-203ENST00000369756 5537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
APOBEC3GQ9HC16 TRAF3IP1-201ENST00000373327 4279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
APOBEC3GQ9HC16 NCF1C-201ENST00000438382 1427 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
APOBEC3GQ9HC16 IFFO1-211ENST00000615885 2775 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
APOBEC3GQ9HC16 DCTN3-201ENST00000259632 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
APOBEC3GQ9HC16 SUMF2-203ENST00000395435 1287 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
APOBEC3GQ9HC16 MPG-203ENST00000397817 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
APOBEC3GQ9HC16 SLC9A3R1-202ENST00000413388 1285 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
APOBEC3GQ9HC16 KRT18P67-201ENST00000432816 1264 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
APOBEC3GQ9HC16 AC069287.3-201ENST00000527297 589 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
APOBEC3GQ9HC16 FGFR1OP2-206ENST00000546072 956 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
APOBEC3GQ9HC16 TMEM106C-214ENST00000550161 976 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
APOBEC3GQ9HC16 AHSA1-208ENST00000555517 832 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
APOBEC3GQ9HC16 ZFPM1-204ENST00000563351 808 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
APOBEC3GQ9HC16 AC133919.2-201ENST00000565965 589 ntTSL 4 BASIC18.52■□□□□ 0.56
APOBEC3GQ9HC16 TMEM220-203ENST00000578345 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
APOBEC3GQ9HC16 AC036176.1-201ENST00000589905 785 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
APOBEC3GQ9HC16 AC004706.3-202ENST00000621574 984 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
APOBEC3GQ9HC16 AC107918.4-202ENST00000641623 219 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
APOBEC3GQ9HC16 LINC01148-201ENST00000557527 1763 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
APOBEC3GQ9HC16 USP3-AS1-201ENST00000558831 1784 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
APOBEC3GQ9HC16 ZNF211-201ENST00000240731 2440 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
APOBEC3GQ9HC16 F12-201ENST00000253496 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
APOBEC3GQ9HC16 DAGLB-202ENST00000425398 2044 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
APOBEC3GQ9HC16 HLA-A-204ENST00000396634 1868 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.55
APOBEC3GQ9HC16 DIABLO-204ENST00000413918 1859 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
APOBEC3GQ9HC16 ESYT2-206ENST00000613624 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
APOBEC3GQ9HC16 HDAC10-205ENST00000448072 2133 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
APOBEC3GQ9HC16 AL590787.1-201ENST00000568856 1315 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
APOBEC3GQ9HC16 ARHGAP23-222ENST00000622683 5964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
APOBEC3GQ9HC16 GALNT9-201ENST00000328957 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
APOBEC3GQ9HC16 TRA2A-212ENST00000621813 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
APOBEC3GQ9HC16 ARFIP2-203ENST00000423813 1430 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
APOBEC3GQ9HC16 STX3-201ENST00000337979 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
APOBEC3GQ9HC16 RNF222-201ENST00000344001 2786 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
APOBEC3GQ9HC16 MAPT-209ENST00000446361 5345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
APOBEC3GQ9HC16 SMUG1-209ENST00000505128 2607 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
APOBEC3GQ9HC16 ARHGAP27-214ENST00000532891 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
APOBEC3GQ9HC16 CCDC74A-202ENST00000409856 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
APOBEC3GQ9HC16 TPM4P1-201ENST00000436100 807 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
APOBEC3GQ9HC16 AC073648.2-201ENST00000510116 352 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
APOBEC3GQ9HC16 MSRA-206ENST00000521209 814 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
APOBEC3GQ9HC16 TUBB3-205ENST00000554336 903 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
APOBEC3GQ9HC16 AC002985.2-201ENST00000601106 957 ntTSL 4 BASIC18.51■□□□□ 0.55
APOBEC3GQ9HC16 AL139424.1-201ENST00000607572 797 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
APOBEC3GQ9HC16 ARFRP1-212ENST00000618838 1623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
APOBEC3GQ9HC16 GLCCI1-201ENST00000223145 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
APOBEC3GQ9HC16 TTC8-202ENST00000345383 2329 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
APOBEC3GQ9HC16 TFAP2D-201ENST00000008391 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
APOBEC3GQ9HC16 GPAT3-202ENST00000395226 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
APOBEC3GQ9HC16 ITGB2-AS1-202ENST00000441379 2282 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
APOBEC3GQ9HC16 DIABLO-206ENST00000443649 2250 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
APOBEC3GQ9HC16 ORAOV1-206ENST00000536870 2274 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
APOBEC3GQ9HC16 TNXB-204ENST00000479795 2742 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
APOBEC3GQ9HC16 CCT7-215ENST00000539919 2031 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
APOBEC3GQ9HC16 B4GALT4-216ENST00000483209 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
APOBEC3GQ9HC16 SH2D3C-213ENST00000629203 2478 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
APOBEC3GQ9HC16 TLE4-205ENST00000376544 4871 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
APOBEC3GQ9HC16 ACTRT2-201ENST00000378404 1421 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
APOBEC3GQ9HC16 SPDEF-201ENST00000374037 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
APOBEC3GQ9HC16 CADPS2-208ENST00000615869 6066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
APOBEC3GQ9HC16 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
APOBEC3GQ9HC16 SKP2-201ENST00000274254 1537 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
APOBEC3GQ9HC16 WAC-205ENST00000375664 5924 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
APOBEC3GQ9HC16 SCNN1D-206ENST00000400928 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
APOBEC3GQ9HC16 KRTAP1-1-201ENST00000306271 903 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
APOBEC3GQ9HC16 FGF8-203ENST00000346714 694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
APOBEC3GQ9HC16 AL512785.2-202ENST00000367932 830 ntTSL 4 BASIC18.5■□□□□ 0.55
APOBEC3GQ9HC16 DUSP12-201ENST00000367943 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
APOBEC3GQ9HC16 OLFM1-207ENST00000371801 568 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
APOBEC3GQ9HC16 MED22-202ENST00000371999 987 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
APOBEC3GQ9HC16 RNA5SP419-201ENST00000515908 135 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
APOBEC3GQ9HC16 AC012640.2-201ENST00000561606 901 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
APOBEC3GQ9HC16 AC139887.3-201ENST00000568585 713 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
APOBEC3GQ9HC16 AL049840.3-201ENST00000602669 611 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
APOBEC3GQ9HC16 AC011247.3-202ENST00000605062 570 ntTSL 4 BASIC18.5■□□□□ 0.55
APOBEC3GQ9HC16 PLCH2-205ENST00000449969 5450 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
APOBEC3GQ9HC16 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
APOBEC3GQ9HC16 PTGDR-201ENST00000306051 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
APOBEC3GQ9HC16 DNM1-216ENST00000634267 2909 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
APOBEC3GQ9HC16 ARL13B-203ENST00000394222 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
APOBEC3GQ9HC16 EEPD1-201ENST00000242108 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
APOBEC3GQ9HC16 AC060834.1-201ENST00000443027 2032 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
APOBEC3GQ9HC16 RNF121-203ENST00000393713 2132 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
APOBEC3GQ9HC16 AC006504.4-201ENST00000592118 1568 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
APOBEC3GQ9HC16 KLHL33-201ENST00000344581 1863 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
APOBEC3GQ9HC16 ADIRF-AS1-201ENST00000418273 2627 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
APOBEC3GQ9HC16 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
APOBEC3GQ9HC16 CCNI2-201ENST00000378731 2355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
APOBEC3GQ9HC16 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
APOBEC3GQ9HC16 WWTR1-201ENST00000360632 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
APOBEC3GQ9HC16 ZSCAN10-207ENST00000575108 2247 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
APOBEC3GQ9HC16 FNBP1-203ENST00000443566 5227 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
APOBEC3GQ9HC16 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
APOBEC3GQ9HC16 PARD3-201ENST00000340077 3518 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
APOBEC3GQ9HC16 COLEC11-202ENST00000349077 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
APOBEC3GQ9HC16 NFKBIB-202ENST00000392079 991 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
APOBEC3GQ9HC16 ELK2BP-201ENST00000415014 1224 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 103 ms