Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZX4

ROPN1B, Ropporin-1B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 212 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ROPN1BQ9BZX4 ADA-207ENST00000537820 1128 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
ROPN1BQ9BZX4 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
ROPN1BQ9BZX4 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
ROPN1BQ9BZX4 CD276-213ENST00000561213 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
ROPN1BQ9BZX4 TAF3-201ENST00000344293 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
ROPN1BQ9BZX4 LITAF-202ENST00000381810 1527 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
ROPN1BQ9BZX4 MED17-201ENST00000251871 5142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
ROPN1BQ9BZX4 REPS1-201ENST00000258062 3161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
ROPN1BQ9BZX4 HOXD3-201ENST00000249440 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
ROPN1BQ9BZX4 DCST1-201ENST00000295542 2279 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
ROPN1BQ9BZX4 IGF2-204ENST00000381406 5179 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
ROPN1BQ9BZX4 ARHGAP35-201ENST00000404338 8889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
ROPN1BQ9BZX4 NUCB1-202ENST00000407032 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
ROPN1BQ9BZX4 TLE2-202ENST00000426948 2406 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
ROPN1BQ9BZX4 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
ROPN1BQ9BZX4 SUV39H1-202ENST00000376687 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
ROPN1BQ9BZX4 GBA2-203ENST00000378103 3611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
ROPN1BQ9BZX4 FGFBP1-201ENST00000382333 1359 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
ROPN1BQ9BZX4 PTEN-201ENST00000371953 9027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
ROPN1BQ9BZX4 RASIP1-201ENST00000222145 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
ROPN1BQ9BZX4 STX3-203ENST00000529177 1571 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
ROPN1BQ9BZX4 ADAMTS13-206ENST00000371929 4934 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
ROPN1BQ9BZX4 ATG5-210ENST00000636437 2261 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
ROPN1BQ9BZX4 BMI1-201ENST00000376663 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
ROPN1BQ9BZX4 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
ROPN1BQ9BZX4 CLCNKA-203ENST00000439316 1997 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
ROPN1BQ9BZX4 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
ROPN1BQ9BZX4 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
ROPN1BQ9BZX4 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
ROPN1BQ9BZX4 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
ROPN1BQ9BZX4 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
ROPN1BQ9BZX4 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
ROPN1BQ9BZX4 AC012645.3-201ENST00000568506 470 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
ROPN1BQ9BZX4 ECSIT-207ENST00000588998 818 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
ROPN1BQ9BZX4 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
ROPN1BQ9BZX4 KDM6B-202ENST00000448097 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
ROPN1BQ9BZX4 YAP1-208ENST00000531439 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
ROPN1BQ9BZX4 NFIX-209ENST00000587760 1487 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
ROPN1BQ9BZX4 WNK2-201ENST00000297954 7138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
ROPN1BQ9BZX4 ARHGAP11A-201ENST00000361627 5898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
ROPN1BQ9BZX4 GAS7-203ENST00000432992 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
ROPN1BQ9BZX4 ASH1L-207ENST00000548830 1862 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
ROPN1BQ9BZX4 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
ROPN1BQ9BZX4 CLEC10A-204ENST00000571664 1442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
ROPN1BQ9BZX4 EPHX2-201ENST00000380476 2064 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
ROPN1BQ9BZX4 ELN-206ENST00000380553 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
ROPN1BQ9BZX4 ABHD15-201ENST00000307201 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
ROPN1BQ9BZX4 MAPK14-201ENST00000229794 3779 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
ROPN1BQ9BZX4 LINC01979-201ENST00000576738 5271 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
ROPN1BQ9BZX4 GPS1-226ENST00000623691 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
ROPN1BQ9BZX4 PIGT-221ENST00000638594 1835 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
ROPN1BQ9BZX4 HDAC11-214ENST00000446613 2875 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
ROPN1BQ9BZX4 COL4A2-201ENST00000360467 6281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
ROPN1BQ9BZX4 HIP1R-201ENST00000253083 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
ROPN1BQ9BZX4 EGFEM1P-202ENST00000431685 1563 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
ROPN1BQ9BZX4 LEXM-201ENST00000358193 1777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
ROPN1BQ9BZX4 CLMAT3-201ENST00000510576 1973 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
ROPN1BQ9BZX4 ASTN2-205ENST00000361209 4622 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
ROPN1BQ9BZX4 SERINC2-202ENST00000373710 2146 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
ROPN1BQ9BZX4 ILVBL-201ENST00000263383 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
ROPN1BQ9BZX4 ADM-201ENST00000278175 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
ROPN1BQ9BZX4 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
ROPN1BQ9BZX4 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
ROPN1BQ9BZX4 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
ROPN1BQ9BZX4 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
ROPN1BQ9BZX4 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
ROPN1BQ9BZX4 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
ROPN1BQ9BZX4 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
ROPN1BQ9BZX4 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
ROPN1BQ9BZX4 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
ROPN1BQ9BZX4 ANKRD20A8P-203ENST00000641373 517 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
ROPN1BQ9BZX4 RAB11FIP5-205ENST00000486777 6120 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
ROPN1BQ9BZX4 SLC7A5-201ENST00000261622 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
ROPN1BQ9BZX4 HOXC5-201ENST00000312492 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
ROPN1BQ9BZX4 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
ROPN1BQ9BZX4 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
ROPN1BQ9BZX4 TRIM11-201ENST00000284551 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
ROPN1BQ9BZX4 CDC42EP4-201ENST00000335793 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
ROPN1BQ9BZX4 RASAL3-201ENST00000343625 3293 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
ROPN1BQ9BZX4 DZIP1L-204ENST00000469243 2107 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
ROPN1BQ9BZX4 TRNT1-205ENST00000402675 1935 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
ROPN1BQ9BZX4 IKBKE-204ENST00000584998 2487 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
ROPN1BQ9BZX4 PRAG1-202ENST00000622241 4639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
ROPN1BQ9BZX4 ABCF3-203ENST00000429586 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
ROPN1BQ9BZX4 KCNG3-201ENST00000306078 3824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
ROPN1BQ9BZX4 SLC44A1-203ENST00000374724 3088 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
ROPN1BQ9BZX4 TK2-207ENST00000544898 3441 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
ROPN1BQ9BZX4 ADARB1-204ENST00000389863 3563 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
ROPN1BQ9BZX4 ANKRD23-203ENST00000418232 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
ROPN1BQ9BZX4 TLCD2-201ENST00000330676 5971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
ROPN1BQ9BZX4 ZC3H12A-201ENST00000373087 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
ROPN1BQ9BZX4 FAM153A-203ENST00000440605 1966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
ROPN1BQ9BZX4 CR392000.2-201ENST00000640235 1994 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
ROPN1BQ9BZX4 LAPTM4B-201ENST00000445593 3173 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
ROPN1BQ9BZX4 AL662844.4-201ENST00000606367 2838 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
ROPN1BQ9BZX4 PCDHA13-202ENST00000409494 4884 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
ROPN1BQ9BZX4 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
ROPN1BQ9BZX4 MTCL1P1-201ENST00000446207 792 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
ROPN1BQ9BZX4 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
ROPN1BQ9BZX4 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.3 ms