Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYR4

KRTAP4-3, Keratin-associated protein 4-3, humanhuman

Predictions only

Length 195 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP4-3Q9BYR4 GPR89P-201ENST00000407924 1495 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
KRTAP4-3Q9BYR4 TCIRG1-201ENST00000265686 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
KRTAP4-3Q9BYR4 PRKCB-202ENST00000321728 2689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
KRTAP4-3Q9BYR4 IFFO1-201ENST00000336604 2686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
KRTAP4-3Q9BYR4 RASL11A-201ENST00000241463 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
KRTAP4-3Q9BYR4 KIF25-202ENST00000354419 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
KRTAP4-3Q9BYR4 FAM174B-201ENST00000327355 2792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
KRTAP4-3Q9BYR4 RGS3-211ENST00000462403 2155 ntTSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
KRTAP4-3Q9BYR4 ARHGAP23-222ENST00000622683 5964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
KRTAP4-3Q9BYR4 THNSL2-203ENST00000377254 1560 ntTSL 2 BASIC5.89□□□□□ -1.47
KRTAP4-3Q9BYR4 NOX4-207ENST00000525196 1555 ntTSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
KRTAP4-3Q9BYR4 LRRC38-201ENST00000376085 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
KRTAP4-3Q9BYR4 MARK2-207ENST00000502399 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
KRTAP4-3Q9BYR4 RIMBP3C-201ENST00000331505 5475 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.88□□□□□ -1.47
KRTAP4-3Q9BYR4 HYAL3-202ENST00000359051 1635 ntTSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
KRTAP4-3Q9BYR4 PLEKHG6-203ENST00000396988 2963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.88□□□□□ -1.47
KRTAP4-3Q9BYR4 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
KRTAP4-3Q9BYR4 TACSTD2-201ENST00000371225 2351 ntAPPRIS P1 BASIC5.88□□□□□ -1.47
KRTAP4-3Q9BYR4 NPRL2-201ENST00000232501 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
KRTAP4-3Q9BYR4 PCMTD1-206ENST00000521344 1712 ntTSL 3 BASIC5.88□□□□□ -1.47
KRTAP4-3Q9BYR4 ANKRD23-202ENST00000331001 2455 ntTSL 2 BASIC5.88□□□□□ -1.47
KRTAP4-3Q9BYR4 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
KRTAP4-3Q9BYR4 TP53BP2-201ENST00000343537 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
KRTAP4-3Q9BYR4 NGLY1-207ENST00000428257 2534 ntTSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
KRTAP4-3Q9BYR4 METTL9-201ENST00000358154 3256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
KRTAP4-3Q9BYR4 LYPLAL1-201ENST00000366927 1819 ntTSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
KRTAP4-3Q9BYR4 C1orf159-205ENST00000421241 1841 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC5.88□□□□□ -1.47
KRTAP4-3Q9BYR4 SUSD4-208ENST00000494793 1833 ntTSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
KRTAP4-3Q9BYR4 AC046185.3-201ENST00000623228 1824 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
KRTAP4-3Q9BYR4 PRKAR1B-204ENST00000406797 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
KRTAP4-3Q9BYR4 RTKN-203ENST00000305557 2646 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
KRTAP4-3Q9BYR4 LUC7L2-202ENST00000354926 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
KRTAP4-3Q9BYR4 NAA35-201ENST00000361671 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
KRTAP4-3Q9BYR4 NRXN1-220ENST00000611589 1857 ntTSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
KRTAP4-3Q9BYR4 ATPAF1-214ENST00000576409 4158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
KRTAP4-3Q9BYR4 FIBIN-201ENST00000318627 1938 ntAPPRIS P1 BASIC5.88□□□□□ -1.47
KRTAP4-3Q9BYR4 NPEPL1-204ENST00000525967 1917 ntTSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
KRTAP4-3Q9BYR4 CGB7-202ENST00000596965 1949 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.88□□□□□ -1.47
KRTAP4-3Q9BYR4 FGFR4-203ENST00000393648 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.88□□□□□ -1.47
KRTAP4-3Q9BYR4 SCNN1D-206ENST00000400928 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
KRTAP4-3Q9BYR4 GBGT1-203ENST00000372040 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
KRTAP4-3Q9BYR4 CLEC18A-202ENST00000393701 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
KRTAP4-3Q9BYR4 FOXP1-210ENST00000484350 1996 ntTSL 2 BASIC5.88□□□□□ -1.47
KRTAP4-3Q9BYR4 CLEC18C-203ENST00000541793 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
KRTAP4-3Q9BYR4 AL109910.2-201ENST00000607733 1953 ntTSL 2 BASIC5.88□□□□□ -1.47
KRTAP4-3Q9BYR4 NEU1-206ENST00000375631 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
KRTAP4-3Q9BYR4 GOLGA2P9-203ENST00000600260 2033 ntTSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
KRTAP4-3Q9BYR4 ROMO1-201ENST00000336695 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
KRTAP4-3Q9BYR4 ICOSLG-201ENST00000344330 1009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
KRTAP4-3Q9BYR4 AL512785.2-202ENST00000367932 830 ntTSL 4 BASIC5.88□□□□□ -1.47
KRTAP4-3Q9BYR4 MRPS16-201ENST00000372940 866 ntTSL 2 BASIC5.88□□□□□ -1.47
KRTAP4-3Q9BYR4 ITM2B-201ENST00000378549 805 ntTSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
KRTAP4-3Q9BYR4 ZNF789-202ENST00000379724 510 ntTSL 2 BASIC5.88□□□□□ -1.47
KRTAP4-3Q9BYR4 CD99-204ENST00000381187 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.88□□□□□ -1.47
KRTAP4-3Q9BYR4 SH3TC1-202ENST00000382521 829 ntTSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
KRTAP4-3Q9BYR4 COPS7B-207ENST00000410024 1103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.88□□□□□ -1.47
KRTAP4-3Q9BYR4 UPF3AP3-201ENST00000420996 769 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
KRTAP4-3Q9BYR4 DDX43P3-201ENST00000441064 443 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
KRTAP4-3Q9BYR4 VN2R19P-201ENST00000442399 1052 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
KRTAP4-3Q9BYR4 HCG4B-203ENST00000450128 991 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
KRTAP4-3Q9BYR4 ARTN-206ENST00000472435 402 ntTSL 3 BASIC5.88□□□□□ -1.47
KRTAP4-3Q9BYR4 RNA5SP416-201ENST00000516838 111 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
KRTAP4-3Q9BYR4 IGHV3-52-201ENST00000519770 353 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
KRTAP4-3Q9BYR4 IGHV3-65-201ENST00000523210 341 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
KRTAP4-3Q9BYR4 AC135050.2-203ENST00000529564 725 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC5.88□□□□□ -1.47
KRTAP4-3Q9BYR4 IL18BP-211ENST00000531053 853 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.88□□□□□ -1.47
KRTAP4-3Q9BYR4 AP005019.1-201ENST00000545254 664 ntTSL 3 BASIC5.88□□□□□ -1.47
KRTAP4-3Q9BYR4 AL121820.2-201ENST00000556301 279 ntTSL 2 BASIC5.88□□□□□ -1.47
KRTAP4-3Q9BYR4 ETFA-208ENST00000559602 792 ntTSL 3 BASIC5.88□□□□□ -1.47
KRTAP4-3Q9BYR4 AP005233.2-201ENST00000561588 372 ntTSL 3 BASIC5.88□□□□□ -1.47
KRTAP4-3Q9BYR4 NUTF2-206ENST00000569436 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.88□□□□□ -1.47
KRTAP4-3Q9BYR4 MIR22HG-204ENST00000571595 767 ntTSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
KRTAP4-3Q9BYR4 BORCS8-206ENST00000585679 801 ntTSL 3 BASIC5.88□□□□□ -1.47
KRTAP4-3Q9BYR4 AC040963.1-202ENST00000589729 644 ntTSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
KRTAP4-3Q9BYR4 AC006557.2-201ENST00000592985 1240 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
KRTAP4-3Q9BYR4 AL353135.1-201ENST00000606729 504 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
KRTAP4-3Q9BYR4 TVP23A-210ENST00000612195 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
KRTAP4-3Q9BYR4 LINC00623-201ENST00000613486 486 ntTSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
KRTAP4-3Q9BYR4 CBY1-211ENST00000619293 1118 ntTSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
KRTAP4-3Q9BYR4 CAND2-206ENST00000626378 333 ntTSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
KRTAP4-3Q9BYR4 MCCC2-209ENST00000629193 1128 ntTSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
KRTAP4-3Q9BYR4 AL590787.1-201ENST00000568856 1315 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
KRTAP4-3Q9BYR4 FOXD4L4-201ENST00000377413 2230 ntAPPRIS P1 BASIC5.88□□□□□ -1.47
KRTAP4-3Q9BYR4 POLR1D-221ENST00000637180 2262 ntTSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
KRTAP4-3Q9BYR4 STRN4-201ENST00000263280 3210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
KRTAP4-3Q9BYR4 FGFR1-203ENST00000341462 6054 ntTSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
KRTAP4-3Q9BYR4 NCF1C-201ENST00000438382 1427 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
KRTAP4-3Q9BYR4 CBX3P2-201ENST00000579647 1429 ntTSL 2 BASIC5.88□□□□□ -1.47
KRTAP4-3Q9BYR4 CRB3-203ENST00000598494 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.88□□□□□ -1.47
KRTAP4-3Q9BYR4 LRRC25-201ENST00000339007 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
KRTAP4-3Q9BYR4 C1orf115-201ENST00000294889 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
KRTAP4-3Q9BYR4 TMED9-201ENST00000332598 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
KRTAP4-3Q9BYR4 PIR-202ENST00000380421 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
KRTAP4-3Q9BYR4 UBE2G1-204ENST00000572484 1514 ntTSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
KRTAP4-3Q9BYR4 AJUBA-202ENST00000361265 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
KRTAP4-3Q9BYR4 ASCC2-223ENST00000542393 2594 ntTSL 2 BASIC5.88□□□□□ -1.47
KRTAP4-3Q9BYR4 PRAMEF20-201ENST00000316412 1597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
KRTAP4-3Q9BYR4 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
KRTAP4-3Q9BYR4 RGN-202ENST00000352078 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
KRTAP4-3Q9BYR4 GHRHR-205ENST00000409904 1613 ntTSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.2 ms