Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXY4

RSPO3, R-spondin-3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 272 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RSPO3Q9BXY4 CSRP1-214ENST00000531916 890 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
RSPO3Q9BXY4 AC015712.1-203ENST00000559331 593 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
RSPO3Q9BXY4 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
RSPO3Q9BXY4 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
RSPO3Q9BXY4 KISS1R-203ENST00000606939 964 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
RSPO3Q9BXY4 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
RSPO3Q9BXY4 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RSPO3Q9BXY4 HSP90B1-211ENST00000640977 1127 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
RSPO3Q9BXY4 ANKRD23-203ENST00000418232 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RSPO3Q9BXY4 NSD3-201ENST00000316985 3995 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RSPO3Q9BXY4 B4GALNT2-201ENST00000300404 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RSPO3Q9BXY4 MYEOV-203ENST00000535407 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
RSPO3Q9BXY4 SPOP-201ENST00000347630 2965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
RSPO3Q9BXY4 C17orf62-201ENST00000306645 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RSPO3Q9BXY4 PKN3-201ENST00000291906 3375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RSPO3Q9BXY4 TPM1-205ENST00000357980 1800 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
RSPO3Q9BXY4 MIER1-206ENST00000371016 1802 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RSPO3Q9BXY4 DNAAF1-201ENST00000378553 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RSPO3Q9BXY4 PIGT-257ENST00000640210 1715 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
RSPO3Q9BXY4 C12orf29-201ENST00000356891 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RSPO3Q9BXY4 NUP50-202ENST00000396096 1895 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RSPO3Q9BXY4 MFSD11-202ENST00000355954 2832 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
RSPO3Q9BXY4 C2orf81-206ENST00000640868 2407 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
RSPO3Q9BXY4 MPP1-202ENST00000369534 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
RSPO3Q9BXY4 ACTG1-208ENST00000575087 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
RSPO3Q9BXY4 RPN1-201ENST00000296255 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
RSPO3Q9BXY4 PTGDR2-201ENST00000332539 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
RSPO3Q9BXY4 LINC00323-202ENST00000441268 2095 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
RSPO3Q9BXY4 SERINC2-205ENST00000536384 2062 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
RSPO3Q9BXY4 RAPGEFL1-209ENST00000544503 2079 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
RSPO3Q9BXY4 CYP2D6-203ENST00000360608 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
RSPO3Q9BXY4 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
RSPO3Q9BXY4 TERT-202ENST00000334602 3210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
RSPO3Q9BXY4 PRODH-202ENST00000334029 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
RSPO3Q9BXY4 STKLD1-201ENST00000371957 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
RSPO3Q9BXY4 PTPN18-201ENST00000175756 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
RSPO3Q9BXY4 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
RSPO3Q9BXY4 PSCA-201ENST00000301258 1020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
RSPO3Q9BXY4 QRFP-201ENST00000343079 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
RSPO3Q9BXY4 ROMO1-203ENST00000374077 422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
RSPO3Q9BXY4 HLA-DMA-201ENST00000374843 1123 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
RSPO3Q9BXY4 AL645941.2-201ENST00000429234 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
RSPO3Q9BXY4 AL391650.1-205ENST00000433939 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
RSPO3Q9BXY4 DYDC2-206ENST00000444807 1173 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
RSPO3Q9BXY4 AP000344.1-201ENST00000454268 641 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
RSPO3Q9BXY4 AP000344.1-202ENST00000457193 586 ntTSL 4 BASIC15.9■□□□□ 0.14
RSPO3Q9BXY4 RBPMS-AS1-202ENST00000519753 1031 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
RSPO3Q9BXY4 AC139749.1-201ENST00000534584 1094 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
RSPO3Q9BXY4 AC010632.1-201ENST00000590376 572 ntTSL 4 BASIC15.9■□□□□ 0.14
RSPO3Q9BXY4 MOV10L1-203ENST00000395852 1422 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
RSPO3Q9BXY4 TMEM25-225ENST00000533102 1410 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
RSPO3Q9BXY4 ZAP70-201ENST00000264972 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
RSPO3Q9BXY4 SSH1-201ENST00000326470 2432 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
RSPO3Q9BXY4 ZNF503-201ENST00000372524 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
RSPO3Q9BXY4 FAM57B-202ENST00000380495 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
RSPO3Q9BXY4 PIAS3-201ENST00000369298 2761 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
RSPO3Q9BXY4 DMPK-204ENST00000447742 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
RSPO3Q9BXY4 LINC00960-201ENST00000463183 1333 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
RSPO3Q9BXY4 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
RSPO3Q9BXY4 C8orf46-215ENST00000522977 1347 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
RSPO3Q9BXY4 BEND4-203ENST00000611697 1348 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
RSPO3Q9BXY4 CSNK2A1-203ENST00000400217 1451 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
RSPO3Q9BXY4 RBBP7-204ENST00000404022 1904 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
RSPO3Q9BXY4 CALD1-204ENST00000417172 1915 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
RSPO3Q9BXY4 YTHDF3-215ENST00000621957 2387 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
RSPO3Q9BXY4 SIPA1-201ENST00000394224 3628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
RSPO3Q9BXY4 MIB2-217ENST00000504599 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
RSPO3Q9BXY4 NPC1L1-203ENST00000423141 2554 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
RSPO3Q9BXY4 AC226118.1-201ENST00000515213 2146 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
RSPO3Q9BXY4 TTLL5-219ENST00000556977 1961 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
RSPO3Q9BXY4 IER3-202ENST00000376377 1350 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
RSPO3Q9BXY4 AL603756.1-201ENST00000606511 2163 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
RSPO3Q9BXY4 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
RSPO3Q9BXY4 CD276-213ENST00000561213 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
RSPO3Q9BXY4 AC010478.1-202ENST00000559112 2367 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
RSPO3Q9BXY4 IGSF9B-206ENST00000533871 5050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
RSPO3Q9BXY4 PDE12-202ENST00000487257 3040 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
RSPO3Q9BXY4 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
RSPO3Q9BXY4 AC003669.1-201ENST00000334569 611 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
RSPO3Q9BXY4 BOLA1-201ENST00000369150 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
RSPO3Q9BXY4 SBDSP1-202ENST00000423945 618 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
RSPO3Q9BXY4 POLR2M-203ENST00000464277 910 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
RSPO3Q9BXY4 AC113382.1-201ENST00000500267 1253 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
RSPO3Q9BXY4 AP002807.1-202ENST00000526897 791 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
RSPO3Q9BXY4 AC106782.2-201ENST00000563252 992 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
RSPO3Q9BXY4 ATP6V0C-203ENST00000565223 668 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
RSPO3Q9BXY4 ATP6V0C-204ENST00000568562 477 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
RSPO3Q9BXY4 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
RSPO3Q9BXY4 FUT6-212ENST00000592563 1095 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
RSPO3Q9BXY4 HNF1B-206ENST00000620125 1103 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
RSPO3Q9BXY4 SCAMP4-213ENST00000621748 1172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
RSPO3Q9BXY4 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
RSPO3Q9BXY4 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
RSPO3Q9BXY4 DPY19L3-206ENST00000587077 2456 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
RSPO3Q9BXY4 GPR137-212ENST00000539851 1843 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
RSPO3Q9BXY4 INPP5J-213ENST00000620191 2306 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
RSPO3Q9BXY4 SYT3-202ENST00000593901 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
RSPO3Q9BXY4 DBNL-213ENST00000452943 1513 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
RSPO3Q9BXY4 BCL11A-209ENST00000489516 1508 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
RSPO3Q9BXY4 RBFOX1-207ENST00000547338 1513 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.3 ms