Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXW3

SNHG12, Putative uncharacterized protein SNHG12, humanhuman

Predictions only

Length 62 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNHG12Q9BXW3 MAGEA2-207ENST00000620710 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.45□□□□□ -0.42
SNHG12Q9BXW3 ANKRD23-203ENST00000418232 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
SNHG12Q9BXW3 CLCN7-202ENST00000382745 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
SNHG12Q9BXW3 SESN1-202ENST00000356644 2676 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
SNHG12Q9BXW3 PTGFRN-201ENST00000393203 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
SNHG12Q9BXW3 SYCP2L-201ENST00000283141 3130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
SNHG12Q9BXW3 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.44□□□□□ -0.42
SNHG12Q9BXW3 CABP1-204ENST00000453000 1857 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
SNHG12Q9BXW3 RPS6KA4-202ENST00000528057 3121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
SNHG12Q9BXW3 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
SNHG12Q9BXW3 NOS1AP-205ENST00000493151 5559 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
SNHG12Q9BXW3 AC093668.2-201ENST00000481893 3569 ntTSL 2 BASIC12.44□□□□□ -0.42
SNHG12Q9BXW3 AC105052.1-201ENST00000519541 3569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.44□□□□□ -0.42
SNHG12Q9BXW3 PACS2-205ENST00000547217 2809 ntTSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
SNHG12Q9BXW3 HAND2-AS1-202ENST00000502896 5278 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
SNHG12Q9BXW3 AC092384.2-204ENST00000565053 2566 ntTSL 2 BASIC12.44□□□□□ -0.42
SNHG12Q9BXW3 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
SNHG12Q9BXW3 OR2I1P-210ENST00000642037 4691 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
SNHG12Q9BXW3 SNX9-201ENST00000392185 4198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
SNHG12Q9BXW3 MORN1-203ENST00000378531 1798 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.44□□□□□ -0.42
SNHG12Q9BXW3 OGG1-206ENST00000349503 1950 ntTSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
SNHG12Q9BXW3 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC12.44□□□□□ -0.42
SNHG12Q9BXW3 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
SNHG12Q9BXW3 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC12.44□□□□□ -0.42
SNHG12Q9BXW3 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC12.44□□□□□ -0.42
SNHG12Q9BXW3 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC12.44□□□□□ -0.42
SNHG12Q9BXW3 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC12.44□□□□□ -0.42
SNHG12Q9BXW3 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
SNHG12Q9BXW3 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
SNHG12Q9BXW3 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
SNHG12Q9BXW3 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
SNHG12Q9BXW3 ITSN1-204ENST00000381285 6107 ntTSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
SNHG12Q9BXW3 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
SNHG12Q9BXW3 ZNF580-202ENST00000543039 1707 ntAPPRIS P1 BASIC12.44□□□□□ -0.42
SNHG12Q9BXW3 PITPNM2-202ENST00000320201 6736 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
SNHG12Q9BXW3 PPT2-246ENST00000375137 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
SNHG12Q9BXW3 CNN3-207ENST00000545882 1902 ntTSL 2 BASIC12.44□□□□□ -0.42
SNHG12Q9BXW3 RASGRF1-203ENST00000558480 6237 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.44□□□□□ -0.42
SNHG12Q9BXW3 GOLGA7B-201ENST00000370602 6447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
SNHG12Q9BXW3 LINC00552-201ENST00000625151 2579 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
SNHG12Q9BXW3 ZNF398-203ENST00000483892 2121 ntTSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
SNHG12Q9BXW3 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
SNHG12Q9BXW3 SSR4-201ENST00000320857 1671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.44□□□□□ -0.42
SNHG12Q9BXW3 ILF2-201ENST00000361891 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
SNHG12Q9BXW3 GALNT3-201ENST00000392701 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
SNHG12Q9BXW3 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
SNHG12Q9BXW3 OS9-201ENST00000257966 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.44□□□□□ -0.42
SNHG12Q9BXW3 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
SNHG12Q9BXW3 IL2RG-202ENST00000374188 1432 ntTSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
SNHG12Q9BXW3 PACRGL-202ENST00000360916 2073 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
SNHG12Q9BXW3 PTPRF-201ENST00000359947 7727 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
SNHG12Q9BXW3 ZNF804B-201ENST00000333190 4659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
SNHG12Q9BXW3 MED16-203ENST00000325464 2922 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
SNHG12Q9BXW3 PLEKHO2-202ENST00000616065 3569 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
SNHG12Q9BXW3 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
SNHG12Q9BXW3 DYRK1B-205ENST00000597639 1806 ntTSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
SNHG12Q9BXW3 USP38-202ENST00000510377 4135 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
SNHG12Q9BXW3 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
SNHG12Q9BXW3 RIOK1-202ENST00000379834 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
SNHG12Q9BXW3 SIPA1-203ENST00000527525 3235 ntTSL 2 BASIC12.43□□□□□ -0.42
SNHG12Q9BXW3 ZNF18-201ENST00000322748 2767 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.43□□□□□ -0.42
SNHG12Q9BXW3 TLE4-204ENST00000376537 2793 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
SNHG12Q9BXW3 FAAP100-202ENST00000425898 2996 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
SNHG12Q9BXW3 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
SNHG12Q9BXW3 DSN1-207ENST00000448110 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.43□□□□□ -0.42
SNHG12Q9BXW3 PLXNB1-202ENST00000358536 7308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
SNHG12Q9BXW3 RBM47-203ENST00000381795 4473 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.43□□□□□ -0.42
SNHG12Q9BXW3 GRAMD4-202ENST00000406902 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
SNHG12Q9BXW3 SYP-201ENST00000263233 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
SNHG12Q9BXW3 ARIH2-205ENST00000449376 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
SNHG12Q9BXW3 IQCC-202ENST00000537469 2252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
SNHG12Q9BXW3 EDC3-202ENST00000426797 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
SNHG12Q9BXW3 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC12.43□□□□□ -0.42
SNHG12Q9BXW3 AC004233.2-201ENST00000573315 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
SNHG12Q9BXW3 CUL3-202ENST00000344951 6592 ntTSL 2 BASIC12.43□□□□□ -0.42
SNHG12Q9BXW3 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
SNHG12Q9BXW3 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
SNHG12Q9BXW3 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
SNHG12Q9BXW3 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
SNHG12Q9BXW3 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC12.43□□□□□ -0.42
SNHG12Q9BXW3 FAM192A-201ENST00000309137 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
SNHG12Q9BXW3 HBP1-212ENST00000485846 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.43□□□□□ -0.42
SNHG12Q9BXW3 NGFR-202ENST00000504201 1840 ntTSL 2 BASIC12.43□□□□□ -0.42
SNHG12Q9BXW3 KDM2B-205ENST00000536437 2762 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
SNHG12Q9BXW3 AC010491.1-201ENST00000563101 2797 ntBASIC12.43□□□□□ -0.42
SNHG12Q9BXW3 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
SNHG12Q9BXW3 AK4-202ENST00000395334 6998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
SNHG12Q9BXW3 NACC2-201ENST00000277554 6899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
SNHG12Q9BXW3 CA12-202ENST00000344366 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
SNHG12Q9BXW3 DBN1-203ENST00000393565 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
SNHG12Q9BXW3 ZNF663P-201ENST00000400371 2722 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
SNHG12Q9BXW3 CICP23-201ENST00000605013 2741 ntBASIC12.43□□□□□ -0.42
SNHG12Q9BXW3 FOXRED2-204ENST00000397224 4967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
SNHG12Q9BXW3 PRKN-204ENST00000366896 2514 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
SNHG12Q9BXW3 FBXL19-202ENST00000380310 3796 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.43□□□□□ -0.42
SNHG12Q9BXW3 APBB1-218ENST00000608655 1920 ntTSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
SNHG12Q9BXW3 AFF4-201ENST00000265343 9552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
SNHG12Q9BXW3 FEN1-201ENST00000305885 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
SNHG12Q9BXW3 SERPINE2-206ENST00000447280 1716 ntTSL 2 BASIC12.42□□□□□ -0.42
SNHG12Q9BXW3 C17orf107-201ENST00000381365 3199 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46 ms