Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSW2

CRACR2A, EF-hand calcium-binding domain-containing protein 4B, humanhuman

Predictions only

Length 395 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRACR2AQ9BSW2 SSSCA1-201ENST00000309328 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CRACR2AQ9BSW2 PDZD7-203ENST00000470414 1057 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CRACR2AQ9BSW2 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CRACR2AQ9BSW2 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CRACR2AQ9BSW2 PTK2-216ENST00000519881 863 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CRACR2AQ9BSW2 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CRACR2AQ9BSW2 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CRACR2AQ9BSW2 LINC01714-202ENST00000635451 896 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CRACR2AQ9BSW2 DPF2-205ENST00000528416 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CRACR2AQ9BSW2 TMEM198B-203ENST00000482378 2230 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CRACR2AQ9BSW2 U2AF2-201ENST00000308924 1698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CRACR2AQ9BSW2 BBS7-204ENST00000506636 2570 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CRACR2AQ9BSW2 PODXL-201ENST00000322985 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CRACR2AQ9BSW2 SMARCC2-202ENST00000347471 3839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CRACR2AQ9BSW2 NEIL2-202ENST00000403422 2016 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CRACR2AQ9BSW2 LARP4-210ENST00000522085 1577 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CRACR2AQ9BSW2 EPB41L3-204ENST00000540638 3370 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CRACR2AQ9BSW2 AC011270.2-201ENST00000624293 2550 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
CRACR2AQ9BSW2 VAV2-201ENST00000371850 4837 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CRACR2AQ9BSW2 SLC8B1-210ENST00000550047 2493 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CRACR2AQ9BSW2 KRT79-201ENST00000330553 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CRACR2AQ9BSW2 KRT28-201ENST00000306658 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CRACR2AQ9BSW2 PSENEN-202ENST00000587708 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CRACR2AQ9BSW2 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CRACR2AQ9BSW2 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CRACR2AQ9BSW2 COX5BP2-201ENST00000392354 334 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
CRACR2AQ9BSW2 AC007967.3-201ENST00000434308 558 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
CRACR2AQ9BSW2 MHENCR-202ENST00000449500 801 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CRACR2AQ9BSW2 ZNF436-AS1-203ENST00000454117 997 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CRACR2AQ9BSW2 KRT8P26-201ENST00000534154 1276 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
CRACR2AQ9BSW2 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CRACR2AQ9BSW2 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CRACR2AQ9BSW2 AC005336.2-201ENST00000593183 939 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
CRACR2AQ9BSW2 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CRACR2AQ9BSW2 IFT140-203ENST00000426508 5270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CRACR2AQ9BSW2 HYAL3-202ENST00000359051 1635 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CRACR2AQ9BSW2 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CRACR2AQ9BSW2 TTLL10-202ENST00000379289 2259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CRACR2AQ9BSW2 RAB35-201ENST00000229340 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CRACR2AQ9BSW2 C14orf28-201ENST00000325192 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CRACR2AQ9BSW2 TVP23C-204ENST00000438826 1852 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CRACR2AQ9BSW2 FAM184B-201ENST00000265018 6622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CRACR2AQ9BSW2 NAP1L4-201ENST00000380542 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CRACR2AQ9BSW2 BEST2-202ENST00000549706 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CRACR2AQ9BSW2 CLEC18B-206ENST00000620745 1847 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CRACR2AQ9BSW2 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CRACR2AQ9BSW2 YAP1-208ENST00000531439 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CRACR2AQ9BSW2 DYM-201ENST00000269445 5049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CRACR2AQ9BSW2 SYVN1-203ENST00000377190 3052 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CRACR2AQ9BSW2 AKIRIN1-202ENST00000432648 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CRACR2AQ9BSW2 MIB2-202ENST00000378708 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CRACR2AQ9BSW2 RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 4931 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
CRACR2AQ9BSW2 SYNGR2-206ENST00000589711 2041 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
CRACR2AQ9BSW2 WLS-205ENST00000370976 2332 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
CRACR2AQ9BSW2 PCDHGC3-205ENST00000617641 2346 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
CRACR2AQ9BSW2 HSF2-202ENST00000452194 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
CRACR2AQ9BSW2 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
CRACR2AQ9BSW2 POLR2M-206ENST00000494490 1648 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
CRACR2AQ9BSW2 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
CRACR2AQ9BSW2 MAST3-201ENST00000262811 5896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
CRACR2AQ9BSW2 HSD11B1L-223ENST00000616276 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
CRACR2AQ9BSW2 RPS19BP1-201ENST00000334678 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CRACR2AQ9BSW2 GPX4-201ENST00000354171 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CRACR2AQ9BSW2 RNF216P1-205ENST00000406089 807 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
CRACR2AQ9BSW2 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
CRACR2AQ9BSW2 AC091607.1-201ENST00000490318 1060 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
CRACR2AQ9BSW2 FAM86EP-206ENST00000510506 987 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
CRACR2AQ9BSW2 AP006284.1-202ENST00000527113 527 ntTSL 4 BASIC19.08■□□□□ 0.64
CRACR2AQ9BSW2 AC004771.4-201ENST00000576752 474 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
CRACR2AQ9BSW2 AL121956.5-201ENST00000625261 221 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
CRACR2AQ9BSW2 KIF5C-201ENST00000435030 6931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CRACR2AQ9BSW2 CRAMP1-201ENST00000293925 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
CRACR2AQ9BSW2 VSTM2A-204ENST00000407838 3112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
CRACR2AQ9BSW2 EIF3L-202ENST00000406934 2282 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
CRACR2AQ9BSW2 EIF4H-202ENST00000353999 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CRACR2AQ9BSW2 JKAMP-202ENST00000356057 2524 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CRACR2AQ9BSW2 MATN3-201ENST00000407540 2524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CRACR2AQ9BSW2 WIPF1-201ENST00000272746 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CRACR2AQ9BSW2 AC125634.1-201ENST00000438758 1403 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
CRACR2AQ9BSW2 CLEC10A-204ENST00000571664 1442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CRACR2AQ9BSW2 ADRB3-201ENST00000345060 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CRACR2AQ9BSW2 CLDN11-201ENST00000064724 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CRACR2AQ9BSW2 CLDN15-202ENST00000401528 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CRACR2AQ9BSW2 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CRACR2AQ9BSW2 HNRNPU-205ENST00000444376 6827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CRACR2AQ9BSW2 PROK1-201ENST00000271331 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CRACR2AQ9BSW2 ORAOV1-206ENST00000536870 2274 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CRACR2AQ9BSW2 RUVBL1-201ENST00000322623 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CRACR2AQ9BSW2 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CRACR2AQ9BSW2 PLTP-202ENST00000372420 1530 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CRACR2AQ9BSW2 HFE2-201ENST00000336751 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CRACR2AQ9BSW2 KLK12-201ENST00000250351 882 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CRACR2AQ9BSW2 KLK12-202ENST00000319590 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CRACR2AQ9BSW2 PON3-205ENST00000451904 1053 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CRACR2AQ9BSW2 AC008429.1-203ENST00000518894 548 ntTSL 4 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CRACR2AQ9BSW2 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CRACR2AQ9BSW2 AC090616.6-201ENST00000582640 721 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
CRACR2AQ9BSW2 AC005944.1-201ENST00000592758 564 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CRACR2AQ9BSW2 RIC8B-203ENST00000392839 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CRACR2AQ9BSW2 VRK1-201ENST00000216639 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.6 ms