Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQI6

SLF1, SMC5-SMC6 complex localization factor protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,058 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLF1Q9BQI6 PAXX-201ENST00000371620 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SLF1Q9BQI6 BAG1-202ENST00000379704 1128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SLF1Q9BQI6 KLK14-202ENST00000391802 1133 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SLF1Q9BQI6 GNB2-205ENST00000419828 1285 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SLF1Q9BQI6 LINC00982-205ENST00000420957 435 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
SLF1Q9BQI6 AP001058.1-201ENST00000423967 463 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SLF1Q9BQI6 VN2R19P-201ENST00000442399 1052 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
SLF1Q9BQI6 LINC00237-202ENST00000455890 1220 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SLF1Q9BQI6 TUBA1A-203ENST00000546918 984 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SLF1Q9BQI6 NUTF2-206ENST00000569436 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SLF1Q9BQI6 MIR3687-2-201ENST00000577708 61 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
SLF1Q9BQI6 AC243773.2-203ENST00000612281 640 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SLF1Q9BQI6 MIR3687-1-201ENST00000614492 61 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
SLF1Q9BQI6 AL691403.2-201ENST00000618460 490 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
SLF1Q9BQI6 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SLF1Q9BQI6 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SLF1Q9BQI6 SYCE1-203ENST00000368517 1377 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SLF1Q9BQI6 LINC00574-201ENST00000420557 2318 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SLF1Q9BQI6 RAB11FIP2-201ENST00000355624 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SLF1Q9BQI6 ACOXL-205ENST00000439055 2373 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SLF1Q9BQI6 OLFM1-201ENST00000252854 2591 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SLF1Q9BQI6 SLC38A11-202ENST00000409058 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SLF1Q9BQI6 DSCR9-201ENST00000454482 1644 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SLF1Q9BQI6 TCEA1-201ENST00000396401 2718 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SLF1Q9BQI6 PDCD7-201ENST00000204549 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SLF1Q9BQI6 KCTD20-210ENST00000536244 5345 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SLF1Q9BQI6 ECE2-201ENST00000324557 1823 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SLF1Q9BQI6 SNAP91-201ENST00000195649 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SLF1Q9BQI6 SNAP91-204ENST00000369694 4449 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SLF1Q9BQI6 ATRN-201ENST00000262919 8633 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SLF1Q9BQI6 SLC27A2-202ENST00000380902 2181 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SLF1Q9BQI6 SLC22A4-201ENST00000200652 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SLF1Q9BQI6 PHF1-201ENST00000374512 2224 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SLF1Q9BQI6 ST6GALNAC6-201ENST00000291839 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SLF1Q9BQI6 ZNF416-201ENST00000196489 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SLF1Q9BQI6 VHL-202ENST00000345392 2696 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SLF1Q9BQI6 ZNF81-201ENST00000334937 610 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SLF1Q9BQI6 SMN1-201ENST00000351205 900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SLF1Q9BQI6 SMN2-201ENST00000380741 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SLF1Q9BQI6 ATP5G3-202ENST00000392541 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SLF1Q9BQI6 WWOX-204ENST00000408984 1227 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SLF1Q9BQI6 COPS7B-207ENST00000410024 1103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SLF1Q9BQI6 PRSS29P-201ENST00000440800 595 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
SLF1Q9BQI6 BARX1-AS1-202ENST00000454594 307 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SLF1Q9BQI6 AC112482.1-201ENST00000492080 688 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
SLF1Q9BQI6 TRMT112-202ENST00000535126 704 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SLF1Q9BQI6 TWSG1-202ENST00000581641 1119 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SLF1Q9BQI6 AC008403.2-204ENST00000600650 1006 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SLF1Q9BQI6 AC004790.2-201ENST00000623588 572 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
SLF1Q9BQI6 ATP6AP2-220ENST00000636970 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SLF1Q9BQI6 SMN2-216ENST00000638794 846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SLF1Q9BQI6 NR1H3-202ENST00000405576 1352 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SLF1Q9BQI6 PHYHD1-201ENST00000308941 1599 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SLF1Q9BQI6 TBC1D1-203ENST00000402522 1567 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SLF1Q9BQI6 ZNF296-202ENST00000622376 1631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SLF1Q9BQI6 HLA-DQB1-201ENST00000374943 1656 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
SLF1Q9BQI6 PRPF31-202ENST00000391755 1767 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SLF1Q9BQI6 RASL11B-201ENST00000248706 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SLF1Q9BQI6 FRS3-201ENST00000259748 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SLF1Q9BQI6 SLC12A9-215ENST00000540482 2269 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SLF1Q9BQI6 DDX31-201ENST00000310532 2408 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SLF1Q9BQI6 FHL1-205ENST00000370690 2441 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SLF1Q9BQI6 FARP2-202ENST00000373287 2580 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SLF1Q9BQI6 TCEA1-208ENST00000521604 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SLF1Q9BQI6 QKI-203ENST00000361752 9463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SLF1Q9BQI6 SIRT1-201ENST00000212015 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
SLF1Q9BQI6 GIT1-203ENST00000394869 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
SLF1Q9BQI6 RIN1-201ENST00000311320 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
SLF1Q9BQI6 ASB13-201ENST00000357700 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
SLF1Q9BQI6 FOLH1-204ENST00000356696 2403 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
SLF1Q9BQI6 POLR1D-220ENST00000637071 1943 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SLF1Q9BQI6 TSKS-201ENST00000246801 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SLF1Q9BQI6 RAB39A-201ENST00000320578 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SLF1Q9BQI6 MTG1-201ENST00000317502 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SLF1Q9BQI6 INPP5J-204ENST00000402238 1564 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SLF1Q9BQI6 AC093627.6-201ENST00000478759 1365 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SLF1Q9BQI6 PPIB-201ENST00000300026 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SLF1Q9BQI6 PTCHD3P3-201ENST00000403073 906 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
SLF1Q9BQI6 HNRNPA1P28-201ENST00000424481 961 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
SLF1Q9BQI6 LINC01705-201ENST00000438158 562 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SLF1Q9BQI6 AL049569.1-201ENST00000446261 636 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SLF1Q9BQI6 FAM172A-207ENST00000509739 1031 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SLF1Q9BQI6 CDC42EP4-206ENST00000581014 737 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SLF1Q9BQI6 AL662799.1-201ENST00000630418 496 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SLF1Q9BQI6 FBXL7-202ENST00000504595 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SLF1Q9BQI6 DAG1-219ENST00000538711 5582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SLF1Q9BQI6 CLDND1-204ENST00000394185 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SLF1Q9BQI6 LHFPL6-201ENST00000379589 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SLF1Q9BQI6 ADK-202ENST00000372734 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SLF1Q9BQI6 SMPD3-211ENST00000568373 2073 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SLF1Q9BQI6 PYGL-201ENST00000216392 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SLF1Q9BQI6 CDH22-203ENST00000537909 3902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SLF1Q9BQI6 TSLP-203ENST00000420978 2621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SLF1Q9BQI6 SLCO4A1-AS1-202ENST00000433126 1420 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SLF1Q9BQI6 CORO6-210ENST00000580212 2345 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SLF1Q9BQI6 IRF8-203ENST00000563180 1394 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SLF1Q9BQI6 KLHDC10-201ENST00000335420 6437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SLF1Q9BQI6 CGREF1-201ENST00000260595 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SLF1Q9BQI6 SGF29-201ENST00000317058 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SLF1Q9BQI6 CMTM2-202ENST00000379486 904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.5 ms