Protein–RNA interactions for Protein: Q99985

SEMA3C, Semaphorin-3C, humanhuman

Predictions only

Length 751 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA3CQ99985 ARSK-202ENST00000504763 1088 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SEMA3CQ99985 SPINT1-AS1-202ENST00000564302 643 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
SEMA3CQ99985 AC108860.2-201ENST00000562760 2183 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
SEMA3CQ99985 ATOH1-201ENST00000306011 2212 ntAPPRIS P1 BASIC17.61■□□□□ 0.41
SEMA3CQ99985 SAMD3-202ENST00000368134 2377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
SEMA3CQ99985 SEPT2-245ENST00000616972 3446 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
SEMA3CQ99985 GPER1-204ENST00000401670 1542 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
SEMA3CQ99985 DBNL-213ENST00000452943 1513 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
SEMA3CQ99985 TUBGCP3-202ENST00000375669 2723 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SEMA3CQ99985 CCDC120-204ENST00000597275 2752 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
SEMA3CQ99985 MAP3K13-212ENST00000448876 1681 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SEMA3CQ99985 PDCD7-201ENST00000204549 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SEMA3CQ99985 CLDN4-201ENST00000340958 1831 ntAPPRIS P1 BASIC17.61■□□□□ 0.41
SEMA3CQ99985 FAM153A-203ENST00000440605 1966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SEMA3CQ99985 APP-202ENST00000348990 3355 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SEMA3CQ99985 TRAM1-205ENST00000521425 3394 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
SEMA3CQ99985 AC005498.3-201ENST00000596587 2045 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SEMA3CQ99985 ASPRV1-201ENST00000320256 2177 ntAPPRIS P1 BASIC17.6■□□□□ 0.41
SEMA3CQ99985 CYP2W1-201ENST00000308919 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SEMA3CQ99985 LINC00921-202ENST00000573951 2468 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
SEMA3CQ99985 HDAC10-222ENST00000626012 2607 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
SEMA3CQ99985 NPTN-202ENST00000351217 2817 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SEMA3CQ99985 GML-201ENST00000220940 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SEMA3CQ99985 GOSR2-201ENST00000225567 1245 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SEMA3CQ99985 UPK3A-202ENST00000396082 627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SEMA3CQ99985 SMIM11A-202ENST00000399295 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
SEMA3CQ99985 AC078883.2-201ENST00000441212 558 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
SEMA3CQ99985 LAT-205ENST00000454369 1262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
SEMA3CQ99985 SCARNA2-201ENST00000458748 420 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
SEMA3CQ99985 KNCN-203ENST00000481882 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
SEMA3CQ99985 AC097372.2-201ENST00000510996 732 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
SEMA3CQ99985 TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 609 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SEMA3CQ99985 TUBA1A-203ENST00000546918 984 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
SEMA3CQ99985 MCRIP1-211ENST00000576679 751 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
SEMA3CQ99985 METTL23-215ENST00000615984 1171 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
SEMA3CQ99985 SMIM11B-207ENST00000624758 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
SEMA3CQ99985 AL022326.1-202ENST00000641533 845 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
SEMA3CQ99985 NDFIP1-201ENST00000253814 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SEMA3CQ99985 MCMBP-201ENST00000360003 4169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
SEMA3CQ99985 PRAMEF20-201ENST00000316412 1597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
SEMA3CQ99985 ATP6V0E2-202ENST00000425642 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SEMA3CQ99985 NPRL2-201ENST00000232501 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SEMA3CQ99985 ZDHHC20-202ENST00000382466 5338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SEMA3CQ99985 ANHX-201ENST00000419717 1765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
SEMA3CQ99985 LGMN-216ENST00000557434 1797 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
SEMA3CQ99985 RANBP3-220ENST00000591092 1783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SEMA3CQ99985 PPT2-246ENST00000375137 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SEMA3CQ99985 ARPIN-202ENST00000460685 2145 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
SEMA3CQ99985 DHX33-202ENST00000433302 2225 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SEMA3CQ99985 FGFR4-207ENST00000502906 2638 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SEMA3CQ99985 C8orf33-201ENST00000331434 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SEMA3CQ99985 VPS26A-202ENST00000373382 3229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
SEMA3CQ99985 PARD3-201ENST00000340077 3518 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SEMA3CQ99985 EMILIN3-201ENST00000332312 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SEMA3CQ99985 SIRT1-201ENST00000212015 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SEMA3CQ99985 MAP4K4-202ENST00000324219 7526 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SEMA3CQ99985 WDR90-215ENST00000549091 5589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SEMA3CQ99985 TEF-201ENST00000266304 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SEMA3CQ99985 PRDM8-203ENST00000504452 3706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SEMA3CQ99985 BCAR1-201ENST00000162330 3221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SEMA3CQ99985 GDF5-202ENST00000374372 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SEMA3CQ99985 SLC29A2-206ENST00000546034 2509 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SEMA3CQ99985 RMDN3-202ENST00000338376 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SEMA3CQ99985 CCT4-204ENST00000544079 2261 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SEMA3CQ99985 MCF2L-208ENST00000397030 6580 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SEMA3CQ99985 FOXP1-210ENST00000484350 1996 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SEMA3CQ99985 CTSB-232ENST00000534510 1989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SEMA3CQ99985 TVP23C-204ENST00000438826 1852 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SEMA3CQ99985 HOXA2-201ENST00000222718 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SEMA3CQ99985 ADSL-202ENST00000342312 1808 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SEMA3CQ99985 TCEAL2-202ENST00000372780 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SEMA3CQ99985 RPP38-203ENST00000378202 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SEMA3CQ99985 DNASE1L2-202ENST00000382437 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SEMA3CQ99985 HDAC11-202ENST00000402259 1000 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SEMA3CQ99985 CAPG-203ENST00000409670 1183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SEMA3CQ99985 PRYP5-201ENST00000451909 266 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
SEMA3CQ99985 RAB42-202ENST00000465518 857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SEMA3CQ99985 HOXB-AS4-202ENST00000480386 566 ntTSL 4 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SEMA3CQ99985 S100A2-206ENST00000497140 697 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SEMA3CQ99985 NOP16-205ENST00000509257 1000 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SEMA3CQ99985 RPL19-204ENST00000579260 1051 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SEMA3CQ99985 AL121912.1-201ENST00000603683 238 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
SEMA3CQ99985 CHMP4A-211ENST00000609024 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SEMA3CQ99985 LINC00454-206ENST00000609861 841 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SEMA3CQ99985 AL121832.1-201ENST00000615180 677 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SEMA3CQ99985 ZBTB4-202ENST00000380599 5866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SEMA3CQ99985 ZNF74-202ENST00000400451 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SEMA3CQ99985 OSBP2-202ENST00000401475 2468 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SEMA3CQ99985 PTPN6-204ENST00000456013 2389 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SEMA3CQ99985 GOLGA2P9-203ENST00000600260 2033 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SEMA3CQ99985 AC097637.2-201ENST00000624096 1997 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
SEMA3CQ99985 PYGL-201ENST00000216392 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
SEMA3CQ99985 KLHL21-202ENST00000377663 6445 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
SEMA3CQ99985 PLA2G12A-201ENST00000243501 5226 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
SEMA3CQ99985 AC116353.5-201ENST00000638148 1699 ntBASIC17.58■□□□□ 0.41
SEMA3CQ99985 MAPRE1-201ENST00000375571 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
SEMA3CQ99985 L1CAM-203ENST00000370055 4655 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
SEMA3CQ99985 SKOR1-203ENST00000554054 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
SEMA3CQ99985 P2RY6-204ENST00000393592 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
SEMA3CQ99985 DNM1P34-201ENST00000567292 2276 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.6 ms