Protein–RNA interactions for Protein: Q99717

SMAD5, Mothers against decapentaplegic homolog 5, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 465 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMAD5Q99717 AL365226.1-201ENST00000448363 349 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SMAD5Q99717 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SMAD5Q99717 MYL6-203ENST00000536128 1221 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SMAD5Q99717 AP002770.1-201ENST00000540547 428 ntTSL 4 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SMAD5Q99717 IQSEC2-210ENST00000639161 936 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SMAD5Q99717 FHL1-205ENST00000370690 2441 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SMAD5Q99717 TNFSF14-202ENST00000599359 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
SMAD5Q99717 NOP9-202ENST00000396802 1942 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
SMAD5Q99717 CCNI2-201ENST00000378731 2355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
SMAD5Q99717 SYVN1-201ENST00000294256 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
SMAD5Q99717 MDGA1-203ENST00000434837 10736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
SMAD5Q99717 PPA2-202ENST00000348706 1414 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
SMAD5Q99717 FASTK-202ENST00000353841 1402 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
SMAD5Q99717 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
SMAD5Q99717 PRRT2-212ENST00000636619 2065 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
SMAD5Q99717 PDE9A-209ENST00000398227 1606 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
SMAD5Q99717 KCNE3-201ENST00000310128 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
SMAD5Q99717 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
SMAD5Q99717 C8orf58-207ENST00000615223 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
SMAD5Q99717 EPB41L5-203ENST00000443124 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
SMAD5Q99717 PORCN-205ENST00000367574 1368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SMAD5Q99717 PORCN-214ENST00000537758 1371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SMAD5Q99717 DDX31-201ENST00000310532 2408 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SMAD5Q99717 CAMK1D-201ENST00000378845 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SMAD5Q99717 TNIP1-221ENST00000610874 2629 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SMAD5Q99717 DUOX1-202ENST00000389037 5483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SMAD5Q99717 LUC7L-221ENST00000629543 1520 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SMAD5Q99717 FBXL20-205ENST00000583610 1739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SMAD5Q99717 CORO6-210ENST00000580212 2345 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SMAD5Q99717 ARFIP2-201ENST00000254584 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SMAD5Q99717 FAM129C-202ENST00000335393 2508 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SMAD5Q99717 MAPRE3-201ENST00000233121 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SMAD5Q99717 ACBD6-201ENST00000367595 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SMAD5Q99717 DAP3-214ENST00000471642 1671 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SMAD5Q99717 ARMC5-203ENST00000457010 4844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SMAD5Q99717 DHRS4L2-203ENST00000534993 1450 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SMAD5Q99717 ARL4C-202ENST00000390645 4013 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SMAD5Q99717 CTSG-201ENST00000216336 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SMAD5Q99717 IGLL1-202ENST00000330377 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SMAD5Q99717 ROMO1-203ENST00000374077 422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SMAD5Q99717 MSANTD3-201ENST00000374885 786 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SMAD5Q99717 GAR1-202ENST00000394631 1011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SMAD5Q99717 MIR940-201ENST00000401276 94 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
SMAD5Q99717 GGT1-207ENST00000404532 853 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SMAD5Q99717 SCRN1-203ENST00000409570 535 ntTSL 4 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SMAD5Q99717 C11orf74-203ENST00000446510 1062 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SMAD5Q99717 AP001107.6-201ENST00000526655 516 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SMAD5Q99717 PAM16-208ENST00000573553 722 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SMAD5Q99717 SHBG-211ENST00000574539 938 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SMAD5Q99717 ANAPC11-210ENST00000574924 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SMAD5Q99717 AC011498.3-201ENST00000590159 569 ntTSL 4 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SMAD5Q99717 AL139288.1-201ENST00000623748 933 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
SMAD5Q99717 HDAC10-222ENST00000626012 2607 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SMAD5Q99717 ZNF668-201ENST00000300849 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SMAD5Q99717 RNF222-201ENST00000344001 2786 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SMAD5Q99717 HLA-J-201ENST00000462773 1622 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
SMAD5Q99717 POLR2M-206ENST00000494490 1648 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SMAD5Q99717 MSI2-201ENST00000284073 6364 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SMAD5Q99717 PHF20L1-201ENST00000220847 3297 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SMAD5Q99717 LEXM-201ENST00000358193 1777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SMAD5Q99717 MBNL1-201ENST00000282486 6422 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SMAD5Q99717 CAPN1-201ENST00000279247 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SMAD5Q99717 PAPOLB-201ENST00000404991 4262 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SMAD5Q99717 CPEB2-204ENST00000382401 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SMAD5Q99717 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SMAD5Q99717 WDR81-202ENST00000409644 6733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SMAD5Q99717 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SMAD5Q99717 ZDHHC24-201ENST00000310442 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SMAD5Q99717 MXRA8-202ENST00000342753 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SMAD5Q99717 JAK3-201ENST00000458235 5432 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SMAD5Q99717 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SMAD5Q99717 KCNMA1-201ENST00000286627 6194 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SMAD5Q99717 PCCB-207ENST00000466072 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SMAD5Q99717 PELP1-208ENST00000572293 5272 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SMAD5Q99717 TPBG-201ENST00000369750 6484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SMAD5Q99717 DVL2-209ENST00000575458 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SMAD5Q99717 GGNBP2-212ENST00000613102 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SMAD5Q99717 MEGF6-201ENST00000294599 4501 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SMAD5Q99717 TTC22-201ENST00000371274 2149 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SMAD5Q99717 RFXANK-202ENST00000392324 1059 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SMAD5Q99717 CSF3-203ENST00000394148 622 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SMAD5Q99717 RBCK1-206ENST00000400247 790 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SMAD5Q99717 POM121L12-201ENST00000408890 1283 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SMAD5Q99717 RAB17-203ENST00000409576 466 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SMAD5Q99717 C2orf49-202ENST00000410049 854 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SMAD5Q99717 DMKN-206ENST00000418261 1257 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SMAD5Q99717 RPS2P1-201ENST00000434010 821 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
SMAD5Q99717 AC234772.2-201ENST00000456532 375 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SMAD5Q99717 OR7E14P-202ENST00000530490 1290 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
SMAD5Q99717 PNMT-203ENST00000581428 677 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SMAD5Q99717 MED16-213ENST00000616387 1078 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SMAD5Q99717 NSUN5P2-201ENST00000388955 1789 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SMAD5Q99717 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SMAD5Q99717 PACS1-201ENST00000320580 4392 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SMAD5Q99717 ELP5-214ENST00000574993 2209 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SMAD5Q99717 STIM2-212ENST00000639640 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SMAD5Q99717 PLEKHF2-201ENST00000315367 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SMAD5Q99717 PML-205ENST00000395132 1738 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SMAD5Q99717 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SMAD5Q99717 PPP1R16B-201ENST00000299824 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.8 ms