Protein–RNA interactions for Protein: Q99698

LYST, Lysosomal-trafficking regulator, humanhuman

Predictions only

Length 3,801 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LYSTQ99698 TMEM14B-212ENST00000475942 992 ntTSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
LYSTQ99698 PACS1-203ENST00000524815 628 ntTSL 4 BASIC11.88□□□□□ -0.51
LYSTQ99698 AC008750.1-201ENST00000532473 492 ntTSL 3 BASIC11.88□□□□□ -0.51
LYSTQ99698 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
LYSTQ99698 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
LYSTQ99698 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
LYSTQ99698 P2RX5-209ENST00000552276 1642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
LYSTQ99698 IFITM3-201ENST00000399808 808 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
LYSTQ99698 LINC00659-201ENST00000412500 540 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
LYSTQ99698 GRTP1-AS1-201ENST00000419199 867 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
LYSTQ99698 GRAMD2B-218ENST00000542322 2977 ntTSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
LYSTQ99698 IL32-234ENST00000552936 713 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.88□□□□□ -0.51
LYSTQ99698 MEN1-203ENST00000337652 3162 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
LYSTQ99698 MDM2-209ENST00000393412 1404 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
LYSTQ99698 SLBP-202ENST00000429429 1623 ntTSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
LYSTQ99698 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
LYSTQ99698 PDE4A-202ENST00000344979 2579 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
LYSTQ99698 SLC44A3-201ENST00000271227 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
LYSTQ99698 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
LYSTQ99698 SSB-201ENST00000260956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
LYSTQ99698 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
LYSTQ99698 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
LYSTQ99698 TUBB2B-201ENST00000259818 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
LYSTQ99698 SELENOF-208ENST00000616787 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
LYSTQ99698 RPS9-203ENST00000391752 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
LYSTQ99698 AL365255.1-202ENST00000413887 363 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
LYSTQ99698 AC079140.1-201ENST00000508039 487 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
LYSTQ99698 TBPL1-208ENST00000613034 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
LYSTQ99698 EWSR1-202ENST00000332035 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
LYSTQ99698 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
LYSTQ99698 ADRA1A-202ENST00000354550 1765 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
LYSTQ99698 SIGLEC10-204ENST00000436984 1776 ntTSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
LYSTQ99698 GPX3-210ENST00000622181 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
LYSTQ99698 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
LYSTQ99698 UBE3D-203ENST00000369747 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
LYSTQ99698 SLC2A8-202ENST00000373360 1937 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
LYSTQ99698 ZNF131-206ENST00000505606 3209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
LYSTQ99698 AC138969.3-201ENST00000546612 1459 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
LYSTQ99698 AC138932.2-201ENST00000548268 1459 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
LYSTQ99698 AC126755.4-201ENST00000549796 1459 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
LYSTQ99698 PLD3-207ENST00000409735 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
LYSTQ99698 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
LYSTQ99698 FAM185BP-201ENST00000443595 716 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
LYSTQ99698 GIMAP3P-201ENST00000495150 836 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
LYSTQ99698 AC021054.1-202ENST00000543884 599 ntTSL 3 BASIC11.87□□□□□ -0.51
LYSTQ99698 AC109462.3-201ENST00000573934 613 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
LYSTQ99698 AC017083.2-201ENST00000608069 979 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
LYSTQ99698 AC099568.2-201ENST00000609194 695 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
LYSTQ99698 NEIL2-203ENST00000436750 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
LYSTQ99698 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
LYSTQ99698 AC068446.2-201ENST00000500487 2165 ntTSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
LYSTQ99698 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
LYSTQ99698 PNLDC1-207ENST00000610273 1940 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
LYSTQ99698 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC11.87□□□□□ -0.51
LYSTQ99698 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
LYSTQ99698 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
LYSTQ99698 NPRL2-201ENST00000232501 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
LYSTQ99698 FIBP-201ENST00000338369 1261 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
LYSTQ99698 ABHD11-203ENST00000395147 812 ntTSL 3 BASIC11.87□□□□□ -0.51
LYSTQ99698 DGCR5-201ENST00000399539 862 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
LYSTQ99698 TMEM37-202ENST00000409826 794 ntTSL 3 BASIC11.87□□□□□ -0.51
LYSTQ99698 AC069120.2-201ENST00000524091 540 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
LYSTQ99698 SNX1-208ENST00000559844 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
LYSTQ99698 PDLIM1-201ENST00000329399 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
LYSTQ99698 ELN-202ENST00000320399 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
LYSTQ99698 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
LYSTQ99698 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
LYSTQ99698 AC009336.1-201ENST00000608941 1553 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
LYSTQ99698 LUC7L-202ENST00000337351 2097 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
LYSTQ99698 LRRD1-201ENST00000343318 2073 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
LYSTQ99698 HNRNPRP1-201ENST00000453465 1695 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
LYSTQ99698 PMAIP1-202ENST00000316660 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
LYSTQ99698 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
LYSTQ99698 AC140658.5-201ENST00000438532 169 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
LYSTQ99698 IQCF3-202ENST00000440739 505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
LYSTQ99698 KLK6-204ENST00000594641 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
LYSTQ99698 RIC8A-201ENST00000325207 2702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
LYSTQ99698 AC087500.1-202ENST00000571689 1715 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
LYSTQ99698 IDH3G-212ENST00000619865 1339 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
LYSTQ99698 HARS-203ENST00000431330 1774 ntTSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
LYSTQ99698 TNNC2-201ENST00000372555 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
LYSTQ99698 TNNC2-202ENST00000372557 780 ntTSL 3 BASIC11.86□□□□□ -0.51
LYSTQ99698 AC124944.1-201ENST00000448113 625 ntTSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
LYSTQ99698 FKBP11-208ENST00000550765 1030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
LYSTQ99698 MRPL52-216ENST00000557221 922 ntTSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
LYSTQ99698 MTX1-207ENST00000609421 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
LYSTQ99698 DUS1L-201ENST00000306796 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
LYSTQ99698 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
LYSTQ99698 DNM1-202ENST00000372923 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
LYSTQ99698 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
LYSTQ99698 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
LYSTQ99698 KCNQ2-215ENST00000629241 2853 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
LYSTQ99698 CLN8-205ENST00000520991 1305 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
LYSTQ99698 FNBP1-201ENST00000355681 1977 ntTSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
LYSTQ99698 AC133548.2-201ENST00000568567 2605 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
LYSTQ99698 LGMN-211ENST00000555699 1728 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
LYSTQ99698 PRAF2-201ENST00000376386 801 ntTSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
LYSTQ99698 LINC00982-205ENST00000420957 435 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
LYSTQ99698 NME2-206ENST00000513177 692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
LYSTQ99698 MRNIP-212ENST00000520698 902 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.1 ms