Protein–RNA interactions for Protein: Q99627

COPS8, COP9 signalosome complex subunit 8, humanhuman

Predictions only

Length 209 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPS8Q99627 AC004870.1-201ENST00000315132 882 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
COPS8Q99627 C1orf43-204ENST00000368518 1278 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
COPS8Q99627 HDAC11-202ENST00000402259 1000 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
COPS8Q99627 PRYP5-201ENST00000451909 266 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
COPS8Q99627 KNCN-203ENST00000481882 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
COPS8Q99627 PP7080-204ENST00000510714 601 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
COPS8Q99627 AP000721.2-201ENST00000537170 650 ntTSL 4 BASIC17.2■□□□□ 0.34
COPS8Q99627 MTHFSD-203ENST00000543303 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
COPS8Q99627 SNHG15-203ENST00000578968 982 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
COPS8Q99627 MTHFSD-220ENST00000634347 1207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
COPS8Q99627 AL022326.1-202ENST00000641533 845 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
COPS8Q99627 CFAP100-201ENST00000352312 2086 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
COPS8Q99627 ORAI2-202ENST00000403646 2528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
COPS8Q99627 NUDT19-201ENST00000397061 2967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
COPS8Q99627 MAP3K6-202ENST00000374040 4309 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
COPS8Q99627 CCNYL1-201ENST00000295414 3767 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
COPS8Q99627 PROSER2-201ENST00000277570 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
COPS8Q99627 SNX17-210ENST00000537606 2400 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
COPS8Q99627 OGG1-206ENST00000349503 1950 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
COPS8Q99627 SRSF1-201ENST00000258962 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
COPS8Q99627 FAM234A-203ENST00000399932 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
COPS8Q99627 ADRA1A-206ENST00000380586 2304 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
COPS8Q99627 ARPIN-202ENST00000460685 2145 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
COPS8Q99627 DTX2-202ENST00000413936 2472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
COPS8Q99627 AC005498.3-201ENST00000596587 2045 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
COPS8Q99627 TSPAN7-202ENST00000378482 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
COPS8Q99627 USH1C-205ENST00000527020 2159 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
COPS8Q99627 HOXA2-201ENST00000222718 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
COPS8Q99627 DMPK-201ENST00000291270 2787 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
COPS8Q99627 PRDM8-203ENST00000504452 3706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
COPS8Q99627 AC026954.2-202ENST00000575474 2571 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
COPS8Q99627 ATP6V0E2-202ENST00000425642 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
COPS8Q99627 CEP83-AS1-201ENST00000623122 2482 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
COPS8Q99627 GALNT14-202ENST00000349752 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
COPS8Q99627 UXT-202ENST00000335890 701 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
COPS8Q99627 AP2S1-202ENST00000352203 793 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
COPS8Q99627 UPK3A-202ENST00000396082 627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
COPS8Q99627 SMIM11A-202ENST00000399295 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
COPS8Q99627 HIST2H3DP1-201ENST00000401004 416 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
COPS8Q99627 AL133410.2-201ENST00000425499 696 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
COPS8Q99627 HOXB-AS4-202ENST00000480386 566 ntTSL 4 BASIC17.19■□□□□ 0.34
COPS8Q99627 RAP1B-228ENST00000542145 1060 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
COPS8Q99627 SART3-203ENST00000546611 1184 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
COPS8Q99627 TUBA1A-203ENST00000546918 984 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
COPS8Q99627 MIR22HG-204ENST00000571595 767 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
COPS8Q99627 MCRIP1-211ENST00000576679 751 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
COPS8Q99627 AP2S1-204ENST00000597020 707 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
COPS8Q99627 SMIM11B-207ENST00000624758 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
COPS8Q99627 GPER1-204ENST00000401670 1542 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
COPS8Q99627 DBNL-213ENST00000452943 1513 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
COPS8Q99627 CLDN5-202ENST00000406028 2548 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
COPS8Q99627 ERBB2-205ENST00000578199 2526 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
COPS8Q99627 SLC35F3-201ENST00000366617 2762 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
COPS8Q99627 WDR1-205ENST00000502702 1691 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
COPS8Q99627 DMKN-201ENST00000339686 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
COPS8Q99627 MIPEP-201ENST00000382172 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
COPS8Q99627 FAM69C-201ENST00000343998 3671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
COPS8Q99627 SLC6A17-201ENST00000331565 6427 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
COPS8Q99627 DGKI-203ENST00000446122 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
COPS8Q99627 ADSL-202ENST00000342312 1808 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
COPS8Q99627 LYPLAL1-201ENST00000366927 1819 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
COPS8Q99627 ESM1-201ENST00000381403 1326 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
COPS8Q99627 WIF1-201ENST00000286574 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
COPS8Q99627 FOXP1-210ENST00000484350 1996 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
COPS8Q99627 NPRL2-201ENST00000232501 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
COPS8Q99627 TJP3-201ENST00000539908 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
COPS8Q99627 AR-209ENST00000613054 3532 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
COPS8Q99627 TMC6-202ENST00000322914 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
COPS8Q99627 SH2D3C-203ENST00000373277 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
COPS8Q99627 GHRHR-201ENST00000326139 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
COPS8Q99627 PCDHA13-201ENST00000289272 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
COPS8Q99627 PLCB2-201ENST00000260402 4616 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
COPS8Q99627 TMPRSS5-207ENST00000540540 2001 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
COPS8Q99627 NFATC1-210ENST00000587635 2195 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
COPS8Q99627 DUSP4-201ENST00000240100 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
COPS8Q99627 GYPC-202ENST00000356887 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
COPS8Q99627 NANS-201ENST00000210444 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
COPS8Q99627 PDLIM4-202ENST00000379018 1006 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
COPS8Q99627 ESR1-204ENST00000406599 1251 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
COPS8Q99627 AL591212.1-201ENST00000433646 615 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
COPS8Q99627 FAAHP1-202ENST00000446499 1238 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
COPS8Q99627 RAB42-202ENST00000465518 857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
COPS8Q99627 AC080013.1-203ENST00000468242 720 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
COPS8Q99627 AC080013.1-201ENST00000495318 566 ntTSL 4 BASIC17.18■□□□□ 0.34
COPS8Q99627 NOP16-205ENST00000509257 1000 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
COPS8Q99627 MCCC2-205ENST00000509358 1214 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
COPS8Q99627 GLI4-207ENST00000521682 1082 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
COPS8Q99627 ARAP1-AS1-201ENST00000542022 388 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
COPS8Q99627 CYB561-217ENST00000582997 877 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
COPS8Q99627 SYVN1-201ENST00000294256 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
COPS8Q99627 HFE2-201ENST00000336751 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
COPS8Q99627 DHX33-202ENST00000433302 2225 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
COPS8Q99627 PTGER3-208ENST00000370932 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
COPS8Q99627 IL2RG-202ENST00000374188 1432 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
COPS8Q99627 FAM153A-203ENST00000440605 1966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
COPS8Q99627 TVP23C-204ENST00000438826 1852 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
COPS8Q99627 ZNF618-203ENST00000374126 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
COPS8Q99627 CYP2W1-201ENST00000308919 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
COPS8Q99627 WTAP-205ENST00000614346 1623 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
COPS8Q99627 RANBP3-220ENST00000591092 1783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.3 ms