Protein–RNA interactions for Protein: Q96QD8

SLC38A2, Sodium-coupled neutral amino acid transporter 2, humanhuman

Predictions only

Length 506 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC38A2Q96QD8 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SLC38A2Q96QD8 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SLC38A2Q96QD8 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SLC38A2Q96QD8 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
SLC38A2Q96QD8 PTPRA-205ENST00000399903 3337 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SLC38A2Q96QD8 TBXAS1-206ENST00000425687 2080 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SLC38A2Q96QD8 WIPF1-201ENST00000272746 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SLC38A2Q96QD8 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SLC38A2Q96QD8 AL357673.1-201ENST00000637610 2542 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SLC38A2Q96QD8 XPO5-201ENST00000265351 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SLC38A2Q96QD8 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SLC38A2Q96QD8 SLC8B1-210ENST00000550047 2493 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SLC38A2Q96QD8 BCL2L11-201ENST00000308659 1522 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SLC38A2Q96QD8 BX276092.7-203ENST00000637198 1536 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
SLC38A2Q96QD8 ADAMTS18-201ENST00000282849 5913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SLC38A2Q96QD8 AC005091.1-201ENST00000441955 1190 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SLC38A2Q96QD8 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SLC38A2Q96QD8 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SLC38A2Q96QD8 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SLC38A2Q96QD8 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SLC38A2Q96QD8 AP000550.4-202ENST00000639755 178 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
SLC38A2Q96QD8 SIGIRR-203ENST00000431843 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SLC38A2Q96QD8 PCDHA2-201ENST00000378132 2626 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SLC38A2Q96QD8 BAGE2-202ENST00000474011 1482 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SLC38A2Q96QD8 NDUFV1-223ENST00000532303 1493 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SLC38A2Q96QD8 CACNA1A-202ENST00000573710 7569 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SLC38A2Q96QD8 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SLC38A2Q96QD8 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SLC38A2Q96QD8 PFKFB3-215ENST00000536985 2094 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SLC38A2Q96QD8 PHF20L1-220ENST00000622263 3375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SLC38A2Q96QD8 NELFA-216ENST00000542778 2465 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SLC38A2Q96QD8 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SLC38A2Q96QD8 RUVBL1-201ENST00000322623 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SLC38A2Q96QD8 AC005332.1-201ENST00000577698 1310 ntBASIC16■□□□□ 0.15
SLC38A2Q96QD8 CLEC18C-201ENST00000314151 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SLC38A2Q96QD8 CLEC18A-208ENST00000568461 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SLC38A2Q96QD8 AC106886.4-201ENST00000623557 2502 ntBASIC16■□□□□ 0.15
SLC38A2Q96QD8 SCAF1-201ENST00000360565 4306 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SLC38A2Q96QD8 RASGRF1-202ENST00000419573 6294 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SLC38A2Q96QD8 PHKA1-202ENST00000373539 4476 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SLC38A2Q96QD8 SPG7-201ENST00000268704 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SLC38A2Q96QD8 ADAMTSL5-201ENST00000330475 2857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SLC38A2Q96QD8 SOCS2-212ENST00000622746 2881 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
SLC38A2Q96QD8 SLC10A3-204ENST00000393587 1862 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SLC38A2Q96QD8 CLUH-202ENST00000570628 5244 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SLC38A2Q96QD8 PCSK5-205ENST00000545128 9538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SLC38A2Q96QD8 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SLC38A2Q96QD8 TYMSOS-201ENST00000323813 844 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SLC38A2Q96QD8 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC16■□□□□ 0.15
SLC38A2Q96QD8 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SLC38A2Q96QD8 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SLC38A2Q96QD8 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SLC38A2Q96QD8 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC16■□□□□ 0.15
SLC38A2Q96QD8 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SLC38A2Q96QD8 AC099669.1-201ENST00000457331 456 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
SLC38A2Q96QD8 AC027682.5-201ENST00000567122 530 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
SLC38A2Q96QD8 AC002985.2-201ENST00000601106 957 ntTSL 4 BASIC16■□□□□ 0.15
SLC38A2Q96QD8 TTBK1-201ENST00000259750 6932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SLC38A2Q96QD8 MELTF-201ENST00000296350 3963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SLC38A2Q96QD8 DCST1-202ENST00000368419 2207 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SLC38A2Q96QD8 DMPK-204ENST00000447742 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SLC38A2Q96QD8 SLC27A2-201ENST00000267842 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SLC38A2Q96QD8 YTHDF3-212ENST00000621413 2370 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SLC38A2Q96QD8 DUOXA1-201ENST00000267803 1996 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SLC38A2Q96QD8 PPP1R26-205ENST00000605286 4744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
SLC38A2Q96QD8 PCNX3-201ENST00000355703 7105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SLC38A2Q96QD8 AMN1-201ENST00000281471 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SLC38A2Q96QD8 RNF121-203ENST00000393713 2132 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SLC38A2Q96QD8 SCAMP4-201ENST00000316097 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SLC38A2Q96QD8 IER3-202ENST00000376377 1350 ntBASIC16■□□□□ 0.15
SLC38A2Q96QD8 HRASLS5-206ENST00000540857 3032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SLC38A2Q96QD8 KRT8P47-201ENST00000604727 1398 ntBASIC16■□□□□ 0.15
SLC38A2Q96QD8 SYT3-202ENST00000593901 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SLC38A2Q96QD8 PRPF31-203ENST00000419967 2269 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SLC38A2Q96QD8 RHNO1-209ENST00000618250 2070 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SLC38A2Q96QD8 EXT2-202ENST00000358681 2997 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SLC38A2Q96QD8 TCAF2-203ENST00000425618 2448 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SLC38A2Q96QD8 MAP3K8-207ENST00000542547 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SLC38A2Q96QD8 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SLC38A2Q96QD8 DYDC2-202ENST00000372197 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SLC38A2Q96QD8 AKIRIN1-202ENST00000432648 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SLC38A2Q96QD8 GUCY1B3-206ENST00000507146 2709 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SLC38A2Q96QD8 LTV1-201ENST00000367576 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SLC38A2Q96QD8 ABHD14B-203ENST00000395008 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SLC38A2Q96QD8 PCDHGC3-205ENST00000617641 2346 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SLC38A2Q96QD8 KIZ-211ENST00000619574 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SLC38A2Q96QD8 SARS2-212ENST00000600042 1630 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SLC38A2Q96QD8 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SLC38A2Q96QD8 SLC22A11-203ENST00000377585 2124 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SLC38A2Q96QD8 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SLC38A2Q96QD8 SMIM19-202ENST00000416469 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SLC38A2Q96QD8 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SLC38A2Q96QD8 BAIAP2-205ENST00000435091 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SLC38A2Q96QD8 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
SLC38A2Q96QD8 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SLC38A2Q96QD8 GFOD2-207ENST00000602855 819 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SLC38A2Q96QD8 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SLC38A2Q96QD8 MBOAT1-201ENST00000324607 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SLC38A2Q96QD8 ANHX-201ENST00000419717 1765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SLC38A2Q96QD8 GPANK1-201ENST00000375893 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.6 ms