Protein–RNA interactions for Protein: Q96M27

PRRC1, Protein PRRC1, humanhuman

Predictions only

Length 445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRRC1Q96M27 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PRRC1Q96M27 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PRRC1Q96M27 WDR90-202ENST00000315764 1454 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PRRC1Q96M27 EGFEM1P-202ENST00000431685 1563 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
PRRC1Q96M27 CCNL2-203ENST00000408952 1857 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PRRC1Q96M27 GABRB2-202ENST00000353437 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PRRC1Q96M27 TJP2-202ENST00000377245 4611 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PRRC1Q96M27 ZYG11A-202ENST00000371532 3942 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PRRC1Q96M27 CCDC142-201ENST00000290418 2835 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PRRC1Q96M27 GUCY1A2-202ENST00000347596 2532 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PRRC1Q96M27 DNMT3A-205ENST00000402667 2300 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PRRC1Q96M27 PRRT4-205ENST00000489835 2313 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PRRC1Q96M27 PHYH-202ENST00000396913 1732 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PRRC1Q96M27 ADAMTS16-201ENST00000274181 4979 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PRRC1Q96M27 KDM8-202ENST00000441782 1612 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PRRC1Q96M27 SEMA5B-202ENST00000357599 4792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PRRC1Q96M27 ZNF804A-201ENST00000302277 4690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PRRC1Q96M27 KIFC3-203ENST00000445690 3379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PRRC1Q96M27 TACC3-201ENST00000313288 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PRRC1Q96M27 CBS-202ENST00000359624 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PRRC1Q96M27 CBSL-203ENST00000618024 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PRRC1Q96M27 YTHDF3-215ENST00000621957 2387 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PRRC1Q96M27 ELMO3-203ENST00000477898 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PRRC1Q96M27 TNK2-AS1-201ENST00000458180 2096 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PRRC1Q96M27 NFATC4-222ENST00000555590 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PRRC1Q96M27 FAM178B-204ENST00000490605 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PRRC1Q96M27 CAMK1D-201ENST00000378845 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PRRC1Q96M27 SLC52A1-202ENST00000424747 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PRRC1Q96M27 LINC00200-201ENST00000425630 2434 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PRRC1Q96M27 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PRRC1Q96M27 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PRRC1Q96M27 TSPY22P-201ENST00000427496 604 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
PRRC1Q96M27 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PRRC1Q96M27 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
PRRC1Q96M27 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
PRRC1Q96M27 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PRRC1Q96M27 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PRRC1Q96M27 FGFR1OP2-206ENST00000546072 956 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PRRC1Q96M27 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PRRC1Q96M27 STK25P1-201ENST00000585406 838 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
PRRC1Q96M27 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
PRRC1Q96M27 TLK2-201ENST00000326270 3512 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PRRC1Q96M27 DCAF12L2-201ENST00000360028 2599 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PRRC1Q96M27 PPP4R3A-208ENST00000555462 3236 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PRRC1Q96M27 TRPV4-207ENST00000541794 2475 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PRRC1Q96M27 LSM12-204ENST00000591247 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PRRC1Q96M27 FCHO1-201ENST00000252771 3118 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PRRC1Q96M27 TOM1-204ENST00000411850 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PRRC1Q96M27 LINC00094-205ENST00000603928 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PRRC1Q96M27 NRN1-201ENST00000244766 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PRRC1Q96M27 USP2-202ENST00000455332 2903 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PRRC1Q96M27 NECAB2-203ENST00000565691 2064 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PRRC1Q96M27 TRIM33-201ENST00000358465 8339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PRRC1Q96M27 TCAF2-203ENST00000425618 2448 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PRRC1Q96M27 ST3GAL6-214ENST00000483910 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PRRC1Q96M27 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PRRC1Q96M27 ADGRG3-202ENST00000450388 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PRRC1Q96M27 EWSR1-203ENST00000332050 2552 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PRRC1Q96M27 JMJD4-206ENST00000615711 2591 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PRRC1Q96M27 HSPA1A-201ENST00000375651 2483 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PRRC1Q96M27 SDCBP2-204ENST00000381812 1550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PRRC1Q96M27 GBGT1-204ENST00000372043 1935 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PRRC1Q96M27 RDH13-223ENST00000610356 1931 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PRRC1Q96M27 BRD2-201ENST00000374825 4894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PRRC1Q96M27 NKIRAS2-207ENST00000449471 1461 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PRRC1Q96M27 DIP2A-205ENST00000466639 2711 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PRRC1Q96M27 PIGX-202ENST00000392391 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PRRC1Q96M27 NSFL1C-202ENST00000353088 2611 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PRRC1Q96M27 ZNF423-206ENST00000563137 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PRRC1Q96M27 NAP1L4-201ENST00000380542 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PRRC1Q96M27 APBA2-207ENST00000558402 4031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PRRC1Q96M27 PFKP-202ENST00000381075 2769 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PRRC1Q96M27 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PRRC1Q96M27 LCE3D-201ENST00000368787 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PRRC1Q96M27 MHENCR-202ENST00000449500 801 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PRRC1Q96M27 GLI4-207ENST00000521682 1082 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PRRC1Q96M27 CD320-202ENST00000537716 1119 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PRRC1Q96M27 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PRRC1Q96M27 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PRRC1Q96M27 ZNF772-206ENST00000600175 737 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PRRC1Q96M27 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
PRRC1Q96M27 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PRRC1Q96M27 DPEP1-203ENST00000421184 1647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PRRC1Q96M27 ARFRP1-212ENST00000618838 1623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PRRC1Q96M27 CA12-203ENST00000422263 2556 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PRRC1Q96M27 LAT2-201ENST00000275635 1869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PRRC1Q96M27 SLC10A3-203ENST00000393586 1893 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PRRC1Q96M27 LIN54-204ENST00000505397 2742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PRRC1Q96M27 KCNJ8-201ENST00000240662 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PRRC1Q96M27 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PRRC1Q96M27 KRT8P10-201ENST00000450021 1447 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
PRRC1Q96M27 MSL1-206ENST00000579565 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PRRC1Q96M27 SMUG1-209ENST00000505128 2607 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PRRC1Q96M27 TRAF2-201ENST00000247668 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PRRC1Q96M27 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PRRC1Q96M27 GPD2-201ENST00000310454 6041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PRRC1Q96M27 EPB41-205ENST00000373797 2402 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PRRC1Q96M27 PRR18-201ENST00000322583 3084 ntAPPRIS P2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PRRC1Q96M27 PDE9A-203ENST00000335440 1728 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PRRC1Q96M27 TNIP1-220ENST00000610535 2726 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31 ms