Protein–RNA interactions for Protein: Q96L91

EP400, E1A-binding protein p400, humanhuman

Predictions only

Length 3,159 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EP400Q96L91 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
EP400Q96L91 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
EP400Q96L91 TEAD4-202ENST00000359864 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
EP400Q96L91 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
EP400Q96L91 C14orf93-204ENST00000397377 1776 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
EP400Q96L91 AL096828.2-201ENST00000567259 1965 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
EP400Q96L91 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
EP400Q96L91 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
EP400Q96L91 AL080243.2-201ENST00000418783 582 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
EP400Q96L91 AL121753.1-201ENST00000444717 529 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
EP400Q96L91 HOXB3-204ENST00000465120 943 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
EP400Q96L91 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
EP400Q96L91 RGN-202ENST00000352078 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
EP400Q96L91 AP3S2-216ENST00000617003 1561 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
EP400Q96L91 TDH-201ENST00000525246 1357 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
EP400Q96L91 RAD51C-215ENST00000583539 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
EP400Q96L91 ADCY1-202ENST00000432715 1693 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
EP400Q96L91 FANCA-203ENST00000389302 1641 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
EP400Q96L91 AKIP1-204ENST00000396648 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
EP400Q96L91 HMGA1P7-201ENST00000406908 502 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
EP400Q96L91 NECAP2-203ENST00000457722 935 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
EP400Q96L91 AC011495.1-201ENST00000498085 584 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
EP400Q96L91 OSGIN2-203ENST00000520659 801 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
EP400Q96L91 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
EP400Q96L91 TRIM17-201ENST00000295033 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
EP400Q96L91 TRIM17-204ENST00000366698 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
EP400Q96L91 RSRP1-201ENST00000243189 1502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
EP400Q96L91 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
EP400Q96L91 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
EP400Q96L91 BEND4-203ENST00000611697 1348 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
EP400Q96L91 DTD2-202ENST00000356180 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
EP400Q96L91 RASL12-203ENST00000434605 982 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
EP400Q96L91 SYNPR-202ENST00000450542 1004 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
EP400Q96L91 AC109479.1-201ENST00000519603 624 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
EP400Q96L91 COG4-212ENST00000564653 590 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
EP400Q96L91 FOXO1B-201ENST00000504678 1527 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
EP400Q96L91 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
EP400Q96L91 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
EP400Q96L91 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
EP400Q96L91 DFFA-201ENST00000377036 1403 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
EP400Q96L91 RPL28-204ENST00000431533 590 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
EP400Q96L91 AC084864.1-201ENST00000496217 305 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
EP400Q96L91 PIMREG-202ENST00000570337 891 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
EP400Q96L91 PIMREG-203ENST00000571373 1002 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
EP400Q96L91 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
EP400Q96L91 HPSE-207ENST00000513463 1458 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
EP400Q96L91 HOXA10-202ENST00000396344 1570 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
EP400Q96L91 SEPT8-205ENST00000378701 1817 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
EP400Q96L91 ITGA9-AS1-201ENST00000366441 895 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
EP400Q96L91 IGHV3-35-201ENST00000390617 366 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
EP400Q96L91 SPEG-202ENST00000396686 1086 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
EP400Q96L91 Z84485.1-202ENST00000499560 1230 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
EP400Q96L91 AP001107.3-201ENST00000534065 544 ntTSL 4 BASIC22.18■■□□□ 1.14
EP400Q96L91 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
EP400Q96L91 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
EP400Q96L91 MYO19-225ENST00000621344 1640 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
EP400Q96L91 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
EP400Q96L91 OCEL1-201ENST00000215061 1133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
EP400Q96L91 DSCR3-207ENST00000476950 937 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
EP400Q96L91 RAB30-AS1-202ENST00000526795 567 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
EP400Q96L91 AC018653.3-201ENST00000544657 749 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
EP400Q96L91 AC027307.2-201ENST00000591252 911 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
EP400Q96L91 FHAD1-205ENST00000375997 1459 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
EP400Q96L91 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
EP400Q96L91 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
EP400Q96L91 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
EP400Q96L91 TPM2-201ENST00000329305 1018 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
EP400Q96L91 SS18L1-202ENST00000370848 1238 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
EP400Q96L91 PSMB9-207ENST00000374859 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
EP400Q96L91 TM4SF19-204ENST00000454715 1061 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
EP400Q96L91 IL11RA-215ENST00000602473 1388 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
EP400Q96L91 SLC25A19-202ENST00000375261 1486 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
EP400Q96L91 NARF-206ENST00000457415 1668 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
EP400Q96L91 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
EP400Q96L91 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
EP400Q96L91 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
EP400Q96L91 ADAM15-207ENST00000368413 1901 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
EP400Q96L91 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
EP400Q96L91 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
EP400Q96L91 GRAMD4P3-201ENST00000621665 1669 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
EP400Q96L91 DMRT2-202ENST00000302441 1495 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
EP400Q96L91 AC087294.1-202ENST00000439136 487 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
EP400Q96L91 C8orf37-AS1-202ENST00000517655 562 ntTSL 4 BASIC22.17■■□□□ 1.14
EP400Q96L91 AC087294.1-201ENST00000580291 1152 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
EP400Q96L91 MIR4515-201ENST00000584082 81 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
EP400Q96L91 AC254562.3-201ENST00000626627 631 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
EP400Q96L91 C1orf159-205ENST00000421241 1841 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
EP400Q96L91 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
EP400Q96L91 ESR2-206ENST00000553796 1634 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
EP400Q96L91 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
EP400Q96L91 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
EP400Q96L91 GTDC1-219ENST00000542155 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
EP400Q96L91 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
EP400Q96L91 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
EP400Q96L91 ALOX15B-205ENST00000573359 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
EP400Q96L91 IFNL3-201ENST00000413851 656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
EP400Q96L91 AC091133.2-201ENST00000505903 428 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
EP400Q96L91 TADA3-202ENST00000343450 2554 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
EP400Q96L91 SDHA-213ENST00000510361 2148 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
EP400Q96L91 CTSW-201ENST00000307886 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.1 ms