Protein–RNA interactions for Protein: Q96C34

RUNDC1, RUN domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 613 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RUNDC1Q96C34 C6orf106-202ENST00000374023 4418 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RUNDC1Q96C34 SELENBP1-204ENST00000426705 1928 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
RUNDC1Q96C34 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RUNDC1Q96C34 LINC01972-201ENST00000422271 553 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
RUNDC1Q96C34 DHRS12-203ENST00000444610 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RUNDC1Q96C34 IDH3B-206ENST00000474315 1279 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RUNDC1Q96C34 PENK-208ENST00000523051 772 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
RUNDC1Q96C34 CNOT8-225ENST00000524105 904 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
RUNDC1Q96C34 AL121820.2-201ENST00000556301 279 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
RUNDC1Q96C34 NAA60-217ENST00000572942 1089 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
RUNDC1Q96C34 FTSJ1-201ENST00000019019 1986 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
RUNDC1Q96C34 MFSD2A-202ENST00000372811 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RUNDC1Q96C34 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RUNDC1Q96C34 BCL7A-203ENST00000538010 6247 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RUNDC1Q96C34 RAB11FIP2-201ENST00000355624 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RUNDC1Q96C34 TLE4-205ENST00000376544 4871 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RUNDC1Q96C34 TRAF2-201ENST00000247668 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
RUNDC1Q96C34 INPP4A-205ENST00000409851 3365 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RUNDC1Q96C34 AC093627.4-201ENST00000484550 5008 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
RUNDC1Q96C34 ANKRD23-202ENST00000331001 2455 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
RUNDC1Q96C34 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RUNDC1Q96C34 GOLGA7-202ENST00000405786 1903 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RUNDC1Q96C34 CDC25A-201ENST00000302506 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RUNDC1Q96C34 ATAD3A-207ENST00000536055 2332 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
RUNDC1Q96C34 LGALS12-205ENST00000425950 1789 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RUNDC1Q96C34 SAMD3-202ENST00000368134 2377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
RUNDC1Q96C34 HYAL3-205ENST00000450982 1402 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RUNDC1Q96C34 RSRC1-211ENST00000480820 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
RUNDC1Q96C34 CRTC3-208ENST00000560098 1421 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RUNDC1Q96C34 ARFRP1-212ENST00000618838 1623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
RUNDC1Q96C34 CAPN15-201ENST00000219611 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RUNDC1Q96C34 MAFK-201ENST00000343242 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RUNDC1Q96C34 B3GNT3-201ENST00000318683 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RUNDC1Q96C34 KIAA0895-208ENST00000440378 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RUNDC1Q96C34 INIP-202ENST00000374236 874 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
RUNDC1Q96C34 SERF1B-202ENST00000380751 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RUNDC1Q96C34 PTCHD3P3-201ENST00000403073 906 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
RUNDC1Q96C34 HFE-210ENST00000470149 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RUNDC1Q96C34 AC116612.1-201ENST00000557144 562 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
RUNDC1Q96C34 AC009061.1-201ENST00000567261 475 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
RUNDC1Q96C34 PRSS8-206ENST00000568261 1214 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
RUNDC1Q96C34 GABARAP-204ENST00000571253 837 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
RUNDC1Q96C34 AC116407.3-201ENST00000623905 1129 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
RUNDC1Q96C34 ATP6AP2-220ENST00000636970 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
RUNDC1Q96C34 FNBP1-203ENST00000443566 5227 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RUNDC1Q96C34 PHLDA1-202ENST00000602540 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RUNDC1Q96C34 PRRT4-205ENST00000489835 2313 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RUNDC1Q96C34 HDAC10-205ENST00000448072 2133 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
RUNDC1Q96C34 CTSB-202ENST00000353047 3875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RUNDC1Q96C34 B4GALT2-202ENST00000356836 2629 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
RUNDC1Q96C34 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RUNDC1Q96C34 AC243591.1-201ENST00000452967 1364 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
RUNDC1Q96C34 B4GALT4-216ENST00000483209 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RUNDC1Q96C34 LMCD1-204ENST00000426878 1431 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
RUNDC1Q96C34 TMEM50B-210ENST00000542230 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RUNDC1Q96C34 FGFR1-203ENST00000341462 6054 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
RUNDC1Q96C34 SYBU-201ENST00000276646 2870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RUNDC1Q96C34 PPIB-201ENST00000300026 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RUNDC1Q96C34 TMEM59-202ENST00000371337 600 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
RUNDC1Q96C34 LYPLA2-204ENST00000374505 907 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
RUNDC1Q96C34 NABP1-203ENST00000409510 843 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
RUNDC1Q96C34 NDUFB2-208ENST00000471136 499 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
RUNDC1Q96C34 NDUFB2-209ENST00000472695 503 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
RUNDC1Q96C34 AC136632.2-201ENST00000512891 861 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
RUNDC1Q96C34 RPS29-206ENST00000557111 488 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
RUNDC1Q96C34 AL356488.2-201ENST00000602755 427 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
RUNDC1Q96C34 GPX4-212ENST00000616066 924 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
RUNDC1Q96C34 PIP5K1C-205ENST00000589578 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RUNDC1Q96C34 KCNJ10-208ENST00000639408 1546 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
RUNDC1Q96C34 POMT2-201ENST00000261534 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RUNDC1Q96C34 ALDH3B1-204ENST00000614849 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RUNDC1Q96C34 TRIM11-202ENST00000366699 2511 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
RUNDC1Q96C34 FZD10-201ENST00000229030 3281 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
RUNDC1Q96C34 FZD10-202ENST00000539839 3282 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
RUNDC1Q96C34 ZNF414-202ENST00000393927 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RUNDC1Q96C34 LINC00029-201ENST00000370341 1631 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RUNDC1Q96C34 PODXL-202ENST00000378555 2105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RUNDC1Q96C34 KRT85-202ENST00000544265 1387 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
RUNDC1Q96C34 TMEM183A-201ENST00000367242 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RUNDC1Q96C34 MYH7B-201ENST00000262873 6293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RUNDC1Q96C34 PPP1R16A-202ENST00000435887 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RUNDC1Q96C34 STIM2-202ENST00000465503 3613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RUNDC1Q96C34 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RUNDC1Q96C34 NOL4L-205ENST00000375678 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
RUNDC1Q96C34 DAGLB-202ENST00000425398 2044 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
RUNDC1Q96C34 AC005920.1-201ENST00000501718 2054 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
RUNDC1Q96C34 AL109955.1-201ENST00000417346 1540 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
RUNDC1Q96C34 PFKL-201ENST00000349048 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RUNDC1Q96C34 TM2D1-201ENST00000294613 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RUNDC1Q96C34 TMEM89-201ENST00000330862 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RUNDC1Q96C34 TM2D1-204ENST00000371180 1248 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
RUNDC1Q96C34 LINC01237-203ENST00000430555 843 ntTSL 4 BASIC22.74■■□□□ 1.23
RUNDC1Q96C34 ITGB1BP1-205ENST00000456913 1043 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
RUNDC1Q96C34 ITGB1BP1-216ENST00000488451 874 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
RUNDC1Q96C34 UBE2Q2P1-205ENST00000559871 534 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
RUNDC1Q96C34 ADAM10-217ENST00000561288 583 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
RUNDC1Q96C34 LITAF-211ENST00000572255 516 ntTSL 4 BASIC22.74■■□□□ 1.23
RUNDC1Q96C34 LITAF-215ENST00000574763 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
RUNDC1Q96C34 TUBB4A-209ENST00000598006 565 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
RUNDC1Q96C34 TM2D1-212ENST00000606498 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.3 ms