Protein–RNA interactions for Protein: Q969F1

GTF3C6, General transcription factor 3C polypeptide 6, humanhuman

Predictions only

Length 213 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF3C6Q969F1 POLR3E-203ENST00000418581 2529 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
GTF3C6Q969F1 RABGAP1L-204ENST00000357444 2605 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
GTF3C6Q969F1 PAK4-202ENST00000358301 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
GTF3C6Q969F1 LTBR-207ENST00000539925 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
GTF3C6Q969F1 TMEM145-201ENST00000301204 1768 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
GTF3C6Q969F1 GPBAR1-201ENST00000479077 1869 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
GTF3C6Q969F1 FOXP1-210ENST00000484350 1996 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
GTF3C6Q969F1 ALDH3B1-208ENST00000617288 2078 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
GTF3C6Q969F1 CCDC177-201ENST00000599174 4131 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
GTF3C6Q969F1 ZDHHC2-201ENST00000262096 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
GTF3C6Q969F1 NSMF-204ENST00000371473 3556 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
GTF3C6Q969F1 CRB3-203ENST00000598494 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
GTF3C6Q969F1 HAPLN3-204ENST00000562889 1547 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
GTF3C6Q969F1 AC148477.5-201ENST00000625164 1645 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
GTF3C6Q969F1 WBP2-201ENST00000254806 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
GTF3C6Q969F1 SELENBP1-204ENST00000426705 1928 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
GTF3C6Q969F1 ARHGEF28-204ENST00000437974 5792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
GTF3C6Q969F1 NDRG2-204ENST00000360463 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
GTF3C6Q969F1 AC005915.1-201ENST00000624912 2018 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
GTF3C6Q969F1 AC105020.1-201ENST00000435356 2205 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
GTF3C6Q969F1 WIPF1-201ENST00000272746 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
GTF3C6Q969F1 DACH1-202ENST00000613252 5233 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
GTF3C6Q969F1 ENC1-201ENST00000302351 5520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
GTF3C6Q969F1 SYDE2-202ENST00000341460 5512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
GTF3C6Q969F1 SEPHS1-201ENST00000327347 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
GTF3C6Q969F1 BLOC1S5-202ENST00000397457 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
GTF3C6Q969F1 DCP1B-201ENST00000280665 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
GTF3C6Q969F1 C1orf56-201ENST00000368926 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
GTF3C6Q969F1 SCOC-211ENST00000614192 1959 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
GTF3C6Q969F1 CD300A-202ENST00000360141 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
GTF3C6Q969F1 TRAK1-209ENST00000487159 5536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
GTF3C6Q969F1 NDUFV1-223ENST00000532303 1493 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
GTF3C6Q969F1 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
GTF3C6Q969F1 HCCS-202ENST00000380762 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
GTF3C6Q969F1 KRTAP5-6-201ENST00000382160 561 ntAPPRIS P1 BASIC20.27■□□□□ 0.84
GTF3C6Q969F1 NAT6-202ENST00000417393 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
GTF3C6Q969F1 POM121L3P-201ENST00000419331 1163 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
GTF3C6Q969F1 AL096828.1-201ENST00000423020 542 ntTSL 4 BASIC20.27■□□□□ 0.84
GTF3C6Q969F1 SBDSP1-202ENST00000423945 618 ntTSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
GTF3C6Q969F1 AL391650.1-205ENST00000433939 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
GTF3C6Q969F1 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
GTF3C6Q969F1 BPHL-208ENST00000434640 1186 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
GTF3C6Q969F1 RABL2B-209ENST00000435118 1126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
GTF3C6Q969F1 AC069368.1-202ENST00000437723 750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
GTF3C6Q969F1 B4GALT1-AS1-202ENST00000442432 843 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
GTF3C6Q969F1 RNF146-204ENST00000476956 884 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
GTF3C6Q969F1 AC106782.2-201ENST00000563252 992 ntTSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
GTF3C6Q969F1 FAM57A-205ENST00000572018 373 ntTSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
GTF3C6Q969F1 C19orf25-210ENST00000591027 574 ntTSL 4 BASIC20.27■□□□□ 0.84
GTF3C6Q969F1 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
GTF3C6Q969F1 CCNC-219ENST00000627680 896 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
GTF3C6Q969F1 AP000867.4-201ENST00000641616 219 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
GTF3C6Q969F1 AIFM3-203ENST00000405089 2333 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
GTF3C6Q969F1 AGGF1P2-201ENST00000426656 2106 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
GTF3C6Q969F1 NPRL2-201ENST00000232501 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
GTF3C6Q969F1 P2RY6-204ENST00000393592 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
GTF3C6Q969F1 TMEM25-225ENST00000533102 1410 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
GTF3C6Q969F1 EHMT1-203ENST00000460843 5137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.83
GTF3C6Q969F1 ISLR2-201ENST00000361742 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
GTF3C6Q969F1 AL079303.2-201ENST00000555107 2613 ntTSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
GTF3C6Q969F1 AC084018.2-201ENST00000613093 2607 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
GTF3C6Q969F1 SPTBN4-202ENST00000352632 8676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
GTF3C6Q969F1 DPP6-202ENST00000377770 3710 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
GTF3C6Q969F1 CSF3-202ENST00000331769 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
GTF3C6Q969F1 MRTO4-201ENST00000330263 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
GTF3C6Q969F1 SLC12A2-208ENST00000628403 3617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
GTF3C6Q969F1 TFAP2A-AS1-201ENST00000420777 1575 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
GTF3C6Q969F1 PCDHGC5-202ENST00000610789 2763 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
GTF3C6Q969F1 UBR3-203ENST00000418381 7951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
GTF3C6Q969F1 FAM237A-203ENST00000543490 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
GTF3C6Q969F1 ARMC10P1-201ENST00000313754 855 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
GTF3C6Q969F1 QRFP-201ENST00000343079 411 ntAPPRIS P1 BASIC20.26■□□□□ 0.83
GTF3C6Q969F1 ZHX1-C8orf76-201ENST00000357082 1257 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
GTF3C6Q969F1 FUOM-202ENST00000368551 628 ntTSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
GTF3C6Q969F1 INSL3-202ENST00000379695 899 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
GTF3C6Q969F1 HDAC11-204ENST00000404040 967 ntTSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
GTF3C6Q969F1 CYHR1-203ENST00000424149 1162 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
GTF3C6Q969F1 AC124947.2-201ENST00000547118 1133 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
GTF3C6Q969F1 AC008105.3-202ENST00000585471 1077 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
GTF3C6Q969F1 AC087289.1-201ENST00000586808 890 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
GTF3C6Q969F1 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
GTF3C6Q969F1 TNFRSF14-AS1-205ENST00000449660 1629 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
GTF3C6Q969F1 RHBDF1-201ENST00000262316 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
GTF3C6Q969F1 L1CAM-205ENST00000370060 5113 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
GTF3C6Q969F1 GDPD5-214ENST00000533784 2441 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
GTF3C6Q969F1 PALM-201ENST00000264560 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC20.26■□□□□ 0.83
GTF3C6Q969F1 HASPIN-201ENST00000325418 2797 ntAPPRIS P1 BASIC20.26■□□□□ 0.83
GTF3C6Q969F1 AGXT-201ENST00000307503 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
GTF3C6Q969F1 ANKMY1-202ENST00000361678 2499 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
GTF3C6Q969F1 SGCE-206ENST00000445866 1666 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
GTF3C6Q969F1 TNFSF13-205ENST00000396545 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
GTF3C6Q969F1 AL162311.3-201ENST00000555918 2867 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
GTF3C6Q969F1 AL357673.1-201ENST00000637610 2542 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
GTF3C6Q969F1 DNAJC28-203ENST00000402202 1480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
GTF3C6Q969F1 NECAB2-203ENST00000565691 2064 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
GTF3C6Q969F1 CLDN6-202ENST00000396925 1739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
GTF3C6Q969F1 ADM5-201ENST00000420022 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
GTF3C6Q969F1 REEP1-208ENST00000538924 1702 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
GTF3C6Q969F1 PLBD2-201ENST00000280800 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
GTF3C6Q969F1 DPEP1-203ENST00000421184 1647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.2 ms